33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0780 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0780  hypothetical protein  100 
 
 
85 aa  161  3e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0696156  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0482  YGGT family protein  47.22 
 
 
84 aa  72  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1036  protein of unknown function YGGT  40.3 
 
 
89 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000119033  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2059  hypothetical protein  38.46 
 
 
91 aa  53.5  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3999  ylmG protein  36.25 
 
 
87 aa  52  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000449706  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3725  protein of unknown function YGGT  45.61 
 
 
87 aa  52.4  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00556578  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1490  cell division membrane protein  41.18 
 
 
87 aa  51.6  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2547  protein of unknown function YGGT  38.81 
 
 
87 aa  50.4  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167983  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1242  ylmG protein  42.42 
 
 
87 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000199997  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3749  ylmG protein  43.94 
 
 
87 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0442014  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3640  hypothetical protein  43.94 
 
 
87 aa  49.7  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138235  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3657  hypothetical protein  43.94 
 
 
87 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.516535  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4037  hypothetical protein  43.94 
 
 
87 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000926366  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3912  ylmG protein  43.94 
 
 
87 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000638636 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1906  protein of unknown function YGGT  38.46 
 
 
90 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3950  ylmG protein  43.94 
 
 
87 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361919  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3943  ylmG protein  42.11 
 
 
87 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00794391  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1412  protein of unknown function YGGT  40.32 
 
 
186 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1192  protein of unknown function YGGT  38.6 
 
 
182 aa  42.7  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0499744  normal  0.653735 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1191  protein of unknown function YGGT  38.6 
 
 
182 aa  42.7  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0253033  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2479  protein of unknown function YGGT  38.6 
 
 
182 aa  42.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.619107  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1336  protein of unknown function YGGT  36.84 
 
 
182 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000680586  hitchhiker  0.0000219253 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3185  protein of unknown function YGGT  36.84 
 
 
182 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000491839  normal  0.0847291 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1199  cell division membrane protein  34.85 
 
 
98 aa  42.4  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3042  protein of unknown function YGGT  36.84 
 
 
182 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000245532  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2689  protein of unknown function YGGT  36.84 
 
 
182 aa  42.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.885228  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2862  protein of unknown function YGGT  35.09 
 
 
182 aa  41.6  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0177844  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1262  protein of unknown function YGGT  38.6 
 
 
182 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0091593  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2684  protein of unknown function YGGT  38.6 
 
 
184 aa  42  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000426882  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3355  hypothetical protein  36.84 
 
 
182 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3027  protein of unknown function YGGT  36.84 
 
 
182 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000050243  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0861  hypothetical protein  38.6 
 
 
88 aa  40.8  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00343102  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4152  protein of unknown function YGGT  39.29 
 
 
197 aa  40.4  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.762639 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>