46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0014 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0014  hypothetical protein  100 
 
 
98 aa  195  2.0000000000000003e-49  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3749  ylmG protein  39.39 
 
 
87 aa  60.5  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0442014  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3640  hypothetical protein  39.39 
 
 
87 aa  60.5  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138235  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3657  hypothetical protein  39.39 
 
 
87 aa  60.5  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.516535  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3912  ylmG protein  39.39 
 
 
87 aa  60.5  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000638636 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4037  hypothetical protein  39.39 
 
 
87 aa  60.5  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000926366  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3950  ylmG protein  39.39 
 
 
87 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361919  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1242  ylmG protein  36.92 
 
 
87 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000199997  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3725  protein of unknown function YGGT  37.88 
 
 
87 aa  58.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00556578  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3999  ylmG protein  36.36 
 
 
87 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000449706  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3943  ylmG protein  37.88 
 
 
87 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00794391  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1036  protein of unknown function YGGT  36.92 
 
 
89 aa  56.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000119033  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1199  cell division membrane protein  39.39 
 
 
98 aa  55.8  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1906  protein of unknown function YGGT  33.85 
 
 
90 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08930  YGGT family protein  38.82 
 
 
84 aa  53.5  0.0000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.384516  hitchhiker  0.0000000251444 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2547  protein of unknown function YGGT  37.1 
 
 
87 aa  52.8  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167983  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1018  protein of unknown function YGGT  35 
 
 
85 aa  52.8  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2082  protein of unknown function YGGT  37.5 
 
 
86 aa  52  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0261764  hitchhiker  0.000000000000996106 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0477  hypothetical protein  32.35 
 
 
99 aa  51.6  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1411  protein of unknown function YGGT  35.53 
 
 
84 aa  51.6  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000759704  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2189  protein of unknown function YGGT  39.13 
 
 
96 aa  50.8  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.318304  normal  0.111036 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0755  ylmG protein  34.25 
 
 
96 aa  50.4  0.000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.298424  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0994  hypothetical protein  36.23 
 
 
92 aa  50.1  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0252519  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0595  protein of unknown function YGGT  39.13 
 
 
86 aa  49.7  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102021  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1490  cell division membrane protein  36.51 
 
 
87 aa  49.7  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3109  hypothetical protein  35.82 
 
 
92 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264306  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1412  protein of unknown function YGGT  34.25 
 
 
186 aa  47  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0154  protein of unknown function YGGT  32.26 
 
 
98 aa  47  0.00008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00105127  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0714  protein of unknown function YGGT  37.33 
 
 
84 aa  47  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.674624  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0947  protein of unknown function YGGT  38.18 
 
 
192 aa  46.6  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.618723  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0493  protein of unknown function YGGT  38.24 
 
 
92 aa  47  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.197871  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09931  hypothetical protein  34.18 
 
 
92 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09491  hypothetical protein  32.91 
 
 
92 aa  44.3  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.291422  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09511  hypothetical protein  32.91 
 
 
92 aa  44.3  0.0005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.545335  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0890  hypothetical protein  32.91 
 
 
92 aa  44.3  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08491  integral membrane protein  32.5 
 
 
102 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.321113  hitchhiker  0.00153658 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0295  protein of unknown function YGGT  28.57 
 
 
78 aa  43.1  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315255  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15401  hypothetical protein  34.29 
 
 
99 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.393994 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5048  YGGT family protein  31.65 
 
 
196 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710638  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0475  hypothetical protein  31.65 
 
 
196 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1085  protein of unknown function YGGT  31.51 
 
 
87 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000150484  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1433  hypothetical protein  34.78 
 
 
98 aa  42  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.116879 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1540  protein of unknown function YGGT  31.25 
 
 
96 aa  40.8  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.180759  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2785  hypothetical protein  31.4 
 
 
193 aa  40.4  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.555098  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3056  protein of unknown function YGGT  24.64 
 
 
196 aa  40  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.502077  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3329  protein of unknown function YGGT  33.82 
 
 
98 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>