112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3299 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_3299  protein of unknown function YGGT  100 
 
 		 99 aa  186  7e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3096  protein of unknown function YGGT  47.78 
 
 		 102 aa  84.3  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.669144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2870  protein of unknown function YGGT  47.06 
 
 		 101 aa  80.9  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388606 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2879  protein of unknown function YGGT  58.62 
 
 		 96 aa  75.5  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.147865 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0053  protein of unknown function YGGT  49.33 
 
 		 99 aa  74.3  0.0000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.941254 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2973  protein of unknown function YGGT  38.64 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3527  hypothetical protein  44.32 
 
 		 99 aa  70.5  0.000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12787  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0341  protein of unknown function YGGT  38.37 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3568  protein of unknown function YGGT  54.24 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0508  protein of unknown function YGGT  54.55 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.842199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0989  protein of unknown function YGGT  44 
 
 		 114 aa  62  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3938  protein of unknown function YGGT  42.67 
 
 		 95 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0607  protein of unknown function YGGT  49.21 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4038  protein of unknown function YGGT  42.86 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.5468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3706  protein of unknown function YGGT  35.87 
 
 		 103 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.535312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0478  hypothetical protein  47.62 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3782  protein of unknown function YGGT  41.43 
 
 		 103 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.402098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4076  protein of unknown function YGGT  41.43 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0271  hypothetical protein  46.97 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1370  protein of unknown function YGGT  52.94 
 
 		 100 aa  58.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1918  YGGT family protein  41.43 
 
 		 194 aa  57.8  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0057  protein of unknown function YGGT  52.73 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1360  hypothetical protein  29.67 
 
 		 101 aa  57.4  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0028  protein of unknown function YGGT  29.67 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.242413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0018  protein of unknown function YGGT  29.67 
 
 		 95 aa  57.4  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.292831  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1992  YGGT family protein  41.43 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2660  hypothetical protein  41.07 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4027  protein of unknown function YGGT  38.36 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4464  protein of unknown function YGGT  44.78 
 
 		 100 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.338351 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3335  protein of unknown function YGGT  27.59 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.982716 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4761  protein of unknown function YGGT  36.11 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.211635 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4152  hypothetical protein  44.29 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1917  protein of unknown function YGGT  45.9 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.951257  normal  0.340645 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0327  yggt family protein  34.74 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0692  protein of unknown function YGGT  46.55 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2426  protein of unknown function YGGT  38.67 
 
 		 187 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0110  hypothetical protein  44.83 
 
 		 119 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0365579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3629  protein of unknown function YGGT  43.84 
 
 		 95 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3042  hypothetical protein  45 
 
 		 180 aa  48.5  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.390306  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0121  YGGT family protein  31.71 
 
 		 92 aa  47.8  0.00005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2655  protein of unknown function YGGT  35.44 
 
 		 101 aa  47.8  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0666885  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0339  protein of unknown function YGGT  28.57 
 
 		 192 aa  47.4  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0419  protein of unknown function YGGT  43.1 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3372  protein of unknown function YGGT  40 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1658  integral membrane protein  62.07 
 
 		 185 aa  46.2  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000025742  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0956  protein of unknown function YGGT  25.58 
 
 		 89 aa  46.2  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00321355  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03060  hypothetical protein  31.82 
 
 		 197 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479202  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2684  protein of unknown function YGGT  32.22 
 
 		 184 aa  45.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000426882  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0178  protein of unknown function YGGT  48.78 
 
 		 189 aa  45.4  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00798567  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0773  protein of unknown function YGGT  35.21 
 
 		 184 aa  46.2  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.148544  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3655  protein of unknown function YGGT  43.18 
 
 		 199 aa  45.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02782  predicted inner membrane protein  55 
 
 		 188 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.104199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0743  protein of unknown function YGGT  55 
 
 		 188 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0166  hypothetical protein  48.78 
 
 		 189 aa  45.4  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000107926  hitchhiker  0.0000185577 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0020  protein of unknown function YGGT  37.66 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.310945  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3358  protein of unknown function YGGT  38.46 
 
 		 188 aa  45.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0016989 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2689  protein of unknown function YGGT  37.1 
 
 		 182 aa  45.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.885228  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3112  YGGT family protein  55 
 
 		 188 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3296  YGGT family protein  55 
 
 		 188 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02745  hypothetical protein  55 
 
 		 188 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.090594  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0762  protein of unknown function YGGT  55 
 
 		 188 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000437553 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3094  YGGT family protein  55 
 
 		 188 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000274597 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3384  YGGT family protein  55 
 
 		 188 aa  45.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4255  YGGT family protein  55 
 
 		 188 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.809329  normal  0.660406 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3643  protein of unknown function YGGT  30.93 
 
 		 196 aa  44.3  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3027  protein of unknown function YGGT  39.29 
 
 		 182 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000050243  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3042  protein of unknown function YGGT  39.29 
 
 		 182 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000245532  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3185  protein of unknown function YGGT  39.29 
 
 		 182 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000491839  normal  0.0847291 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1336  protein of unknown function YGGT  39.29 
 
 		 182 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000680586  hitchhiker  0.0000219253 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3056  protein of unknown function YGGT  34.67 
 
 		 196 aa  43.9  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.502077  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02073  hypothetical protein  33.78 
 
 		 183 aa  43.9  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.616502 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3355  hypothetical protein  37.1 
 
 		 182 aa  43.9  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0615  hypothetical protein  35.48 
 
 		 93 aa  43.5  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.8017800000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0534  protein of unknown function YGGT  40.43 
 
 		 194 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4152  protein of unknown function YGGT  38.46 
 
 		 197 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.762639 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0758  protein of unknown function YGGT  51.28 
 
 		 184 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5573  hypothetical protein  38.98 
 
 		 187 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364539  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0211  protein of unknown function YGGT  29.76 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1191  protein of unknown function YGGT  35.48 
 
 		 182 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0253033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1262  protein of unknown function YGGT  35.71 
 
 		 182 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0091593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1192  protein of unknown function YGGT  35.48 
 
 		 182 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0499744  normal  0.653735 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0140  YggT family membrane protein  35.42 
 
 		 184 aa  42.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00236591 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3609  protein of unknown function YGGT  34.09 
 
 		 189 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3264  YGGT family protein  77.27 
 
 		 188 aa  42  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0933  protein of unknown function YGGT  50 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0945487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0891  YGGT family protein  31.76 
 
 		 94 aa  42  0.003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0499141  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0994  hypothetical protein  36.92 
 
 		 92 aa  42  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0252519  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0338  protein of unknown function YGGT  37.04 
 
 		 188 aa  42  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171919  hitchhiker  0.00000000521514 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4199  protein of unknown function YGGT  30.77 
 
 		 186 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4032  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 		 184 aa  41.6  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886825 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4087  protein of unknown function YGGT  30.77 
 
 		 186 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3348  YGGT family protein  77.27 
 
 		 188 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.299187  normal  0.126614 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3340  YGGT family protein  77.27 
 
 		 188 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.350216 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3275  YGGT family protein  77.27 
 
 		 188 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0250228 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3444  YGGT family protein  77.27 
 
 		 188 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.119003 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1838  hypothetical protein  28.57 
 
 		 189 aa  41.6  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000231673  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2188  integral membrane protein  33.85 
 
 		 193 aa  41.6  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.199645  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2214  hypothetical protein  33.85 
 
 		 192 aa  41.6  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107485  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0369  protein of unknown function YGGT  28.28 
 
 		 196 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2921  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 		 184 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.317852  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>