34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0482 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0482  YGGT family protein  100 
 
 
84 aa  159  1e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0780  hypothetical protein  47.22 
 
 
85 aa  72  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0696156  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2059  hypothetical protein  42.86 
 
 
91 aa  68.6  0.00000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1242  ylmG protein  39.76 
 
 
87 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000199997  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3725  protein of unknown function YGGT  40.48 
 
 
87 aa  62.4  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00556578  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4037  hypothetical protein  39.76 
 
 
87 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000926366  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3912  ylmG protein  39.76 
 
 
87 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000638636 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3657  hypothetical protein  39.76 
 
 
87 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.516535  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3640  hypothetical protein  39.76 
 
 
87 aa  61.2  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138235  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3749  ylmG protein  39.76 
 
 
87 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0442014  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3950  ylmG protein  39.76 
 
 
87 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361919  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1036  protein of unknown function YGGT  41.67 
 
 
89 aa  60.5  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000119033  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3943  ylmG protein  39.76 
 
 
87 aa  60.8  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00794391  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3999  ylmG protein  40.54 
 
 
87 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000449706  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2547  protein of unknown function YGGT  38.55 
 
 
87 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167983  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1906  protein of unknown function YGGT  39.76 
 
 
90 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3655  protein of unknown function YGGT  39.44 
 
 
199 aa  50.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4152  protein of unknown function YGGT  35.71 
 
 
197 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.762639 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1490  cell division membrane protein  40.32 
 
 
87 aa  45.8  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1547  riboflavin synthase alpha subunit  37.5 
 
 
97 aa  45.1  0.0004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.836777  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0271  hypothetical protein  31.03 
 
 
96 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03060  hypothetical protein  35.71 
 
 
197 aa  43.9  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479202  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0615  hypothetical protein  42.03 
 
 
93 aa  43.9  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.8017800000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0493  protein of unknown function YGGT  34.18 
 
 
92 aa  43.9  0.0008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.197871  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0534  protein of unknown function YGGT  30.14 
 
 
194 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0861  hypothetical protein  30.43 
 
 
88 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00343102  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0994  hypothetical protein  34.15 
 
 
92 aa  41.6  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0252519  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0477  hypothetical protein  34.33 
 
 
99 aa  41.2  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2479  protein of unknown function YGGT  36.51 
 
 
182 aa  40.8  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.619107  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1362  protein of unknown function YGGT  31.82 
 
 
86 aa  40.8  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3329  protein of unknown function YGGT  38.16 
 
 
98 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1433  hypothetical protein  31.17 
 
 
98 aa  40.8  0.007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.116879 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09931  hypothetical protein  32.43 
 
 
92 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0598  protein of unknown function YGGT  32.47 
 
 
96 aa  40.4  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000192983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>