185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4761 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4761  protein of unknown function YGGT  100 
 
 		 106 aa  203  7e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.211635 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3096  protein of unknown function YGGT  51.9 
 
 		 102 aa  88.2  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.669144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3527  hypothetical protein  49.37 
 
 		 99 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12787  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0053  protein of unknown function YGGT  42.39 
 
 		 99 aa  80.1  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.941254 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3938  protein of unknown function YGGT  54.17 
 
 		 95 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0057  protein of unknown function YGGT  53.42 
 
 		 96 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2655  protein of unknown function YGGT  42.86 
 
 		 101 aa  77.8  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0666885  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0271  hypothetical protein  41.67 
 
 		 96 aa  77.4  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4038  protein of unknown function YGGT  49.32 
 
 		 96 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.5468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3782  protein of unknown function YGGT  47.95 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.402098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4076  protein of unknown function YGGT  47.95 
 
 		 96 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2870  protein of unknown function YGGT  48.19 
 
 		 101 aa  75.9  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388606 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0607  protein of unknown function YGGT  45.92 
 
 		 96 aa  74.7  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0478  hypothetical protein  45.92 
 
 		 96 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2973  protein of unknown function YGGT  42.86 
 
 		 107 aa  74.7  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0989  protein of unknown function YGGT  48.68 
 
 		 114 aa  74.3  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0508  protein of unknown function YGGT  48.65 
 
 		 96 aa  74.3  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.842199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3706  protein of unknown function YGGT  44.16 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.535312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4152  hypothetical protein  56.45 
 
 		 96 aa  70.5  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1917  protein of unknown function YGGT  39.36 
 
 		 102 aa  70.1  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.951257  normal  0.340645 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0261  YGGT family protein  47.83 
 
 		 92 aa  68.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.634053  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0438  protein of unknown function YGGT  47.83 
 
 		 92 aa  68.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112129 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4027  protein of unknown function YGGT  47.14 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1918  YGGT family protein  45.71 
 
 		 194 aa  67.8  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1992  YGGT family protein  50.88 
 
 		 96 aa  66.6  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4464  protein of unknown function YGGT  51.67 
 
 		 100 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.338351 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0110  hypothetical protein  47.22 
 
 		 119 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0365579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0692  protein of unknown function YGGT  47.22 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3629  protein of unknown function YGGT  54.17 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2879  protein of unknown function YGGT  44.16 
 
 		 96 aa  64.3  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.147865 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0419  protein of unknown function YGGT  45.83 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3372  protein of unknown function YGGT  46.55 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1370  protein of unknown function YGGT  50.98 
 
 		 100 aa  62.8  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3568  protein of unknown function YGGT  47.46 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0327  yggt family protein  45.83 
 
 		 97 aa  60.8  0.000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3335  protein of unknown function YGGT  35.8 
 
 		 95 aa  60.1  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.982716 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5096  hypothetical protein  39.58 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5146  protein of unknown function YGGT  39.58 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.605809  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4969  protein of unknown function YGGT  38.54 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0369  protein of unknown function YGGT  38.54 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1838  hypothetical protein  38.82 
 
 		 189 aa  57.4  0.00000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000231673  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0018  protein of unknown function YGGT  35.8 
 
 		 95 aa  57  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.292831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1360  hypothetical protein  40.98 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0341  protein of unknown function YGGT  35.8 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0028  protein of unknown function YGGT  40.98 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.242413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1838  protein of unknown function YGGT  38.1 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3299  protein of unknown function YGGT  41.82 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0121  YGGT family protein  33.33 
 
 		 92 aa  53.5  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1165  protein of unknown function YGGT  32.38 
 
 		 105 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000835508  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0547  protein of unknown function YGGT  37.97 
 
 		 180 aa  52.8  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3999  ylmG protein  35.37 
 
 		 87 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000449706  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2689  protein of unknown function YGGT  38.46 
 
 		 182 aa  51.6  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.885228  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1242  ylmG protein  34.15 
 
 		 87 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000199997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3001  hypothetical protein  36.71 
 
 		 187 aa  50.8  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1027  protein of unknown function YGGT  30.49 
 
 		 98 aa  50.4  0.000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1093  protein of unknown function YGGT  30.49 
 
 		 98 aa  50.4  0.000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.869762  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0866  YGGT family protein  35.87 
 
 		 104 aa  49.7  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2547  protein of unknown function YGGT  39.13 
 
 		 87 aa  48.9  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167983  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3355  hypothetical protein  36.36 
 
 		 182 aa  48.5  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2660  hypothetical protein  34.57 
 
 		 109 aa  48.1  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3720  protein of unknown function YGGT  30.77 
 
 		 180 aa  48.1  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1191  protein of unknown function YGGT  40.85 
 
 		 182 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0253033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0956  protein of unknown function YGGT  43.75 
 
 		 89 aa  48.5  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00321355  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1192  protein of unknown function YGGT  40.85 
 
 		 182 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0499744  normal  0.653735 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1166  protein of unknown function YGGT  35.16 
 
 		 105 aa  48.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866748  hitchhiker  0.00575832 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08930  YGGT family protein  47.92 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.384516  hitchhiker  0.0000000251444 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3943  ylmG protein  40.32 
 
 		 87 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00794391  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5573  hypothetical protein  36.84 
 
 		 187 aa  47.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364539  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1262  protein of unknown function YGGT  39.44 
 
 		 182 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0091593  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3749  ylmG protein  40.32 
 
 		 87 aa  47.8  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0442014  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3640  hypothetical protein  40.32 
 
 		 87 aa  47.8  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138235  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3657  hypothetical protein  40.32 
 
 		 87 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.516535  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3912  ylmG protein  40.32 
 
 		 87 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000638636 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5321  hypothetical protein  42.86 
 
 		 196 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1336  protein of unknown function YGGT  38.03 
 
 		 182 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000680586  hitchhiker  0.0000219253 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4037  hypothetical protein  40.32 
 
 		 87 aa  47.8  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000926366  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1036  protein of unknown function YGGT  36.49 
 
 		 89 aa  47.4  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000119033  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3950  ylmG protein  40.32 
 
 		 87 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361919  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3185  protein of unknown function YGGT  38.03 
 
 		 182 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000491839  normal  0.0847291 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3027  protein of unknown function YGGT  38.03 
 
 		 182 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000050243  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3042  protein of unknown function YGGT  38.03 
 
 		 182 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000245532  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1212  protein of unknown function YGGT  37.84 
 
 		 182 aa  47.4  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0177861 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1230  protein of unknown function YGGT  36.62 
 
 		 182 aa  47.4  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000825612  normal  0.409234 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03300  hypothetical protein  32.05 
 
 		 178 aa  47  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08491  integral membrane protein  35.29 
 
 		 102 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.321113  hitchhiker  0.00153658 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0339  protein of unknown function YGGT  33.65 
 
 		 192 aa  47  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0415  protein of unknown function YGGT  37.36 
 
 		 107 aa  46.2  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000337721  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1199  cell division membrane protein  31.11 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0714  protein of unknown function YGGT  48.98 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.674624  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1971  protein of unknown function YGGT  43.64 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.188366 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5048  YGGT family protein  41.43 
 
 		 196 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710638  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0475  hypothetical protein  41.43 
 
 		 196 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3725  protein of unknown function YGGT  39.34 
 
 		 87 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00556578  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2684  protein of unknown function YGGT  38.03 
 
 		 184 aa  45.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000426882  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1018  protein of unknown function YGGT  34.94 
 
 		 85 aa  45.4  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3329  protein of unknown function YGGT  44 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1534  YGGT family protein  35.37 
 
 		 192 aa  45.1  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.460678  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3111  hypothetical protein  36.49 
 
 		 213 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3056  protein of unknown function YGGT  32.94 
 
 		 196 aa  45.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.502077  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4152  protein of unknown function YGGT  34.09 
 
 		 197 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.762639 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>