39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1540 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1540  protein of unknown function YGGT  100 
 
 		 96 aa  181  2.0000000000000003e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.180759  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0154  protein of unknown function YGGT  48.98 
 
 		 98 aa  83.6  8e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00105127  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1027  protein of unknown function YGGT  44.9 
 
 		 98 aa  79  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1093  protein of unknown function YGGT  44.9 
 
 		 98 aa  79  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.869762  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1355  protein of unknown function YGGT  45.83 
 
 		 100 aa  72.8  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1166  protein of unknown function YGGT  34.34 
 
 		 105 aa  61.2  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866748  hitchhiker  0.00575832 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1165  protein of unknown function YGGT  38.38 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000835508  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0866  YGGT family protein  29.29 
 
 		 104 aa  53.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0149  protein of unknown function YGGT  27 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.041214 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3054  protein of unknown function YGGT  31.63 
 
 		 99 aa  45.1  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.649035  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0861  hypothetical protein  31.4 
 
 		 88 aa  45.1  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00343102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1212  protein of unknown function YGGT  35.48 
 
 		 182 aa  44.7  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0177861 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2973  protein of unknown function YGGT  36.47 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3527  hypothetical protein  39.53 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12787  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1658  integral membrane protein  40 
 
 		 185 aa  42.4  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000025742  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1412  protein of unknown function YGGT  42.59 
 
 		 186 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0762  protein of unknown function YGGT  45.45 
 
 		 188 aa  41.6  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000437553 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0743  protein of unknown function YGGT  45.45 
 
 		 188 aa  41.6  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3094  YGGT family protein  45.45 
 
 		 188 aa  41.6  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000274597 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3384  YGGT family protein  45.45 
 
 		 188 aa  41.6  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4255  YGGT family protein  45.45 
 
 		 188 aa  41.6  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.809329  normal  0.660406 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3296  YGGT family protein  45.45 
 
 		 188 aa  41.6  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02745  hypothetical protein  45.45 
 
 		 188 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.090594  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3112  YGGT family protein  45.45 
 
 		 188 aa  41.6  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02782  predicted inner membrane protein  45.45 
 
 		 188 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.104199  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02073  hypothetical protein  33.85 
 
 		 183 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.616502 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0339  protein of unknown function YGGT  30.95 
 
 		 192 aa  40.8  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0607  protein of unknown function YGGT  34.21 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0014  hypothetical protein  31.25 
 
 		 98 aa  40.8  0.007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2870  protein of unknown function YGGT  31.43 
 
 		 101 aa  40.4  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388606 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3725  protein of unknown function YGGT  45.45 
 
 		 87 aa  40.4  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00556578  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0478  hypothetical protein  34.21 
 
 		 96 aa  40.4  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03300  hypothetical protein  36.56 
 
 		 178 aa  40.4  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1906  protein of unknown function YGGT  36.67 
 
 		 90 aa  40.4  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0439  yggt family protein  41.18 
 
 		 103 aa  40  0.01  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000131375  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0595  protein of unknown function YGGT  32.91 
 
 		 86 aa  40  0.01  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102021  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3042  hypothetical protein  34.67 
 
 		 180 aa  40  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.390306  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3943  ylmG protein  43.64 
 
 		 87 aa  40  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00794391  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1242  ylmG protein  43.64 
 
 		 87 aa  40  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000199997  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>