167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0178 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0178  protein of unknown function YGGT  100 
 
 		 189 aa  372  1e-102  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00798567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0166  hypothetical protein  97.88 
 
 		 189 aa  367  1e-101  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000107926  hitchhiker  0.0000185577 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0338  protein of unknown function YGGT  60.44 
 
 		 188 aa  216  1e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171919  hitchhiker  0.00000000521514 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03060  hypothetical protein  30.6 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479202  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0339  protein of unknown function YGGT  30.23 
 
 		 192 aa  74.7  0.0000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0534  protein of unknown function YGGT  31.15 
 
 		 194 aa  74.3  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3056  protein of unknown function YGGT  31.94 
 
 		 196 aa  72.8  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.502077  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03300  hypothetical protein  30.77 
 
 		 178 aa  72.8  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05130  hypothetical protein  30 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.409368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0369  protein of unknown function YGGT  29.65 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0475  hypothetical protein  28.95 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2862  protein of unknown function YGGT  30 
 
 		 182 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0177844  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5096  hypothetical protein  28.49 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109817  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5048  YGGT family protein  28.42 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710638  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4969  protein of unknown function YGGT  28.49 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0492  hypothetical protein  29.44 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5321  hypothetical protein  31.05 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5146  protein of unknown function YGGT  27.33 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.605809  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4152  protein of unknown function YGGT  31.15 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.762639 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3720  protein of unknown function YGGT  32.35 
 
 		 180 aa  67.8  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3042  hypothetical protein  27.91 
 
 		 180 aa  67.4  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.390306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2684  protein of unknown function YGGT  32.62 
 
 		 184 aa  67  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000426882  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2689  protein of unknown function YGGT  30.56 
 
 		 182 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.885228  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0947  protein of unknown function YGGT  32.95 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.618723  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0541  membrane protein, related to K+ transport  27.47 
 
 		 184 aa  62  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.182958  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3355  hypothetical protein  30.82 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02782  predicted inner membrane protein  27.01 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.104199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0743  protein of unknown function YGGT  27.01 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02745  hypothetical protein  27.01 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.090594  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3384  YGGT family protein  27.01 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0762  protein of unknown function YGGT  27.01 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000437553 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4255  YGGT family protein  27.01 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.809329  normal  0.660406 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3094  YGGT family protein  27.01 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000274597 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3112  YGGT family protein  27.01 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3296  YGGT family protein  27.01 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2426  protein of unknown function YGGT  25 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3264  YGGT family protein  29.88 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3452  hypothetical protein  29.56 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0294828  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1125  protein of unknown function YGGT  32.1 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000165213  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2724  protein of unknown function YGGT  34.62 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1492  protein of unknown function YGGT  34.62 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290091  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1838  hypothetical protein  26.09 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000231673  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3643  protein of unknown function YGGT  29.41 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1135  protein of unknown function YGGT  30 
 
 		 182 aa  57  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000824226  normal  0.525534 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0011  hypothetical protein  29.78 
 
 		 185 aa  57  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03580  hypothetical protein  28.11 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3444  YGGT family protein  29.27 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.119003 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3275  YGGT family protein  29.27 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0250228 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3340  YGGT family protein  29.27 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.350216 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3348  YGGT family protein  29.27 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.299187  normal  0.126614 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3609  protein of unknown function YGGT  30.25 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002454  membrane protein  29.63 
 
 		 185 aa  57  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1336  protein of unknown function YGGT  30.82 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000680586  hitchhiker  0.0000219253 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3185  protein of unknown function YGGT  30.82 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000491839  normal  0.0847291 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3042  protein of unknown function YGGT  30.82 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000245532  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1230  protein of unknown function YGGT  28.21 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000825612  normal  0.409234 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1191  protein of unknown function YGGT  31.45 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0253033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3027  protein of unknown function YGGT  30.82 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000050243  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1018  protein of unknown function YGGT  40.85 
 
 		 85 aa  55.1  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1262  protein of unknown function YGGT  30.82 
 
 		 182 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0091593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1192  protein of unknown function YGGT  31.45 
 
 		 182 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0499744  normal  0.653735 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0020  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 		 94 aa  53.9  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.310945  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0271  hypothetical protein  32.26 
 
 		 96 aa  54.3  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3665  YGGT family protein  27.01 
 
 		 181 aa  53.5  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.688821  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1330  protein of unknown function YGGT  29.22 
 
 		 182 aa  53.5  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.008416 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2479  protein of unknown function YGGT  28.33 
 
 		 182 aa  53.5  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.619107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0829  protein of unknown function YGGT  29.59 
 
 		 184 aa  52.8  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0828  YggT family membrane protein  29.59 
 
 		 184 aa  52.8  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.52765  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3655  protein of unknown function YGGT  29.87 
 
 		 199 aa  52.4  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0933  protein of unknown function YGGT  40.32 
 
 		 85 aa  52.4  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0945487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1212  protein of unknown function YGGT  37.14 
 
 		 182 aa  52  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0177861 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3358  protein of unknown function YGGT  26.79 
 
 		 188 aa  52  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0016989 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1360  hypothetical protein  34.94 
 
 		 101 aa  51.6  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0028  protein of unknown function YGGT  34.94 
 
 		 96 aa  51.2  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.242413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0861  hypothetical protein  42.86 
 
 		 88 aa  51.2  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00343102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2416  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  50.4  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0140  YggT family membrane protein  31.25 
 
 		 184 aa  50.4  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00236591 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0866  YGGT family protein  35.38 
 
 		 104 aa  49.3  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3001  hypothetical protein  24.86 
 
 		 187 aa  49.7  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3527  hypothetical protein  36 
 
 		 99 aa  49.3  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12787  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1085  protein of unknown function YGGT  47.37 
 
 		 87 aa  49.3  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000150484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4032  protein of unknown function YGGT  27.98 
 
 		 184 aa  49.3  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886825 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0758  protein of unknown function YGGT  24.68 
 
 		 184 aa  48.9  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0341  protein of unknown function YGGT  33.78 
 
 		 124 aa  48.9  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1838  protein of unknown function YGGT  40.98 
 
 		 183 aa  48.9  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0018  protein of unknown function YGGT  33.73 
 
 		 95 aa  48.5  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.292831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0478  hypothetical protein  36.23 
 
 		 96 aa  48.5  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2921  protein of unknown function YGGT  26.67 
 
 		 184 aa  48.5  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.317852  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2158  hypothetical protein  29.61 
 
 		 187 aa  48.1  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.101701  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3886  hypothetical protein  35.14 
 
 		 177 aa  48.1  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0843847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3642  hypothetical protein  25.88 
 
 		 202 aa  48.1  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0751  YGGT family membrane protein  29.61 
 
 		 187 aa  48.1  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2028  YGGT family membrane protein  29.61 
 
 		 187 aa  48.1  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.835593  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2655  protein of unknown function YGGT  34.57 
 
 		 101 aa  48.1  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0666885  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1036  protein of unknown function YGGT  38.46 
 
 		 89 aa  47.8  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000119033  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0508  protein of unknown function YGGT  30.95 
 
 		 96 aa  47.8  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.842199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4027  protein of unknown function YGGT  38.71 
 
 		 96 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3111  hypothetical protein  28.4 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1166  protein of unknown function YGGT  35.38 
 
 		 105 aa  47.4  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866748  hitchhiker  0.00575832 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1411  protein of unknown function YGGT  38.81 
 
 		 84 aa  47  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000759704  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>