65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2660 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2660  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  217  5e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3335  protein of unknown function YGGT  65.48 
 
 		 95 aa  106  9.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.982716 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0341  protein of unknown function YGGT  60.44 
 
 		 124 aa  103  6e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0018  protein of unknown function YGGT  57.14 
 
 		 95 aa  95.1  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.292831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1360  hypothetical protein  54.65 
 
 		 101 aa  94.7  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0028  protein of unknown function YGGT  55.95 
 
 		 96 aa  93.6  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.242413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3096  protein of unknown function YGGT  41.18 
 
 		 102 aa  80.9  0.000000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.669144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2870  protein of unknown function YGGT  44.3 
 
 		 101 aa  72.8  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388606 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2973  protein of unknown function YGGT  34.69 
 
 		 107 aa  70.1  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0053  protein of unknown function YGGT  35.9 
 
 		 99 aa  65.1  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.941254 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0989  protein of unknown function YGGT  33.01 
 
 		 114 aa  64.7  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4761  protein of unknown function YGGT  34.57 
 
 		 106 aa  60.8  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.211635 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0057  protein of unknown function YGGT  35.42 
 
 		 96 aa  60.1  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0508  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.842199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0607  protein of unknown function YGGT  41.1 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3299  protein of unknown function YGGT  43.4 
 
 		 99 aa  58.2  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0478  hypothetical protein  39.73 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0271  hypothetical protein  35.06 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3706  protein of unknown function YGGT  35.42 
 
 		 103 aa  57  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.535312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2879  protein of unknown function YGGT  39.66 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.147865 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1918  YGGT family protein  34.07 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4027  protein of unknown function YGGT  35.87 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483363  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1992  YGGT family protein  34.07 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1370  protein of unknown function YGGT  44.23 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4152  hypothetical protein  35.16 
 
 		 96 aa  51.6  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3527  hypothetical protein  37.7 
 
 		 99 aa  51.6  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12787  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0369  protein of unknown function YGGT  32.41 
 
 		 196 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0110  hypothetical protein  36 
 
 		 119 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0365579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2921  protein of unknown function YGGT  34.48 
 
 		 184 aa  50.4  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.317852  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3568  protein of unknown function YGGT  36.21 
 
 		 96 aa  50.4  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4969  protein of unknown function YGGT  31.48 
 
 		 196 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5096  hypothetical protein  31.48 
 
 		 196 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5146  protein of unknown function YGGT  31.48 
 
 		 196 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.605809  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3938  protein of unknown function YGGT  32.81 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4076  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3782  protein of unknown function YGGT  31.75 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.402098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4464  protein of unknown function YGGT  38.89 
 
 		 100 aa  47  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.338351 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0692  protein of unknown function YGGT  36.92 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0339  protein of unknown function YGGT  38.46 
 
 		 192 aa  46.2  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4038  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 		 96 aa  47  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.5468  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03060  hypothetical protein  34.21 
 
 		 197 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479202  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0211  protein of unknown function YGGT  34.09 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0891  YGGT family protein  35.23 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0499141  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0419  protein of unknown function YGGT  36.92 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2655  protein of unknown function YGGT  29.03 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0666885  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0261  YGGT family protein  37.66 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.634053  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0438  protein of unknown function YGGT  37.66 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112129 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0327  yggt family protein  29.07 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4152  protein of unknown function YGGT  28.09 
 
 		 197 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.762639 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3720  protein of unknown function YGGT  30.48 
 
 		 180 aa  43.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3372  protein of unknown function YGGT  32.31 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5321  hypothetical protein  34.62 
 
 		 196 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0758  protein of unknown function YGGT  32.18 
 
 		 184 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1412  protein of unknown function YGGT  31.25 
 
 		 186 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4865  protein of unknown function YGGT  30.49 
 
 		 181 aa  42  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.150685 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05130  hypothetical protein  35.71 
 
 		 197 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.409368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3629  protein of unknown function YGGT  32.81 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1917  protein of unknown function YGGT  35.94 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.951257  normal  0.340645 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1212  protein of unknown function YGGT  33.75 
 
 		 182 aa  41.6  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0177861 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3452  hypothetical protein  33.33 
 
 		 184 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0294828  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0492  hypothetical protein  34.29 
 
 		 197 aa  41.2  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0773  protein of unknown function YGGT  33.73 
 
 		 184 aa  41.6  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.148544  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5048  YGGT family protein  30.77 
 
 		 196 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710638  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0475  hypothetical protein  30.77 
 
 		 196 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0541  membrane protein, related to K+ transport  32.1 
 
 		 184 aa  40  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.182958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>