189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1036 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1036  protein of unknown function YGGT  100 
 
 
89 aa  179  9.000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000119033  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1906  protein of unknown function YGGT  78.16 
 
 
90 aa  148  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1242  ylmG protein  60.71 
 
 
87 aa  111  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000199997  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3749  ylmG protein  61.9 
 
 
87 aa  110  9e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0442014  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3640  hypothetical protein  61.9 
 
 
87 aa  110  9e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138235  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3657  hypothetical protein  61.9 
 
 
87 aa  110  9e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.516535  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4037  hypothetical protein  61.9 
 
 
87 aa  110  9e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000926366  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3912  ylmG protein  61.9 
 
 
87 aa  110  9e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000638636 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3950  ylmG protein  61.9 
 
 
87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361919  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3943  ylmG protein  60.71 
 
 
87 aa  108  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00794391  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2547  protein of unknown function YGGT  63.51 
 
 
87 aa  107  6e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167983  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3725  protein of unknown function YGGT  60.71 
 
 
87 aa  106  9.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00556578  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3999  ylmG protein  59.52 
 
 
87 aa  106  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000449706  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1490  cell division membrane protein  56.58 
 
 
87 aa  88.2  3e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0755  ylmG protein  44.19 
 
 
96 aa  84  7e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.298424  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2082  protein of unknown function YGGT  45.35 
 
 
86 aa  78.2  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0261764  hitchhiker  0.000000000000996106 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1199  cell division membrane protein  45.12 
 
 
98 aa  75.5  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0477  hypothetical protein  45.57 
 
 
99 aa  73.9  0.0000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0595  protein of unknown function YGGT  44.74 
 
 
86 aa  73.9  0.0000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102021  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0714  protein of unknown function YGGT  47.56 
 
 
84 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.674624  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08930  YGGT family protein  46.75 
 
 
84 aa  72.8  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.384516  hitchhiker  0.0000000251444 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1249  hypothetical protein  45.24 
 
 
96 aa  71.6  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000234986  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1274  hypothetical protein  45.24 
 
 
96 aa  71.6  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000722021  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0994  hypothetical protein  48.19 
 
 
92 aa  70.9  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0252519  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08491  integral membrane protein  50.7 
 
 
102 aa  69.7  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.321113  hitchhiker  0.00153658 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3109  hypothetical protein  46.99 
 
 
92 aa  65.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264306  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2189  protein of unknown function YGGT  44.44 
 
 
96 aa  65.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.318304  normal  0.111036 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1433  hypothetical protein  46.58 
 
 
98 aa  65.1  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.116879 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0493  protein of unknown function YGGT  44.44 
 
 
92 aa  64.7  0.0000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.197871  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5048  YGGT family protein  38.89 
 
 
196 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710638  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0475  hypothetical protein  38.89 
 
 
196 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3329  protein of unknown function YGGT  46.99 
 
 
98 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5321  hypothetical protein  41.67 
 
 
196 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1411  protein of unknown function YGGT  41.89 
 
 
84 aa  62  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000759704  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1018  protein of unknown function YGGT  42.47 
 
 
85 aa  61.6  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_10630  predicted protein  50 
 
 
76 aa  61.2  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0482  YGGT family protein  41.67 
 
 
84 aa  60.5  0.000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4038  protein of unknown function YGGT  38.82 
 
 
96 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.5468  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3056  protein of unknown function YGGT  38.89 
 
 
196 aa  60.1  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.502077  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4076  protein of unknown function YGGT  38.82 
 
 
96 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15401  hypothetical protein  38.67 
 
 
99 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.393994 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2785  hypothetical protein  48 
 
 
193 aa  59.3  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.555098  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3782  protein of unknown function YGGT  38.82 
 
 
103 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.402098  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09931  hypothetical protein  47.76 
 
 
92 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09420  YGGT family protein  45 
 
 
86 aa  58.5  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0374287  normal  0.111305 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05130  hypothetical protein  38.03 
 
 
197 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.409368  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36034  predicted protein  41.1 
 
 
237 aa  58.5  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.119025  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09491  hypothetical protein  46.27 
 
 
92 aa  58.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.291422  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0492  hypothetical protein  38.03 
 
 
197 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0890  hypothetical protein  46.27 
 
 
92 aa  58.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03060  hypothetical protein  35.21 
 
 
197 aa  58.2  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479202  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09511  hypothetical protein  46.27 
 
 
92 aa  58.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.545335  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1141  cell division membrane protein  48.39 
 
 
64 aa  57.4  0.00000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4152  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 
197 aa  57  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.762639 
 
 
-
 
NC_002620  TC0014  hypothetical protein  36.92 
 
 
98 aa  56.2  0.0000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0297  hypothetical protein  49.3 
 
 
100 aa  56.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.475908  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0861  hypothetical protein  40 
 
 
88 aa  56.6  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00343102  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3842  protein of unknown function YGGT  41.79 
 
 
84 aa  56.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0933  protein of unknown function YGGT  41.89 
 
 
85 aa  56.6  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0945487  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09691  hypothetical protein  49.3 
 
 
100 aa  56.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0755134  normal  0.205345 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4335  protein of unknown function YGGT  47.06 
 
 
97 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.680603  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2059  hypothetical protein  37.18 
 
 
91 aa  55.5  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0780  hypothetical protein  40.3 
 
 
85 aa  55.8  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0696156  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3655  protein of unknown function YGGT  36.36 
 
 
199 aa  55.5  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3178  protein of unknown function YGGT  41.79 
 
 
85 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.314791  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1066  hypothetical protein  45.9 
 
 
98 aa  55.1  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2655  protein of unknown function YGGT  40.74 
 
 
101 aa  55.1  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0666885  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1085  protein of unknown function YGGT  39.24 
 
 
87 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000150484  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0534  protein of unknown function YGGT  35.14 
 
 
194 aa  54.7  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2905  protein of unknown function YGGT  40.3 
 
 
85 aa  54.3  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.356059  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3629  protein of unknown function YGGT  38.67 
 
 
95 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5096  hypothetical protein  35.38 
 
 
196 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109817  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3938  protein of unknown function YGGT  38.67 
 
 
95 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4969  protein of unknown function YGGT  35.38 
 
 
196 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0369  protein of unknown function YGGT  37.88 
 
 
196 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758714  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5146  protein of unknown function YGGT  35.38 
 
 
196 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.605809  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41246  predicted protein  44.83 
 
 
91 aa  51.2  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0509332  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1412  protein of unknown function YGGT  35.21 
 
 
186 aa  50.8  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0517  hypothetical protein  32.56 
 
 
97 aa  50.1  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0567252  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2188  integral membrane protein  36.84 
 
 
193 aa  50.1  0.000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.199645  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0598  protein of unknown function YGGT  30.77 
 
 
96 aa  50.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000192983  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1658  integral membrane protein  33.75 
 
 
185 aa  50.1  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000025742  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0339  protein of unknown function YGGT  32.43 
 
 
192 aa  49.7  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2214  hypothetical protein  36.84 
 
 
192 aa  50.1  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107485  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3358  protein of unknown function YGGT  38.89 
 
 
188 aa  49.3  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0016989 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4032  protein of unknown function YGGT  42.86 
 
 
184 aa  48.5  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886825 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0295  protein of unknown function YGGT  40 
 
 
78 aa  48.5  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315255  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4464  protein of unknown function YGGT  32.86 
 
 
100 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.338351 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3348  YGGT family protein  38.03 
 
 
188 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.299187  normal  0.126614 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0178  protein of unknown function YGGT  38.46 
 
 
189 aa  47.8  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00798567  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3444  YGGT family protein  38.03 
 
 
188 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.119003 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3340  YGGT family protein  38.03 
 
 
188 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.350216 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3275  YGGT family protein  38.03 
 
 
188 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0250228 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3001  hypothetical protein  34.29 
 
 
187 aa  47.4  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2017  hypothetical protein  31.91 
 
 
97 aa  47.4  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.314161 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4761  protein of unknown function YGGT  36.49 
 
 
106 aa  47.4  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.211635 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3609  protein of unknown function YGGT  37.5 
 
 
189 aa  47.4  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2921  protein of unknown function YGGT  34.38 
 
 
184 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.317852  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3096  protein of unknown function YGGT  38.36 
 
 
102 aa  46.6  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.669144  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0758  protein of unknown function YGGT  42.86 
 
 
184 aa  46.2  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>