216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3938 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3938  protein of unknown function YGGT  100 
 
 		 95 aa  180  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4038  protein of unknown function YGGT  72.63 
 
 		 96 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.5468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4076  protein of unknown function YGGT  69.47 
 
 		 96 aa  124  5e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3782  protein of unknown function YGGT  69.47 
 
 		 103 aa  124  6e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.402098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3629  protein of unknown function YGGT  91.58 
 
 		 95 aa  122  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4464  protein of unknown function YGGT  70 
 
 		 100 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.338351 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0057  protein of unknown function YGGT  60.92 
 
 		 96 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0508  protein of unknown function YGGT  58.62 
 
 		 96 aa  104  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.842199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0989  protein of unknown function YGGT  58.62 
 
 		 114 aa  104  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0271  hypothetical protein  57.14 
 
 		 96 aa  103  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3527  hypothetical protein  57.47 
 
 		 99 aa  101  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12787  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4152  hypothetical protein  61.7 
 
 		 96 aa  98.2  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2655  protein of unknown function YGGT  48.42 
 
 		 101 aa  97.4  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0666885  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0327  yggt family protein  51.09 
 
 		 97 aa  97.1  8e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0607  protein of unknown function YGGT  57.47 
 
 		 96 aa  94  7e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0478  hypothetical protein  57.47 
 
 		 96 aa  93.6  8e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3706  protein of unknown function YGGT  57.53 
 
 		 103 aa  90.1  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.535312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1918  YGGT family protein  55.68 
 
 		 194 aa  88.2  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1992  YGGT family protein  55.68 
 
 		 96 aa  87.4  6e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4027  protein of unknown function YGGT  55.06 
 
 		 96 aa  87  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0110  hypothetical protein  58.82 
 
 		 119 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0365579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0692  protein of unknown function YGGT  57.35 
 
 		 96 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4761  protein of unknown function YGGT  54.05 
 
 		 106 aa  82  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.211635 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0419  protein of unknown function YGGT  55.88 
 
 		 96 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2973  protein of unknown function YGGT  41.67 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3372  protein of unknown function YGGT  54.41 
 
 		 96 aa  78.6  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3096  protein of unknown function YGGT  46.38 
 
 		 102 aa  74.3  0.0000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.669144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3568  protein of unknown function YGGT  53.95 
 
 		 96 aa  74.3  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1917  protein of unknown function YGGT  46.67 
 
 		 102 aa  71.2  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.951257  normal  0.340645 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0341  protein of unknown function YGGT  40.74 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2879  protein of unknown function YGGT  53.33 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.147865 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0053  protein of unknown function YGGT  41.46 
 
 		 99 aa  70.1  0.000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.941254 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1165  protein of unknown function YGGT  38.38 
 
 		 105 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000835508  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1370  protein of unknown function YGGT  60.38 
 
 		 100 aa  68.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2724  protein of unknown function YGGT  40.23 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1492  protein of unknown function YGGT  40.23 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290091  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1360  hypothetical protein  39.71 
 
 		 101 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1166  protein of unknown function YGGT  40.23 
 
 		 105 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866748  hitchhiker  0.00575832 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2870  protein of unknown function YGGT  48.44 
 
 		 101 aa  65.1  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388606 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0028  protein of unknown function YGGT  39.71 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.242413  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0866  YGGT family protein  40.51 
 
 		 104 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0018  protein of unknown function YGGT  38.24 
 
 		 95 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.292831  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0121  YGGT family protein  38.1 
 
 		 92 aa  62.8  0.000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3299  protein of unknown function YGGT  47.22 
 
 		 99 aa  60.1  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02782  predicted inner membrane protein  45.57 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.104199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0743  protein of unknown function YGGT  45.57 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3094  YGGT family protein  45.57 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000274597 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02745  hypothetical protein  45.57 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.090594  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3609  protein of unknown function YGGT  36.36 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0762  protein of unknown function YGGT  45.57 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000437553 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3296  YGGT family protein  45.57 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3112  YGGT family protein  45.57 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4255  YGGT family protein  45.57 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.809329  normal  0.660406 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3384  YGGT family protein  45.57 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1036  protein of unknown function YGGT  37.23 
 
 		 89 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000119033  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3335  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 		 95 aa  57.8  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.982716 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3358  protein of unknown function YGGT  40.23 
 
 		 188 aa  57  0.00000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0016989 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0415  protein of unknown function YGGT  39.74 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000337721  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0615  hypothetical protein  34.88 
 
 		 93 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.8017800000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3054  protein of unknown function YGGT  43.04 
 
 		 99 aa  55.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.649035  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0020  protein of unknown function YGGT  34.94 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.310945  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1212  protein of unknown function YGGT  39.74 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0177861 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0828  YggT family membrane protein  32.61 
 
 		 184 aa  54.3  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.52765  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0829  protein of unknown function YGGT  32.61 
 
 		 184 aa  54.3  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3720  protein of unknown function YGGT  34.44 
 
 		 180 aa  53.9  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4032  protein of unknown function YGGT  31.52 
 
 		 184 aa  53.9  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886825 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0891  YGGT family protein  36.05 
 
 		 94 aa  52.8  0.000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0499141  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0140  YggT family membrane protein  33.7 
 
 		 184 aa  52.8  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00236591 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0211  protein of unknown function YGGT  36.05 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0339  protein of unknown function YGGT  33.71 
 
 		 192 aa  52.4  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1242  ylmG protein  32.61 
 
 		 87 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000199997  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5048  YGGT family protein  40.62 
 
 		 196 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710638  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0475  hypothetical protein  40.62 
 
 		 196 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2158  hypothetical protein  41.89 
 
 		 187 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.101701  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3111  hypothetical protein  41.89 
 
 		 213 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4049  protein of unknown function YGGT  46.15 
 
 		 187 aa  51.2  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0751  YGGT family membrane protein  41.89 
 
 		 187 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2585  hypothetical protein  41.89 
 
 		 213 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3028  YGGT family membrane protein  41.89 
 
 		 213 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.952589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3083  YGGT family membrane protein  41.89 
 
 		 213 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2028  YGGT family membrane protein  41.89 
 
 		 187 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.835593  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03060  hypothetical protein  43.59 
 
 		 197 aa  51.2  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479202  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0807  protein of unknown function YGGT  40.54 
 
 		 187 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.968375  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0818  protein of unknown function YGGT  40.54 
 
 		 187 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0369  protein of unknown function YGGT  29.35 
 
 		 196 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758714  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3452  hypothetical protein  34.78 
 
 		 184 aa  50.4  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0294828  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1838  protein of unknown function YGGT  40.62 
 
 		 183 aa  50.1  0.000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5096  hypothetical protein  32.39 
 
 		 196 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109817  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0758  protein of unknown function YGGT  31.52 
 
 		 184 aa  49.7  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2449  protein of unknown function YGGT  43.08 
 
 		 187 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.550896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1522  hypothetical protein  40.54 
 
 		 187 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153866  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5146  protein of unknown function YGGT  28.26 
 
 		 196 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.605809  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0469  protein of unknown function YGGT  43.08 
 
 		 187 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0948  protein of unknown function YGGT  43.08 
 
 		 187 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.199708  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3042  hypothetical protein  35.23 
 
 		 180 aa  49.7  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.390306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0534  protein of unknown function YGGT  34.57 
 
 		 194 aa  50.1  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4969  protein of unknown function YGGT  28.26 
 
 		 196 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3113  protein of unknown function YGGT  41.89 
 
 		 187 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.143528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0910  protein of unknown function YGGT  43.08 
 
 		 187 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1658  integral membrane protein  31.87 
 
 		 185 aa  48.9  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000025742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>