208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1370 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1370  protein of unknown function YGGT  100 
 
 		 100 aa  187  4e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3527  hypothetical protein  59.09 
 
 		 99 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12787  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0508  protein of unknown function YGGT  55.06 
 
 		 96 aa  103  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.842199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0057  protein of unknown function YGGT  52.81 
 
 		 96 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0989  protein of unknown function YGGT  55.17 
 
 		 114 aa  100  8e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0478  hypothetical protein  51.69 
 
 		 96 aa  95.1  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0607  protein of unknown function YGGT  51.69 
 
 		 96 aa  95.5  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1918  YGGT family protein  60.27 
 
 		 194 aa  90.9  5e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1992  YGGT family protein  60.27 
 
 		 96 aa  89.4  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0271  hypothetical protein  47.73 
 
 		 96 aa  89  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3782  protein of unknown function YGGT  57.95 
 
 		 103 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.402098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4076  protein of unknown function YGGT  57.95 
 
 		 96 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4038  protein of unknown function YGGT  56.82 
 
 		 96 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.5468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3096  protein of unknown function YGGT  48.78 
 
 		 102 aa  84.3  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.669144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3568  protein of unknown function YGGT  60.32 
 
 		 96 aa  84  7e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0053  protein of unknown function YGGT  57.97 
 
 		 99 aa  82.4  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.941254 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2870  protein of unknown function YGGT  50.65 
 
 		 101 aa  81.6  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388606 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3706  protein of unknown function YGGT  56.16 
 
 		 103 aa  81.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.535312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3938  protein of unknown function YGGT  54.67 
 
 		 95 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2879  protein of unknown function YGGT  62.16 
 
 		 96 aa  79.7  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.147865 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4152  hypothetical protein  53.42 
 
 		 96 aa  79.7  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0692  protein of unknown function YGGT  52.81 
 
 		 96 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0419  protein of unknown function YGGT  53.93 
 
 		 96 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4027  protein of unknown function YGGT  54.79 
 
 		 96 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4761  protein of unknown function YGGT  45.68 
 
 		 106 aa  78.2  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.211635 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0110  hypothetical protein  52.81 
 
 		 119 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0365579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2973  protein of unknown function YGGT  44.05 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0327  yggt family protein  47.56 
 
 		 97 aa  77  0.00000000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4464  protein of unknown function YGGT  54.29 
 
 		 100 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.338351 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1917  protein of unknown function YGGT  48.72 
 
 		 102 aa  75.5  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.951257  normal  0.340645 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3372  protein of unknown function YGGT  54.41 
 
 		 96 aa  74.3  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2655  protein of unknown function YGGT  46.48 
 
 		 101 aa  71.6  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0666885  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3629  protein of unknown function YGGT  56 
 
 		 95 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0341  protein of unknown function YGGT  35.79 
 
 		 124 aa  67  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0018  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 		 95 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.292831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1360  hypothetical protein  33.33 
 
 		 101 aa  61.6  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3299  protein of unknown function YGGT  50.77 
 
 		 99 aa  61.6  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0028  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.242413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0534  protein of unknown function YGGT  35.9 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3335  protein of unknown function YGGT  31.52 
 
 		 95 aa  58.9  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.982716 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5321  hypothetical protein  36.9 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_002978  WD0121  YGGT family protein  33.71 
 
 		 92 aa  55.1  0.0000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1212  protein of unknown function YGGT  36.71 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0177861 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3358  protein of unknown function YGGT  46.15 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0016989 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0866  YGGT family protein  36.36 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5048  YGGT family protein  40.58 
 
 		 196 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710638  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2479  protein of unknown function YGGT  39.51 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.619107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1165  protein of unknown function YGGT  38.16 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000835508  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0475  hypothetical protein  40.58 
 
 		 196 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03060  hypothetical protein  35.23 
 
 		 197 aa  54.3  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479202  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1230  protein of unknown function YGGT  34.74 
 
 		 182 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000825612  normal  0.409234 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0339  protein of unknown function YGGT  37.18 
 
 		 192 aa  53.9  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1166  protein of unknown function YGGT  34.41 
 
 		 105 aa  53.5  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866748  hitchhiker  0.00575832 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2660  hypothetical protein  38.46 
 
 		 109 aa  53.5  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3720  protein of unknown function YGGT  35.8 
 
 		 180 aa  53.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1135  protein of unknown function YGGT  32.98 
 
 		 182 aa  53.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000824226  normal  0.525534 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5573  hypothetical protein  44.62 
 
 		 187 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364539  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2684  protein of unknown function YGGT  39.74 
 
 		 184 aa  52  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000426882  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0492  hypothetical protein  34.09 
 
 		 197 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0947  protein of unknown function YGGT  37.33 
 
 		 192 aa  52  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.618723  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2862  protein of unknown function YGGT  37.18 
 
 		 182 aa  51.2  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0177844  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3609  protein of unknown function YGGT  33.72 
 
 		 189 aa  51.2  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4969  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 		 196 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1658  integral membrane protein  34.44 
 
 		 185 aa  51.2  0.000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000025742  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1125  protein of unknown function YGGT  32.63 
 
 		 182 aa  51.2  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000165213  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0541  membrane protein, related to K+ transport  33.67 
 
 		 184 aa  50.8  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.182958  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05130  hypothetical protein  32.95 
 
 		 197 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.409368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5146  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 		 196 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.605809  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3749  ylmG protein  37.5 
 
 		 87 aa  50.8  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0442014  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3640  hypothetical protein  37.5 
 
 		 87 aa  50.8  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138235  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3657  hypothetical protein  37.5 
 
 		 87 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.516535  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3912  ylmG protein  37.5 
 
 		 87 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000638636 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4037  hypothetical protein  37.5 
 
 		 87 aa  50.8  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000926366  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3950  ylmG protein  37.5 
 
 		 87 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361919  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5096  hypothetical protein  32.26 
 
 		 196 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4152  protein of unknown function YGGT  39.68 
 
 		 197 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.762639 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3943  ylmG protein  36.47 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00794391  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2724  protein of unknown function YGGT  31.71 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1492  protein of unknown function YGGT  31.71 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290091  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0615  hypothetical protein  32.56 
 
 		 93 aa  49.7  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.8017800000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1191  protein of unknown function YGGT  32.61 
 
 		 182 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0253033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0369  protein of unknown function YGGT  31.18 
 
 		 196 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758714  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02782  predicted inner membrane protein  40.3 
 
 		 188 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.104199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0743  protein of unknown function YGGT  40.3 
 
 		 188 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3384  YGGT family protein  40.3 
 
 		 188 aa  49.3  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3355  hypothetical protein  34.78 
 
 		 182 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3185  protein of unknown function YGGT  32.98 
 
 		 182 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000491839  normal  0.0847291 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0762  protein of unknown function YGGT  40.3 
 
 		 188 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000437553 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3296  YGGT family protein  40.3 
 
 		 188 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3042  protein of unknown function YGGT  32.98 
 
 		 182 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000245532  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0891  YGGT family protein  36.26 
 
 		 94 aa  48.9  0.00002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0499141  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3094  YGGT family protein  40.3 
 
 		 188 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000274597 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4255  YGGT family protein  40.3 
 
 		 188 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.809329  normal  0.660406 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1262  protein of unknown function YGGT  31.52 
 
 		 182 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0091593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1336  protein of unknown function YGGT  32.98 
 
 		 182 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000680586  hitchhiker  0.0000219253 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1192  protein of unknown function YGGT  34.78 
 
 		 182 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0499744  normal  0.653735 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3112  YGGT family protein  40.3 
 
 		 188 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02745  hypothetical protein  40.3 
 
 		 188 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.090594  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2689  protein of unknown function YGGT  32.61 
 
 		 182 aa  48.9  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.885228  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0011  hypothetical protein  35.71 
 
 		 185 aa  49.3  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>