176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3842 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3842  protein of unknown function YGGT  100 
 
 
84 aa  158  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3178  protein of unknown function YGGT  45.12 
 
 
85 aa  78.2  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.314791  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2905  protein of unknown function YGGT  44.44 
 
 
85 aa  77.8  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.356059  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0933  protein of unknown function YGGT  45.45 
 
 
85 aa  70.5  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0945487  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1362  protein of unknown function YGGT  43.9 
 
 
86 aa  65.9  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0339  protein of unknown function YGGT  45.21 
 
 
192 aa  63.9  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3001  hypothetical protein  44.26 
 
 
187 aa  59.7  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1906  protein of unknown function YGGT  36.11 
 
 
90 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0261  YGGT family protein  48.39 
 
 
92 aa  58.2  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.634053  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0438  protein of unknown function YGGT  48.39 
 
 
92 aa  58.2  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000112129 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0369  protein of unknown function YGGT  36.76 
 
 
196 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758714  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5096  hypothetical protein  36.76 
 
 
196 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109817  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5146  protein of unknown function YGGT  36.76 
 
 
196 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.605809  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1036  protein of unknown function YGGT  41.79 
 
 
89 aa  56.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000119033  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4969  protein of unknown function YGGT  36.76 
 
 
196 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0477  hypothetical protein  42.86 
 
 
99 aa  55.5  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3999  ylmG protein  39.39 
 
 
87 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000449706  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0714  protein of unknown function YGGT  40.62 
 
 
84 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.674624  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1242  ylmG protein  39.39 
 
 
87 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000199997  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3943  ylmG protein  41.27 
 
 
87 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00794391  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3749  ylmG protein  39.39 
 
 
87 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0442014  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3640  hypothetical protein  39.39 
 
 
87 aa  53.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138235  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3657  hypothetical protein  39.39 
 
 
87 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.516535  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3912  ylmG protein  39.39 
 
 
87 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000638636 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4037  hypothetical protein  39.39 
 
 
87 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000926366  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3725  protein of unknown function YGGT  39.71 
 
 
87 aa  52.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00556578  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3950  ylmG protein  39.39 
 
 
87 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361919  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1838  protein of unknown function YGGT  42.03 
 
 
183 aa  52.8  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1165  protein of unknown function YGGT  35.87 
 
 
105 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000835508  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03300  hypothetical protein  44.44 
 
 
178 aa  52  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5321  hypothetical protein  37.29 
 
 
196 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3655  protein of unknown function YGGT  31.65 
 
 
199 aa  51.6  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0947  protein of unknown function YGGT  40.98 
 
 
192 aa  51.6  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.618723  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5048  YGGT family protein  33.9 
 
 
196 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710638  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0475  hypothetical protein  33.9 
 
 
196 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3056  protein of unknown function YGGT  40 
 
 
196 aa  50.8  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.502077  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1237  protein of unknown function YGGT  42.47 
 
 
89 aa  50.8  0.000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.371486  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2547  protein of unknown function YGGT  37.68 
 
 
87 aa  50.4  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167983  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03060  hypothetical protein  37.29 
 
 
197 aa  50.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479202  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3609  protein of unknown function YGGT  40 
 
 
189 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1018  protein of unknown function YGGT  40.68 
 
 
85 aa  49.3  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3720  protein of unknown function YGGT  33.72 
 
 
180 aa  49.3  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05130  hypothetical protein  29.41 
 
 
197 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.409368  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2479  protein of unknown function YGGT  41.82 
 
 
182 aa  49.3  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.619107  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1981  protein of unknown function YGGT  39.06 
 
 
87 aa  48.5  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000863861  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1993  hypothetical protein  42.86 
 
 
191 aa  48.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3642  hypothetical protein  43.33 
 
 
202 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0534  protein of unknown function YGGT  31.08 
 
 
194 aa  48.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0492  hypothetical protein  28.24 
 
 
197 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1998  hypothetical protein  42.86 
 
 
191 aa  47.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4087  protein of unknown function YGGT  36.05 
 
 
186 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300525  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4199  protein of unknown function YGGT  36.05 
 
 
186 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7106  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0011  hypothetical protein  43.4 
 
 
185 aa  47.8  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1212  protein of unknown function YGGT  44.26 
 
 
182 aa  47.4  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0177861 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09491  hypothetical protein  40.51 
 
 
92 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.291422  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03580  hypothetical protein  43.4 
 
 
182 aa  47.4  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2188  integral membrane protein  47.92 
 
 
193 aa  47  0.00008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.199645  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0861  hypothetical protein  39.06 
 
 
88 aa  47  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00343102  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2214  hypothetical protein  47.92 
 
 
192 aa  47  0.00009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107485  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0890  hypothetical protein  38.55 
 
 
92 aa  47  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2862  protein of unknown function YGGT  34.55 
 
 
182 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0177844  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09511  hypothetical protein  38.55 
 
 
92 aa  47  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.545335  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09931  hypothetical protein  38.55 
 
 
92 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2870  protein of unknown function YGGT  43.86 
 
 
101 aa  46.2  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0388606 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02782  predicted inner membrane protein  41.38 
 
 
188 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.104199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0743  protein of unknown function YGGT  41.38 
 
 
188 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0818  protein of unknown function YGGT  43.75 
 
 
187 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3112  YGGT family protein  41.38 
 
 
188 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1336  protein of unknown function YGGT  37.5 
 
 
182 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000680586  hitchhiker  0.0000219253 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3384  YGGT family protein  41.38 
 
 
188 aa  45.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1411  protein of unknown function YGGT  38.6 
 
 
84 aa  45.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000759704  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4255  YGGT family protein  41.38 
 
 
188 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.809329  normal  0.660406 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0758  protein of unknown function YGGT  32.76 
 
 
184 aa  45.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1191  protein of unknown function YGGT  47.73 
 
 
182 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0253033  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1262  protein of unknown function YGGT  47.73 
 
 
182 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0091593  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3185  protein of unknown function YGGT  37.5 
 
 
182 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000491839  normal  0.0847291 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0807  protein of unknown function YGGT  43.75 
 
 
187 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.968375  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1192  protein of unknown function YGGT  47.73 
 
 
182 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0499744  normal  0.653735 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02745  hypothetical protein  41.38 
 
 
188 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.090594  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0762  protein of unknown function YGGT  41.38 
 
 
188 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000437553 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2449  protein of unknown function YGGT  38.89 
 
 
187 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.550896  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0541  membrane protein, related to K+ transport  38.18 
 
 
184 aa  45.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.182958  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0598  protein of unknown function YGGT  30.67 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000192983  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3094  YGGT family protein  41.38 
 
 
188 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000274597 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3027  protein of unknown function YGGT  37.5 
 
 
182 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000050243  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3296  YGGT family protein  41.38 
 
 
188 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3042  protein of unknown function YGGT  37.5 
 
 
182 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000245532  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0755  ylmG protein  29.73 
 
 
96 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.298424  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3355  hypothetical protein  45.45 
 
 
182 aa  45.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2158  hypothetical protein  44.23 
 
 
187 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.101701  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3111  hypothetical protein  44.23 
 
 
213 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2684  protein of unknown function YGGT  34.48 
 
 
184 aa  45.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000426882  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0469  protein of unknown function YGGT  43.75 
 
 
187 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0948  protein of unknown function YGGT  43.75 
 
 
187 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.199708  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2585  hypothetical protein  44.23 
 
 
213 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3028  YGGT family membrane protein  44.23 
 
 
213 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.952589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3083  YGGT family membrane protein  44.23 
 
 
213 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2028  YGGT family membrane protein  44.23 
 
 
187 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.835593  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0910  protein of unknown function YGGT  43.75 
 
 
187 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0547  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 
180 aa  45.4  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>