112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl1993 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp1998  hypothetical protein  99.48 
 
 		 191 aa  366  1e-101  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1993  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  367  1e-101  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3001  hypothetical protein  29.61 
 
 		 187 aa  78.2  0.00000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0339  protein of unknown function YGGT  29.21 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2188  integral membrane protein  31.36 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.199645  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2214  hypothetical protein  31.36 
 
 		 192 aa  71.2  0.000000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107485  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03060  hypothetical protein  27.13 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479202  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1125  protein of unknown function YGGT  31.84 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000165213  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3355  hypothetical protein  32.42 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5048  YGGT family protein  28.49 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710638  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0475  hypothetical protein  28.49 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2689  protein of unknown function YGGT  28.49 
 
 		 182 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.885228  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5573  hypothetical protein  29.28 
 
 		 187 aa  64.3  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364539  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1838  hypothetical protein  26.26 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000231673  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3056  protein of unknown function YGGT  26.9 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.502077  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1192  protein of unknown function YGGT  30.9 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0499744  normal  0.653735 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1230  protein of unknown function YGGT  29.78 
 
 		 182 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000825612  normal  0.409234 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3642  hypothetical protein  29.28 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2479  protein of unknown function YGGT  30.34 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.619107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3042  protein of unknown function YGGT  29.05 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000245532  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3185  protein of unknown function YGGT  29.05 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000491839  normal  0.0847291 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1336  protein of unknown function YGGT  29.05 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000680586  hitchhiker  0.0000219253 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0947  protein of unknown function YGGT  29.07 
 
 		 192 aa  62  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.618723  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5321  hypothetical protein  27.42 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1262  protein of unknown function YGGT  32.58 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0091593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3027  protein of unknown function YGGT  28.49 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000050243  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1135  protein of unknown function YGGT  30.9 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000824226  normal  0.525534 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03300  hypothetical protein  26.4 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2862  protein of unknown function YGGT  24.86 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0177844  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3042  hypothetical protein  31.64 
 
 		 180 aa  60.5  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.390306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4199  protein of unknown function YGGT  30.17 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03580  hypothetical protein  32.14 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4087  protein of unknown function YGGT  30.17 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1191  protein of unknown function YGGT  31.46 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0253033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0011  hypothetical protein  32.14 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05130  hypothetical protein  27.66 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.409368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0492  hypothetical protein  27.66 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0534  protein of unknown function YGGT  28.3 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3665  YGGT family protein  29.44 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.688821  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4152  protein of unknown function YGGT  27.66 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.762639 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3643  protein of unknown function YGGT  29.75 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3358  protein of unknown function YGGT  28.07 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0016989 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002454  membrane protein  31.55 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3111  hypothetical protein  25.68 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2585  hypothetical protein  25.68 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3028  YGGT family membrane protein  25.68 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.952589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3083  YGGT family membrane protein  25.68 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1522  hypothetical protein  26.23 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153866  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1212  protein of unknown function YGGT  25.41 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0177861 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0933  protein of unknown function YGGT  42.86 
 
 		 85 aa  55.1  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0945487  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2158  hypothetical protein  25.68 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.101701  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0751  YGGT family membrane protein  25.68 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2028  YGGT family membrane protein  25.68 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.835593  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0547  protein of unknown function YGGT  26.71 
 
 		 180 aa  54.3  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1330  protein of unknown function YGGT  31.28 
 
 		 182 aa  54.3  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.008416 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0369  protein of unknown function YGGT  23.08 
 
 		 196 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758714  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02073  hypothetical protein  31.06 
 
 		 183 aa  52.8  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.616502 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4032  protein of unknown function YGGT  27.65 
 
 		 184 aa  52.8  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886825 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4969  protein of unknown function YGGT  23.08 
 
 		 196 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3348  YGGT family protein  30.06 
 
 		 188 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.299187  normal  0.126614 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3340  YGGT family protein  30.06 
 
 		 188 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.350216 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3275  YGGT family protein  30.06 
 
 		 188 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0250228 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3444  YGGT family protein  30.06 
 
 		 188 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.119003 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0541  membrane protein, related to K+ transport  30.95 
 
 		 184 aa  52.4  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.182958  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5096  hypothetical protein  22.53 
 
 		 196 aa  52  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5146  protein of unknown function YGGT  21.43 
 
 		 196 aa  52  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.605809  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0607  protein of unknown function YGGT  25.68 
 
 		 187 aa  52  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02782  predicted inner membrane protein  28.09 
 
 		 188 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.104199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0743  protein of unknown function YGGT  28.09 
 
 		 188 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02745  hypothetical protein  28.09 
 
 		 188 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.090594  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3112  YGGT family protein  28.09 
 
 		 188 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3296  YGGT family protein  28.09 
 
 		 188 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0762  protein of unknown function YGGT  28.09 
 
 		 188 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000437553 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3094  YGGT family protein  28.09 
 
 		 188 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000274597 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3384  YGGT family protein  28.09 
 
 		 188 aa  51.6  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3264  YGGT family protein  28.4 
 
 		 188 aa  52  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4255  YGGT family protein  28.09 
 
 		 188 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.809329  normal  0.660406 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3178  protein of unknown function YGGT  39.44 
 
 		 85 aa  51.2  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.314791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3720  protein of unknown function YGGT  25.9 
 
 		 180 aa  50.4  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3452  hypothetical protein  28.82 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0294828  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2905  protein of unknown function YGGT  39.44 
 
 		 85 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.356059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0438  protein of unknown function YGGT  41.94 
 
 		 92 aa  50.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112129 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0261  YGGT family protein  41.94 
 
 		 92 aa  50.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.634053  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1838  protein of unknown function YGGT  23.86 
 
 		 183 aa  50.4  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2684  protein of unknown function YGGT  26.4 
 
 		 184 aa  49.3  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000426882  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3609  protein of unknown function YGGT  29.22 
 
 		 189 aa  49.3  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2449  protein of unknown function YGGT  25.14 
 
 		 187 aa  48.9  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.550896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1165  protein of unknown function YGGT  35.21 
 
 		 105 aa  48.1  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000835508  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3842  protein of unknown function YGGT  42.86 
 
 		 84 aa  48.1  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0880  hypothetical protein  22.78 
 
 		 187 aa  47.8  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3113  protein of unknown function YGGT  23.89 
 
 		 187 aa  47.8  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.143528  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0758  protein of unknown function YGGT  27.06 
 
 		 184 aa  47.4  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0807  protein of unknown function YGGT  23.08 
 
 		 187 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.968375  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0818  protein of unknown function YGGT  23.08 
 
 		 187 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2921  protein of unknown function YGGT  26.32 
 
 		 184 aa  47  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.317852  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0866  YGGT family protein  36.36 
 
 		 104 aa  46.2  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1166  protein of unknown function YGGT  35.71 
 
 		 105 aa  45.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866748  hitchhiker  0.00575832 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0405  protein of unknown function YGGT  33.72 
 
 		 97 aa  46.2  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0140  YggT family membrane protein  25.99 
 
 		 184 aa  45.1  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00236591 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0773  protein of unknown function YGGT  28.4 
 
 		 184 aa  45.1  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.148544  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>