121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0890 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0890  hypothetical protein  100 
 
 
92 aa  176  9e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09511  hypothetical protein  100 
 
 
92 aa  176  9e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.545335  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09931  hypothetical protein  98.9 
 
 
92 aa  173  6e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09491  hypothetical protein  97.83 
 
 
92 aa  173  8e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.291422  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08491  integral membrane protein  64.13 
 
 
102 aa  119  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.321113  hitchhiker  0.00153658 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1433  hypothetical protein  62.34 
 
 
98 aa  108  3e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.116879 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15401  hypothetical protein  52.87 
 
 
99 aa  106  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.393994 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0297  hypothetical protein  53.33 
 
 
100 aa  97.8  5e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.475908  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09691  hypothetical protein  53.33 
 
 
100 aa  97.8  5e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0755134  normal  0.205345 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3109  hypothetical protein  61.11 
 
 
92 aa  94.4  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264306  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1066  hypothetical protein  61.25 
 
 
98 aa  92.4  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0994  hypothetical protein  53.01 
 
 
92 aa  90.5  6e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0252519  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3329  protein of unknown function YGGT  57.5 
 
 
98 aa  90.1  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36034  predicted protein  53.66 
 
 
237 aa  76.6  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.119025  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0714  protein of unknown function YGGT  45.78 
 
 
84 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.674624  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0477  hypothetical protein  46.84 
 
 
99 aa  72.8  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2189  protein of unknown function YGGT  44.44 
 
 
96 aa  71.6  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.318304  normal  0.111036 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_10630  predicted protein  53.03 
 
 
76 aa  71.6  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4335  protein of unknown function YGGT  50.67 
 
 
97 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.680603  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1411  protein of unknown function YGGT  44.16 
 
 
84 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000759704  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3585  protein of unknown function YGGT  48.28 
 
 
91 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0833218  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2521  protein of unknown function YGGT  48.28 
 
 
91 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1018  protein of unknown function YGGT  37.66 
 
 
85 aa  59.7  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3999  ylmG protein  41.03 
 
 
87 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000449706  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1242  ylmG protein  42.31 
 
 
87 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000199997  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1036  protein of unknown function YGGT  46.27 
 
 
89 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000119033  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3725  protein of unknown function YGGT  39.76 
 
 
87 aa  57  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00556578  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3943  ylmG protein  40.96 
 
 
87 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00794391  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2017  hypothetical protein  34.62 
 
 
97 aa  56.2  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.314161 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2547  protein of unknown function YGGT  42.47 
 
 
87 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167983  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2082  protein of unknown function YGGT  39.19 
 
 
86 aa  55.5  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0261764  hitchhiker  0.000000000000996106 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1906  protein of unknown function YGGT  40.3 
 
 
90 aa  55.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3665  YGGT family protein  46.15 
 
 
181 aa  55.5  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.688821  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0517  hypothetical protein  33.33 
 
 
97 aa  55.1  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0567252  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41246  predicted protein  38.6 
 
 
91 aa  55.1  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0509332  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0493  protein of unknown function YGGT  39.47 
 
 
92 aa  54.7  0.0000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.197871  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1085  protein of unknown function YGGT  38.36 
 
 
87 aa  54.7  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000150484  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3749  ylmG protein  39.76 
 
 
87 aa  54.7  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0442014  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3640  hypothetical protein  39.76 
 
 
87 aa  54.7  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138235  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3657  hypothetical protein  39.76 
 
 
87 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.516535  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4037  hypothetical protein  39.76 
 
 
87 aa  54.7  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000926366  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3950  ylmG protein  41.86 
 
 
87 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361919  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3912  ylmG protein  39.76 
 
 
87 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000638636 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1481  protein of unknown function YGGT  36.99 
 
 
94 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00691  hypothetical protein  37.66 
 
 
102 aa  53.9  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.82447 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0420  hypothetical protein  29.63 
 
 
110 aa  53.1  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2655  protein of unknown function YGGT  33.66 
 
 
101 aa  52.8  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0666885  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1199  cell division membrane protein  36.36 
 
 
98 aa  50.8  0.000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0063  hypothetical protein  33.77 
 
 
104 aa  50.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0415  protein of unknown function YGGT  35.23 
 
 
107 aa  50.4  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000337721  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0339  protein of unknown function YGGT  35 
 
 
192 aa  49.7  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5048  YGGT family protein  37.21 
 
 
196 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710638  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0475  hypothetical protein  37.21 
 
 
196 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3655  protein of unknown function YGGT  34.57 
 
 
199 aa  49.3  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08930  YGGT family protein  35.44 
 
 
84 aa  49.3  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.384516  hitchhiker  0.0000000251444 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03300  hypothetical protein  35 
 
 
178 aa  49.3  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2260  hypothetical protein  33.33 
 
 
109 aa  48.5  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.48974  normal  0.571273 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3708  protein of unknown function YGGT  31.08 
 
 
94 aa  48.5  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00731  hypothetical protein  31.17 
 
 
101 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03211  hypothetical protein  28.57 
 
 
119 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.97846 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09420  YGGT family protein  43.24 
 
 
86 aa  48.5  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0374287  normal  0.111305 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00721  hypothetical protein  31.17 
 
 
101 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0492  hypothetical protein  36.25 
 
 
197 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0438  protein of unknown function YGGT  38.03 
 
 
92 aa  47.4  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000112129 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0261  YGGT family protein  38.03 
 
 
92 aa  47.4  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.634053  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0755  ylmG protein  39.24 
 
 
96 aa  47  0.00008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.298424  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0052  hypothetical protein  29.49 
 
 
97 aa  47  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05130  hypothetical protein  35 
 
 
197 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.409368  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3030  protein of unknown function YGGT  32.88 
 
 
95 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4152  protein of unknown function YGGT  32.58 
 
 
197 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.762639 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1165  protein of unknown function YGGT  34.15 
 
 
105 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000835508  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3842  protein of unknown function YGGT  38.55 
 
 
84 aa  47  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3520  protein of unknown function YGGT  36.36 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1490  cell division membrane protein  32.14 
 
 
87 aa  45.8  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2479  protein of unknown function YGGT  33.75 
 
 
182 aa  46.2  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.619107  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_10668  predicted protein  24.68 
 
 
82 aa  45.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.605369 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03060  hypothetical protein  34.94 
 
 
197 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479202  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4497  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 
96 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4433  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 
96 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0271  hypothetical protein  31.52 
 
 
96 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2862  protein of unknown function YGGT  31.33 
 
 
182 aa  45.1  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0177844  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01251  hypothetical protein  31.17 
 
 
99 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0502319  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0014  hypothetical protein  32.91 
 
 
98 aa  44.3  0.0006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1424  hypothetical protein  35.38 
 
 
99 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5321  hypothetical protein  38.89 
 
 
196 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2689  protein of unknown function YGGT  38.46 
 
 
182 aa  43.9  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.885228  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0598  protein of unknown function YGGT  31.76 
 
 
96 aa  43.5  0.0009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000192983  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0534  protein of unknown function YGGT  28.24 
 
 
194 aa  43.5  0.0009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3355  hypothetical protein  35.06 
 
 
182 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0861  hypothetical protein  31.71 
 
 
88 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00343102  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2684  protein of unknown function YGGT  34.85 
 
 
184 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000426882  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1191  protein of unknown function YGGT  35.53 
 
 
182 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0253033  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2870  protein of unknown function YGGT  28.41 
 
 
101 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0388606 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3348  YGGT family protein  31.51 
 
 
188 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.299187  normal  0.126614 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3340  YGGT family protein  31.51 
 
 
188 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.350216 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3275  YGGT family protein  31.51 
 
 
188 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0250228 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3444  YGGT family protein  31.51 
 
 
188 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.119003 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5096  hypothetical protein  30 
 
 
196 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109817  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2785  hypothetical protein  36.59 
 
 
193 aa  42.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.555098  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1192  protein of unknown function YGGT  35.53 
 
 
182 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0499744  normal  0.653735 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>