67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0598 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0598  protein of unknown function YGGT  100 
 
 
96 aa  183  6e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000192983  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0790  hythetical protein  38.55 
 
 
94 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000412009  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0861  hypothetical protein  32.91 
 
 
88 aa  53.5  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00343102  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0714  protein of unknown function YGGT  31.52 
 
 
84 aa  50.4  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.674624  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1036  protein of unknown function YGGT  30.77 
 
 
89 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000119033  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0339  protein of unknown function YGGT  34.21 
 
 
192 aa  49.7  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1906  protein of unknown function YGGT  31.4 
 
 
90 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0989  protein of unknown function YGGT  35.48 
 
 
114 aa  48.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0933  protein of unknown function YGGT  33.78 
 
 
85 aa  48.9  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0945487  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3655  protein of unknown function YGGT  32.97 
 
 
199 aa  48.1  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1242  ylmG protein  28.42 
 
 
87 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000199997  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3912  ylmG protein  28.42 
 
 
87 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000638636 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3725  protein of unknown function YGGT  28.42 
 
 
87 aa  47.4  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00556578  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4037  hypothetical protein  28.42 
 
 
87 aa  47.4  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000926366  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3657  hypothetical protein  28.42 
 
 
87 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.516535  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3640  hypothetical protein  28.42 
 
 
87 aa  47.4  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138235  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3749  ylmG protein  28.42 
 
 
87 aa  47.4  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0442014  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2172  hypothetical protein  37.21 
 
 
100 aa  47  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0505653  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3950  ylmG protein  28.42 
 
 
87 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361919  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3943  ylmG protein  29.47 
 
 
87 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00794391  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2905  protein of unknown function YGGT  40.32 
 
 
85 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.356059  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3178  protein of unknown function YGGT  36.76 
 
 
85 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.314791  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1362  protein of unknown function YGGT  31.71 
 
 
86 aa  46.6  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3842  protein of unknown function YGGT  30.67 
 
 
84 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3999  ylmG protein  28.42 
 
 
87 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000449706  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2547  protein of unknown function YGGT  27.37 
 
 
87 aa  45.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167983  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0477  hypothetical protein  32.86 
 
 
99 aa  45.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0415  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 
107 aa  44.7  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000337721  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1237  protein of unknown function YGGT  32.88 
 
 
89 aa  44.3  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.371486  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0053  protein of unknown function YGGT  38.37 
 
 
99 aa  44.3  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.941254 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3054  protein of unknown function YGGT  35.9 
 
 
99 aa  44.3  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.649035  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4969  protein of unknown function YGGT  30.68 
 
 
196 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5146  protein of unknown function YGGT  30.68 
 
 
196 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.605809  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09931  hypothetical protein  31.76 
 
 
92 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0020  protein of unknown function YGGT  31.58 
 
 
94 aa  43.9  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.310945  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1411  protein of unknown function YGGT  28.24 
 
 
84 aa  43.9  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000759704  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0890  hypothetical protein  31.76 
 
 
92 aa  43.5  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09511  hypothetical protein  31.76 
 
 
92 aa  43.5  0.0009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.545335  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0057  protein of unknown function YGGT  32.63 
 
 
96 aa  42.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3706  protein of unknown function YGGT  37.04 
 
 
103 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.535312  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5096  hypothetical protein  29.55 
 
 
196 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109817  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4045  protein of unknown function YGGT  25.58 
 
 
95 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000118098  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0534  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 
194 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09491  hypothetical protein  31.76 
 
 
92 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.291422  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08491  integral membrane protein  31.25 
 
 
102 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.321113  hitchhiker  0.00153658 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0508  protein of unknown function YGGT  34.74 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.842199  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2724  protein of unknown function YGGT  29.11 
 
 
109 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1992  YGGT family protein  33.33 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1492  protein of unknown function YGGT  29.11 
 
 
109 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290091  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3527  hypothetical protein  37.66 
 
 
99 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12787  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0327  yggt family protein  33.7 
 
 
97 aa  42  0.003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36034  predicted protein  30.26 
 
 
237 aa  42  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.119025  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1918  YGGT family protein  33.33 
 
 
194 aa  42  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0271  hypothetical protein  37.33 
 
 
96 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3637  protein of unknown function YGGT  31.76 
 
 
94 aa  41.2  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.160206  normal  0.479955 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0369  protein of unknown function YGGT  28.41 
 
 
196 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758714  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1658  integral membrane protein  39.39 
 
 
185 aa  41.6  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000025742  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3329  protein of unknown function YGGT  35.14 
 
 
98 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09691  hypothetical protein  32.43 
 
 
100 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0755134  normal  0.205345 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0297  hypothetical protein  32.43 
 
 
100 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.475908  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0956  protein of unknown function YGGT  23.08 
 
 
89 aa  41.2  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00321355  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3109  hypothetical protein  31.25 
 
 
92 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264306  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4027  protein of unknown function YGGT  32.1 
 
 
96 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483363  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3609  protein of unknown function YGGT  27.78 
 
 
189 aa  40.8  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0482  YGGT family protein  32.47 
 
 
84 aa  40.4  0.008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1346  protein of unknown function YGGT  31.75 
 
 
91 aa  40  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000041237  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0947  protein of unknown function YGGT  26.83 
 
 
192 aa  40  0.01  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.618723  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>