39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0063 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0063  hypothetical protein  100 
 
 
104 aa  193  7e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00731  hypothetical protein  90.1 
 
 
101 aa  180  7e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00721  hypothetical protein  92.08 
 
 
101 aa  179  9.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0420  hypothetical protein  53.76 
 
 
110 aa  110  6e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01251  hypothetical protein  54.26 
 
 
99 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0502319  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1424  hypothetical protein  53.19 
 
 
99 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03211  hypothetical protein  51.09 
 
 
119 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.97846 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00691  hypothetical protein  49.45 
 
 
102 aa  103  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.82447 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00701  hypothetical protein  85.96 
 
 
57 aa  98.2  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.353253  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2017  hypothetical protein  49.41 
 
 
97 aa  96.3  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.314161 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4433  protein of unknown function YGGT  51.28 
 
 
96 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4497  protein of unknown function YGGT  51.28 
 
 
96 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3708  protein of unknown function YGGT  41.49 
 
 
94 aa  94.4  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2260  hypothetical protein  59.7 
 
 
109 aa  94  7e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.48974  normal  0.571273 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3030  protein of unknown function YGGT  47.19 
 
 
95 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_10668  predicted protein  47.56 
 
 
82 aa  90.5  7e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.605369 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0052  hypothetical protein  50 
 
 
97 aa  87  7e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0517  hypothetical protein  48.78 
 
 
97 aa  84.7  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0567252  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1481  protein of unknown function YGGT  44.83 
 
 
94 aa  84  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14996  predicted protein  38.1 
 
 
85 aa  77.4  0.00000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.113245  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09931  hypothetical protein  33.77 
 
 
92 aa  50.4  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09511  hypothetical protein  33.77 
 
 
92 aa  50.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.545335  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0890  hypothetical protein  33.77 
 
 
92 aa  50.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08491  integral membrane protein  38.33 
 
 
102 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.321113  hitchhiker  0.00153658 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0477  hypothetical protein  30.61 
 
 
99 aa  48.9  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09491  hypothetical protein  32.47 
 
 
92 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.291422  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2189  protein of unknown function YGGT  34.78 
 
 
96 aa  47.4  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.318304  normal  0.111036 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09691  hypothetical protein  30.26 
 
 
100 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0755134  normal  0.205345 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0297  hypothetical protein  30.26 
 
 
100 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.475908  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0994  hypothetical protein  33.33 
 
 
92 aa  46.2  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0252519  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15401  hypothetical protein  30.14 
 
 
99 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.393994 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4335  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.680603  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3109  hypothetical protein  40.82 
 
 
92 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264306  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1433  hypothetical protein  32.97 
 
 
98 aa  44.3  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.116879 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41246  predicted protein  30.77 
 
 
91 aa  44.3  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0509332  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3329  protein of unknown function YGGT  27.27 
 
 
98 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1066  hypothetical protein  35.71 
 
 
98 aa  42.7  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1027  protein of unknown function YGGT  47.92 
 
 
98 aa  40.8  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1093  protein of unknown function YGGT  47.92 
 
 
98 aa  40.8  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.869762  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>