31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2059 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_2059  hypothetical protein  100 
 
 
91 aa  175  2e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0482  YGGT family protein  42.86 
 
 
84 aa  68.6  0.00000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1490  cell division membrane protein  37.65 
 
 
87 aa  63.2  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1199  cell division membrane protein  40 
 
 
98 aa  62.4  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1906  protein of unknown function YGGT  39.76 
 
 
90 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1036  protein of unknown function YGGT  37.18 
 
 
89 aa  55.5  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000119033  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0780  hypothetical protein  38.46 
 
 
85 aa  53.5  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0696156  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3725  protein of unknown function YGGT  32.14 
 
 
87 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00556578  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2082  protein of unknown function YGGT  38.37 
 
 
86 aa  50.8  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0261764  hitchhiker  0.000000000000996106 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15401  hypothetical protein  35.29 
 
 
99 aa  50.4  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.393994 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0595  protein of unknown function YGGT  34.33 
 
 
86 aa  48.9  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102021  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3950  ylmG protein  30.49 
 
 
87 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361919  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3912  ylmG protein  30.49 
 
 
87 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000638636 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4037  hypothetical protein  30.49 
 
 
87 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000926366  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3657  hypothetical protein  30.49 
 
 
87 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.516535  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3640  hypothetical protein  30.49 
 
 
87 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138235  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3749  ylmG protein  30.49 
 
 
87 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0442014  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3943  ylmG protein  30.49 
 
 
87 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00794391  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1242  ylmG protein  29.76 
 
 
87 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000199997  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0477  hypothetical protein  32.89 
 
 
99 aa  46.6  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0493  protein of unknown function YGGT  40 
 
 
92 aa  45.8  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.197871  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0755  ylmG protein  30.49 
 
 
96 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.298424  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2547  protein of unknown function YGGT  28.4 
 
 
87 aa  44.3  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167983  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08930  YGGT family protein  37.5 
 
 
84 aa  43.5  0.0009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.384516  hitchhiker  0.0000000251444 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3999  ylmG protein  32.31 
 
 
87 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000449706  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09691  hypothetical protein  37.18 
 
 
100 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0755134  normal  0.205345 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1433  hypothetical protein  30.86 
 
 
98 aa  42.4  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.116879 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0297  hypothetical protein  37.18 
 
 
100 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.475908  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2189  protein of unknown function YGGT  27.71 
 
 
96 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.318304  normal  0.111036 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1018  protein of unknown function YGGT  36.99 
 
 
85 aa  42  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0994  hypothetical protein  33.33 
 
 
92 aa  40.4  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0252519  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>