191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E3384 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02782  predicted inner membrane protein  99.47 
 
 
188 aa  363  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.104199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0743  protein of unknown function YGGT  99.47 
 
 
188 aa  363  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0762  protein of unknown function YGGT  99.47 
 
 
188 aa  363  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000437553 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3094  YGGT family protein  99.47 
 
 
188 aa  363  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000274597 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3296  YGGT family protein  99.47 
 
 
188 aa  363  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3112  YGGT family protein  99.47 
 
 
188 aa  363  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02745  hypothetical protein  99.47 
 
 
188 aa  363  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.090594  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4255  YGGT family protein  99.47 
 
 
188 aa  363  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.809329  normal  0.660406 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3384  YGGT family protein  100 
 
 
188 aa  364  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3264  YGGT family protein  90.43 
 
 
188 aa  324  4.0000000000000003e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3358  protein of unknown function YGGT  84.04 
 
 
188 aa  322  2e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0016989 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3340  YGGT family protein  89.89 
 
 
188 aa  321  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.350216 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3275  YGGT family protein  89.89 
 
 
188 aa  321  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0250228 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3348  YGGT family protein  89.89 
 
 
188 aa  321  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.299187  normal  0.126614 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3444  YGGT family protein  89.89 
 
 
188 aa  321  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.119003 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3452  hypothetical protein  56.25 
 
 
184 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0294828  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0140  YggT family membrane protein  62.35 
 
 
184 aa  197  7e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236591 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4032  protein of unknown function YGGT  61.18 
 
 
184 aa  195  3e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886825 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0829  protein of unknown function YGGT  59.78 
 
 
184 aa  194  6e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0828  YggT family membrane protein  59.78 
 
 
184 aa  194  6e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.52765  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0758  protein of unknown function YGGT  55.21 
 
 
184 aa  194  7e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3609  protein of unknown function YGGT  56.25 
 
 
189 aa  192  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0541  membrane protein, related to K+ transport  53.67 
 
 
184 aa  190  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.182958  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002454  membrane protein  52.81 
 
 
185 aa  188  5e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0011  hypothetical protein  52.81 
 
 
185 aa  187  5.999999999999999e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03580  hypothetical protein  55.36 
 
 
182 aa  182  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0773  protein of unknown function YGGT  57.67 
 
 
184 aa  181  6e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.148544  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1125  protein of unknown function YGGT  48.85 
 
 
182 aa  175  4e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000165213  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1230  protein of unknown function YGGT  46.45 
 
 
182 aa  169  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000825612  normal  0.409234 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1135  protein of unknown function YGGT  50.3 
 
 
182 aa  168  3e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000824226  normal  0.525534 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3042  hypothetical protein  48.86 
 
 
180 aa  167  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.390306  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1330  protein of unknown function YGGT  49.43 
 
 
182 aa  164  5e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.008416 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2689  protein of unknown function YGGT  46.63 
 
 
182 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.885228  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2862  protein of unknown function YGGT  43.82 
 
 
182 aa  159  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0177844  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3355  hypothetical protein  43.68 
 
 
182 aa  153  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3720  protein of unknown function YGGT  48.8 
 
 
180 aa  152  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2684  protein of unknown function YGGT  41.57 
 
 
184 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000426882  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2479  protein of unknown function YGGT  45.4 
 
 
182 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.619107  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03300  hypothetical protein  44.83 
 
 
178 aa  150  7e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1192  protein of unknown function YGGT  43.17 
 
 
182 aa  148  5e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0499744  normal  0.653735 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1191  protein of unknown function YGGT  43.68 
 
 
182 aa  147  6e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0253033  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3665  YGGT family protein  43.79 
 
 
181 aa  147  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.688821  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1262  protein of unknown function YGGT  43.1 
 
 
182 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0091593  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3185  protein of unknown function YGGT  42.08 
 
 
182 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000491839  normal  0.0847291 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1336  protein of unknown function YGGT  42.08 
 
 
182 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000680586  hitchhiker  0.0000219253 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3042  protein of unknown function YGGT  42.08 
 
 
182 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000245532  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3027  protein of unknown function YGGT  43.65 
 
 
182 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000050243  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1658  integral membrane protein  40.91 
 
 
185 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000025742  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3642  hypothetical protein  42.29 
 
 
202 aa  118  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5573  hypothetical protein  40.94 
 
 
187 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364539  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0339  protein of unknown function YGGT  37.43 
 
 
192 aa  113  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03060  hypothetical protein  39.25 
 
 
197 aa  112  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479202  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0534  protein of unknown function YGGT  38.86 
 
 
194 aa  111  6e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3001  hypothetical protein  35.71 
 
 
187 aa  110  9e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5146  protein of unknown function YGGT  37.14 
 
 
196 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.605809  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0947  protein of unknown function YGGT  36.93 
 
 
192 aa  108  4.0000000000000004e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.618723  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4969  protein of unknown function YGGT  36 
 
 
196 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05130  hypothetical protein  36.81 
 
 
197 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.409368  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0492  hypothetical protein  36.81 
 
 
197 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5096  hypothetical protein  35.43 
 
 
196 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109817  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02073  hypothetical protein  41.94 
 
 
183 aa  105  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.616502 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2158  hypothetical protein  36.84 
 
 
187 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.101701  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3111  hypothetical protein  37.13 
 
 
213 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0751  YGGT family membrane protein  36.84 
 
 
187 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2585  hypothetical protein  37.13 
 
 
213 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3028  YGGT family membrane protein  37.13 
 
 
213 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.952589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3083  YGGT family membrane protein  37.13 
 
 
213 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2028  YGGT family membrane protein  36.84 
 
 
187 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.835593  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0369  protein of unknown function YGGT  35.76 
 
 
196 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758714  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4199  protein of unknown function YGGT  38.95 
 
 
186 aa  105  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7106  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4087  protein of unknown function YGGT  38.95 
 
 
186 aa  105  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300525  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1522  hypothetical protein  36.26 
 
 
187 aa  104  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153866  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5048  YGGT family protein  34.24 
 
 
196 aa  102  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710638  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0475  hypothetical protein  34.24 
 
 
196 aa  102  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4152  protein of unknown function YGGT  33.87 
 
 
197 aa  102  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.762639 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5321  hypothetical protein  35.39 
 
 
196 aa  101  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3056  protein of unknown function YGGT  33.15 
 
 
196 aa  101  8e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.502077  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0607  protein of unknown function YGGT  36.26 
 
 
187 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0547  protein of unknown function YGGT  39.75 
 
 
180 aa  99.4  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1838  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 
183 aa  98.2  6e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2449  protein of unknown function YGGT  35.67 
 
 
187 aa  97.4  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.550896  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0880  hypothetical protein  40.12 
 
 
187 aa  95.9  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123554  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0818  protein of unknown function YGGT  35.09 
 
 
187 aa  94  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3643  protein of unknown function YGGT  33.15 
 
 
196 aa  93.6  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0807  protein of unknown function YGGT  35.09 
 
 
187 aa  94  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.968375  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3113  protein of unknown function YGGT  39.53 
 
 
187 aa  92.8  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.143528  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2188  integral membrane protein  35.4 
 
 
193 aa  91.7  6e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.199645  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4049  protein of unknown function YGGT  36.26 
 
 
187 aa  91.3  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0910  protein of unknown function YGGT  36.26 
 
 
187 aa  91.3  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0469  protein of unknown function YGGT  36.26 
 
 
187 aa  91.3  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0948  protein of unknown function YGGT  36.26 
 
 
187 aa  91.3  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.199708  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2214  hypothetical protein  35.4 
 
 
192 aa  90.9  9e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107485  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2110  protein of unknown function YGGT  39.52 
 
 
191 aa  89.7  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1212  protein of unknown function YGGT  36.36 
 
 
182 aa  89.4  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0177861 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2921  protein of unknown function YGGT  32.93 
 
 
184 aa  89  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.317852  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2416  hypothetical protein  32.57 
 
 
191 aa  88.2  7e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1838  hypothetical protein  30.56 
 
 
189 aa  88.2  7e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000231673  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3700  protein of unknown function YGGT  36.31 
 
 
193 aa  85.5  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1534  YGGT family protein  40.24 
 
 
192 aa  84  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.460678  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1412  protein of unknown function YGGT  36.16 
 
 
186 aa  83.2  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>