96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0755 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0755  ylmG protein  100 
 
 		 96 aa  183  6e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.298424  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1249  hypothetical protein  76.04 
 
 		 96 aa  129  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000234986  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1274  hypothetical protein  76.04 
 
 		 96 aa  129  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000722021  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3943  ylmG protein  48.81 
 
 		 87 aa  94  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00794391  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3657  hypothetical protein  48.81 
 
 		 87 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.516535  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4037  hypothetical protein  48.81 
 
 		 87 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000926366  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3950  ylmG protein  48.81 
 
 		 87 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361919  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3640  hypothetical protein  48.81 
 
 		 87 aa  92.4  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138235  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3749  ylmG protein  48.81 
 
 		 87 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0442014  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3912  ylmG protein  48.81 
 
 		 87 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000638636 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2547  protein of unknown function YGGT  48.15 
 
 		 87 aa  88.6  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167983  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3999  ylmG protein  47.62 
 
 		 87 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000449706  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3725  protein of unknown function YGGT  46.43 
 
 		 87 aa  87.8  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00556578  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1242  ylmG protein  47.62 
 
 		 87 aa  87  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000199997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1906  protein of unknown function YGGT  42.17 
 
 		 90 aa  84  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1036  protein of unknown function YGGT  44.19 
 
 		 89 aa  84  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000119033  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1490  cell division membrane protein  44.71 
 
 		 87 aa  73.2  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0493  protein of unknown function YGGT  37.5 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.197871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1199  cell division membrane protein  37.66 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0477  hypothetical protein  42.62 
 
 		 99 aa  55.5  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08930  YGGT family protein  40 
 
 		 84 aa  55.8  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.384516  hitchhiker  0.0000000251444 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0595  protein of unknown function YGGT  36.84 
 
 		 86 aa  55.1  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102021  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0714  protein of unknown function YGGT  36.05 
 
 		 84 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.674624  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5048  YGGT family protein  40 
 
 		 196 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710638  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0475  hypothetical protein  40 
 
 		 196 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1018  protein of unknown function YGGT  38.57 
 
 		 85 aa  53.9  0.0000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3056  protein of unknown function YGGT  36.71 
 
 		 196 aa  52.4  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.502077  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0295  protein of unknown function YGGT  35.14 
 
 		 78 aa  51.6  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315255  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1411  protein of unknown function YGGT  39.06 
 
 		 84 aa  50.8  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000759704  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0014  hypothetical protein  34.25 
 
 		 98 aa  50.4  0.000007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15401  hypothetical protein  29.9 
 
 		 99 aa  50.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.393994 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09420  YGGT family protein  40 
 
 		 86 aa  50.4  0.000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0374287  normal  0.111305 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5321  hypothetical protein  38.1 
 
 		 196 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1433  hypothetical protein  34.21 
 
 		 98 aa  48.9  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.116879 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0369  protein of unknown function YGGT  35.38 
 
 		 196 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1085  protein of unknown function YGGT  36.49 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000150484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0261  YGGT family protein  32.1 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.634053  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0438  protein of unknown function YGGT  32.1 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112129 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5146  protein of unknown function YGGT  33.85 
 
 		 196 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.605809  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4969  protein of unknown function YGGT  33.85 
 
 		 196 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5096  hypothetical protein  33.85 
 
 		 196 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2082  protein of unknown function YGGT  34.15 
 
 		 86 aa  47.8  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0261764  hitchhiker  0.000000000000996106 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09931  hypothetical protein  39.24 
 
 		 92 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09511  hypothetical protein  39.24 
 
 		 92 aa  47  0.00008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.545335  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0890  hypothetical protein  39.24 
 
 		 92 aa  47  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1412  protein of unknown function YGGT  38.89 
 
 		 186 aa  46.2  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4152  protein of unknown function YGGT  35.09 
 
 		 197 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.762639 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09491  hypothetical protein  37.97 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.291422  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0492  hypothetical protein  34.92 
 
 		 197 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2785  hypothetical protein  36.56 
 
 		 193 aa  45.1  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.555098  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3842  protein of unknown function YGGT  29.73 
 
 		 84 aa  45.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05130  hypothetical protein  33.33 
 
 		 197 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.409368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3655  protein of unknown function YGGT  31.03 
 
 		 199 aa  44.7  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03300  hypothetical protein  49.02 
 
 		 178 aa  44.7  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2059  hypothetical protein  30.49 
 
 		 91 aa  44.7  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2189  protein of unknown function YGGT  41.27 
 
 		 96 aa  44.3  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.318304  normal  0.111036 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2655  protein of unknown function YGGT  37.65 
 
 		 101 aa  44.3  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0666885  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3358  protein of unknown function YGGT  28.21 
 
 		 188 aa  44.3  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0016989 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0829  protein of unknown function YGGT  34.72 
 
 		 184 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0828  YggT family membrane protein  34.72 
 
 		 184 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.52765  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4761  protein of unknown function YGGT  29.13 
 
 		 106 aa  43.9  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.211635 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03060  hypothetical protein  30.16 
 
 		 197 aa  43.9  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479202  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0994  hypothetical protein  38.16 
 
 		 92 aa  43.9  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0252519  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1212  protein of unknown function YGGT  35.19 
 
 		 182 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0177861 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3708  protein of unknown function YGGT  43.75 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08491  integral membrane protein  32.99 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.321113  hitchhiker  0.00153658 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1141  cell division membrane protein  44.83 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3527  hypothetical protein  48.78 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12787  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1481  protein of unknown function YGGT  35.85 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1230  protein of unknown function YGGT  36.84 
 
 		 182 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000825612  normal  0.409234 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3609  protein of unknown function YGGT  31.94 
 
 		 189 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3275  YGGT family protein  28.21 
 
 		 188 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0250228 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3444  YGGT family protein  28.21 
 
 		 188 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.119003 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3348  YGGT family protein  28.21 
 
 		 188 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.299187  normal  0.126614 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3340  YGGT family protein  28.21 
 
 		 188 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.350216 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1838  hypothetical protein  29.87 
 
 		 189 aa  42  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000231673  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4038  protein of unknown function YGGT  30.56 
 
 		 96 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.5468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2921  protein of unknown function YGGT  28.17 
 
 		 184 aa  41.6  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.317852  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3109  hypothetical protein  40 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4076  protein of unknown function YGGT  33.87 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1838  protein of unknown function YGGT  26.47 
 
 		 183 aa  41.2  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3001  hypothetical protein  25.97 
 
 		 187 aa  41.2  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3665  YGGT family protein  46 
 
 		 181 aa  41.2  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.688821  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4032  protein of unknown function YGGT  36.21 
 
 		 184 aa  41.2  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886825 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2684  protein of unknown function YGGT  31.34 
 
 		 184 aa  40.8  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000426882  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3452  hypothetical protein  37.7 
 
 		 184 aa  40.4  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0294828  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3585  protein of unknown function YGGT  40 
 
 		 91 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0833218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3629  protein of unknown function YGGT  51.52 
 
 		 95 aa  40.8  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0933  protein of unknown function YGGT  31.43 
 
 		 85 aa  40.8  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0945487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3030  protein of unknown function YGGT  37.74 
 
 		 95 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2521  protein of unknown function YGGT  40 
 
 		 91 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3720  protein of unknown function YGGT  35.38 
 
 		 180 aa  40.4  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3782  protein of unknown function YGGT  33.87 
 
 		 103 aa  40.4  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.402098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0534  protein of unknown function YGGT  25.37 
 
 		 194 aa  40.4  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0140  YggT family membrane protein  36.07 
 
 		 184 aa  40.4  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00236591 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4335  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 		 97 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.680603  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>