61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0595 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0595  protein of unknown function YGGT  100 
 
 
86 aa  170  5.999999999999999e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102021  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1036  protein of unknown function YGGT  44.74 
 
 
89 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000119033  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1490  cell division membrane protein  43.9 
 
 
87 aa  72.8  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1199  cell division membrane protein  38.96 
 
 
98 aa  68.6  0.00000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1906  protein of unknown function YGGT  37.66 
 
 
90 aa  63.5  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1242  ylmG protein  36 
 
 
87 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000199997  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3950  ylmG protein  36.62 
 
 
87 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361919  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3912  ylmG protein  36.62 
 
 
87 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000638636 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4037  hypothetical protein  36.62 
 
 
87 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000926366  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3749  ylmG protein  36.62 
 
 
87 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0442014  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3640  hypothetical protein  36.62 
 
 
87 aa  61.2  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138235  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3657  hypothetical protein  36.62 
 
 
87 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.516535  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3725  protein of unknown function YGGT  36.62 
 
 
87 aa  60.5  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00556578  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3999  ylmG protein  36.11 
 
 
87 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000449706  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2547  protein of unknown function YGGT  36.71 
 
 
87 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167983  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0477  hypothetical protein  32.53 
 
 
99 aa  58.5  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3943  ylmG protein  35.21 
 
 
87 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00794391  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0755  ylmG protein  36.84 
 
 
96 aa  55.1  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.298424  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2082  protein of unknown function YGGT  39.71 
 
 
86 aa  52.4  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0261764  hitchhiker  0.000000000000996106 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0493  protein of unknown function YGGT  39.47 
 
 
92 aa  52.4  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.197871  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2189  protein of unknown function YGGT  34.67 
 
 
96 aa  49.7  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.318304  normal  0.111036 
 
 
-
 
NC_002620  TC0014  hypothetical protein  39.13 
 
 
98 aa  49.7  0.00001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2059  hypothetical protein  34.33 
 
 
91 aa  48.9  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15401  hypothetical protein  34.18 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.393994 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09420  YGGT family protein  36.51 
 
 
86 aa  47.8  0.00005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0374287  normal  0.111305 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08930  YGGT family protein  34.67 
 
 
84 aa  47  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.384516  hitchhiker  0.0000000251444 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1433  hypothetical protein  36.25 
 
 
98 aa  46.6  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.116879 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1141  cell division membrane protein  48.28 
 
 
64 aa  46.6  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1412  protein of unknown function YGGT  40.62 
 
 
186 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1411  protein of unknown function YGGT  33.78 
 
 
84 aa  43.5  0.0009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000759704  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4335  protein of unknown function YGGT  32.91 
 
 
97 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.680603  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1249  hypothetical protein  34.72 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000234986  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3329  protein of unknown function YGGT  32.39 
 
 
98 aa  42.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1274  hypothetical protein  34.72 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000722021  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1018  protein of unknown function YGGT  32.86 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08491  integral membrane protein  30 
 
 
102 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.321113  hitchhiker  0.00153658 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4038  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.5468  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1838  hypothetical protein  30.43 
 
 
189 aa  42  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000231673  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3358  protein of unknown function YGGT  35.38 
 
 
188 aa  41.6  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0016989 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02745  hypothetical protein  35.38 
 
 
188 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.090594  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0743  protein of unknown function YGGT  35.38 
 
 
188 aa  41.6  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4255  YGGT family protein  35.38 
 
 
188 aa  41.6  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.809329  normal  0.660406 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02782  predicted inner membrane protein  35.38 
 
 
188 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.104199  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3527  hypothetical protein  32.5 
 
 
99 aa  41.2  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12787  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3112  YGGT family protein  35.38 
 
 
188 aa  41.6  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3296  YGGT family protein  35.38 
 
 
188 aa  41.6  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0762  protein of unknown function YGGT  35.38 
 
 
188 aa  41.6  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000437553 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3094  YGGT family protein  35.38 
 
 
188 aa  41.6  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000274597 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3384  YGGT family protein  35.38 
 
 
188 aa  41.6  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4076  protein of unknown function YGGT  34.15 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09691  hypothetical protein  28.41 
 
 
100 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0755134  normal  0.205345 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0297  hypothetical protein  28.41 
 
 
100 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.475908  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3782  protein of unknown function YGGT  34.15 
 
 
103 aa  40.8  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.402098  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36034  predicted protein  33.33 
 
 
237 aa  40.8  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.119025  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3585  protein of unknown function YGGT  33.87 
 
 
91 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0833218  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09491  hypothetical protein  29.11 
 
 
92 aa  40.4  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.291422  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2521  protein of unknown function YGGT  33.87 
 
 
91 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0295  protein of unknown function YGGT  32.39 
 
 
78 aa  40.4  0.009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315255  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0994  hypothetical protein  28.57 
 
 
92 aa  40.4  0.009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0252519  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1540  protein of unknown function YGGT  32.91 
 
 
96 aa  40  0.01  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.180759  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3609  protein of unknown function YGGT  40 
 
 
189 aa  40  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>