201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0477 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0477  hypothetical protein  100 
 
 
99 aa  191  3e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2189  protein of unknown function YGGT  60.24 
 
 
96 aa  94.4  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.318304  normal  0.111036 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3109  hypothetical protein  54.76 
 
 
92 aa  83.6  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264306  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0297  hypothetical protein  50 
 
 
100 aa  83.2  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.475908  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09691  hypothetical protein  50 
 
 
100 aa  83.2  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0755134  normal  0.205345 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0994  hypothetical protein  52.69 
 
 
92 aa  81.6  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0252519  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08491  integral membrane protein  51.14 
 
 
102 aa  82  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.321113  hitchhiker  0.00153658 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1433  hypothetical protein  52.17 
 
 
98 aa  78.6  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.116879 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15401  hypothetical protein  46.32 
 
 
99 aa  78.2  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.393994 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4335  protein of unknown function YGGT  58.62 
 
 
97 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.680603  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_10630  predicted protein  60.32 
 
 
76 aa  77  0.00000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1906  protein of unknown function YGGT  42.68 
 
 
90 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36034  predicted protein  44.59 
 
 
237 aa  75.1  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.119025  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3329  protein of unknown function YGGT  51.14 
 
 
98 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1036  protein of unknown function YGGT  45.57 
 
 
89 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000119033  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0890  hypothetical protein  46.84 
 
 
92 aa  72.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09511  hypothetical protein  46.84 
 
 
92 aa  72.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.545335  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09931  hypothetical protein  46.84 
 
 
92 aa  72.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09491  hypothetical protein  46.84 
 
 
92 aa  73.2  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.291422  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0714  protein of unknown function YGGT  43.75 
 
 
84 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.674624  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1018  protein of unknown function YGGT  46.58 
 
 
85 aa  72  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1411  protein of unknown function YGGT  39.29 
 
 
84 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000759704  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3999  ylmG protein  50.75 
 
 
87 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000449706  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1242  ylmG protein  48.57 
 
 
87 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000199997  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3943  ylmG protein  44.3 
 
 
87 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00794391  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3749  ylmG protein  44.3 
 
 
87 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0442014  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3640  hypothetical protein  44.3 
 
 
87 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138235  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3657  hypothetical protein  44.3 
 
 
87 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.516535  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4037  hypothetical protein  44.3 
 
 
87 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000926366  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3912  ylmG protein  44.3 
 
 
87 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000638636 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3950  ylmG protein  44.3 
 
 
87 aa  67  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361919  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1066  hypothetical protein  58.33 
 
 
98 aa  67  0.00000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1199  cell division membrane protein  36.9 
 
 
98 aa  66.6  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1085  protein of unknown function YGGT  40 
 
 
87 aa  63.9  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000150484  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2547  protein of unknown function YGGT  40 
 
 
87 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167983  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08930  YGGT family protein  45.21 
 
 
84 aa  63.5  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.384516  hitchhiker  0.0000000251444 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2082  protein of unknown function YGGT  46.88 
 
 
86 aa  62.4  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0261764  hitchhiker  0.000000000000996106 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3725  protein of unknown function YGGT  44.29 
 
 
87 aa  61.6  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00556578  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0818  protein of unknown function YGGT  47.56 
 
 
187 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0807  protein of unknown function YGGT  47.56 
 
 
187 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.968375  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0493  protein of unknown function YGGT  37.93 
 
 
92 aa  59.7  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.197871  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3113  protein of unknown function YGGT  46.43 
 
 
187 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.143528  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1522  hypothetical protein  47.56 
 
 
187 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153866  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0880  hypothetical protein  45.24 
 
 
187 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123554  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0595  protein of unknown function YGGT  32.53 
 
 
86 aa  58.5  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102021  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2521  protein of unknown function YGGT  47.54 
 
 
91 aa  58.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3585  protein of unknown function YGGT  47.54 
 
 
91 aa  58.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0833218  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3111  hypothetical protein  46.34 
 
 
213 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2585  hypothetical protein  46.34 
 
 
213 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3028  YGGT family membrane protein  46.34 
 
 
213 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.952589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3083  YGGT family membrane protein  46.34 
 
 
213 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2158  hypothetical protein  47.56 
 
 
187 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.101701  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0534  protein of unknown function YGGT  32.14 
 
 
194 aa  57.8  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0751  YGGT family membrane protein  47.56 
 
 
187 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2028  YGGT family membrane protein  47.56 
 
 
187 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.835593  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2449  protein of unknown function YGGT  48.05 
 
 
187 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.550896  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0469  protein of unknown function YGGT  49.33 
 
 
187 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0948  protein of unknown function YGGT  49.33 
 
 
187 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.199708  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0607  protein of unknown function YGGT  42.86 
 
 
187 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0910  protein of unknown function YGGT  49.33 
 
 
187 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0755  ylmG protein  42.62 
 
 
96 aa  55.5  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.298424  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3842  protein of unknown function YGGT  42.86 
 
 
84 aa  55.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4049  protein of unknown function YGGT  48 
 
 
187 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41246  predicted protein  56 
 
 
91 aa  55.5  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0509332  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1141  cell division membrane protein  40.98 
 
 
64 aa  55.1  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5048  YGGT family protein  43.55 
 
 
196 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710638  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0475  hypothetical protein  43.55 
 
 
196 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2479  protein of unknown function YGGT  41.18 
 
 
182 aa  54.7  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.619107  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5096  hypothetical protein  44.12 
 
 
196 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109817  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3056  protein of unknown function YGGT  42.42 
 
 
196 aa  53.5  0.0000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.502077  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0369  protein of unknown function YGGT  40.85 
 
 
196 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758714  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3355  hypothetical protein  51.92 
 
 
182 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5321  hypothetical protein  34.52 
 
 
196 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5146  protein of unknown function YGGT  42.65 
 
 
196 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.605809  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3708  protein of unknown function YGGT  46.77 
 
 
94 aa  53.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1191  protein of unknown function YGGT  51.92 
 
 
182 aa  52.8  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0253033  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0339  protein of unknown function YGGT  37.14 
 
 
192 aa  53.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1192  protein of unknown function YGGT  50.94 
 
 
182 aa  52.8  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0499744  normal  0.653735 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4969  protein of unknown function YGGT  42.65 
 
 
196 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3665  YGGT family protein  40.98 
 
 
181 aa  52.8  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.688821  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00691  hypothetical protein  36.25 
 
 
102 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.82447 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03300  hypothetical protein  44.44 
 
 
178 aa  52  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3042  protein of unknown function YGGT  48.08 
 
 
182 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000245532  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3185  protein of unknown function YGGT  48.08 
 
 
182 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000491839  normal  0.0847291 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1481  protein of unknown function YGGT  38.81 
 
 
94 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1262  protein of unknown function YGGT  50 
 
 
182 aa  51.6  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0091593  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3655  protein of unknown function YGGT  39.29 
 
 
199 aa  51.6  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1336  protein of unknown function YGGT  48.08 
 
 
182 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000680586  hitchhiker  0.0000219253 
 
 
-
 
NC_002620  TC0014  hypothetical protein  32.35 
 
 
98 aa  51.6  0.000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3027  protein of unknown function YGGT  48.08 
 
 
182 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000050243  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1237  protein of unknown function YGGT  35.71 
 
 
89 aa  51.6  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.371486  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1230  protein of unknown function YGGT  40.91 
 
 
182 aa  51.6  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000825612  normal  0.409234 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0861  hypothetical protein  35.9 
 
 
88 aa  50.8  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00343102  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0295  protein of unknown function YGGT  42.55 
 
 
78 aa  51.2  0.000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315255  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03060  hypothetical protein  36.25 
 
 
197 aa  50.4  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479202  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0053  protein of unknown function YGGT  39.24 
 
 
99 aa  50.4  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.941254 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3296  YGGT family protein  35.96 
 
 
188 aa  50.1  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0547  protein of unknown function YGGT  37.5 
 
 
180 aa  50.4  0.000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3094  YGGT family protein  35.96 
 
 
188 aa  50.1  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000274597 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05130  hypothetical protein  36.25 
 
 
197 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.409368  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>