202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2879 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2879  protein of unknown function YGGT  100 
 
 		 96 aa  181  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.147865 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0508  protein of unknown function YGGT  56.25 
 
 		 96 aa  113  8.999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.842199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0057  protein of unknown function YGGT  53.12 
 
 		 96 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0478  hypothetical protein  53.12 
 
 		 96 aa  96.3  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0607  protein of unknown function YGGT  53.12 
 
 		 96 aa  96.3  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3568  protein of unknown function YGGT  68.83 
 
 		 96 aa  96.7  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3096  protein of unknown function YGGT  49.44 
 
 		 102 aa  94.4  5e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.669144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0271  hypothetical protein  48.42 
 
 		 96 aa  91.3  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0989  protein of unknown function YGGT  50.54 
 
 		 114 aa  90.5  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2870  protein of unknown function YGGT  53.33 
 
 		 101 aa  90.1  9e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388606 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3527  hypothetical protein  47.06 
 
 		 99 aa  84  6e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12787  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0110  hypothetical protein  54.17 
 
 		 119 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0365579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0419  protein of unknown function YGGT  54.17 
 
 		 96 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0692  protein of unknown function YGGT  53.12 
 
 		 96 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4027  protein of unknown function YGGT  50.53 
 
 		 96 aa  80.9  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2973  protein of unknown function YGGT  40.86 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1918  YGGT family protein  56.34 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4038  protein of unknown function YGGT  50.57 
 
 		 96 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.5468  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1992  YGGT family protein  56.16 
 
 		 96 aa  78.2  0.00000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4076  protein of unknown function YGGT  50.68 
 
 		 96 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3782  protein of unknown function YGGT  50.68 
 
 		 103 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.402098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0053  protein of unknown function YGGT  51.35 
 
 		 99 aa  77.4  0.00000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.941254 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3938  protein of unknown function YGGT  53.33 
 
 		 95 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3299  protein of unknown function YGGT  57.38 
 
 		 99 aa  76.3  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4152  hypothetical protein  50.54 
 
 		 96 aa  75.9  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3706  protein of unknown function YGGT  53.42 
 
 		 103 aa  74.7  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.535312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3335  protein of unknown function YGGT  38.3 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.982716 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1370  protein of unknown function YGGT  66.67 
 
 		 100 aa  71.2  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0341  protein of unknown function YGGT  40.43 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4464  protein of unknown function YGGT  50 
 
 		 100 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.338351 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1360  hypothetical protein  35.42 
 
 		 101 aa  71.2  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0327  yggt family protein  41.38 
 
 		 97 aa  70.9  0.000000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0018  protein of unknown function YGGT  35.11 
 
 		 95 aa  70.5  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.292831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3372  protein of unknown function YGGT  55.88 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0028  protein of unknown function YGGT  34.38 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.242413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4761  protein of unknown function YGGT  44.59 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.211635 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1917  protein of unknown function YGGT  41.3 
 
 		 102 aa  67.8  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.951257  normal  0.340645 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3629  protein of unknown function YGGT  53.33 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0121  YGGT family protein  35.56 
 
 		 92 aa  61.2  0.000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2655  protein of unknown function YGGT  42.86 
 
 		 101 aa  61.2  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0666885  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0866  YGGT family protein  38.3 
 
 		 104 aa  60.1  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0339  protein of unknown function YGGT  42.31 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1165  protein of unknown function YGGT  35.79 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000835508  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2660  hypothetical protein  40 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3358  protein of unknown function YGGT  46.15 
 
 		 188 aa  53.9  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0016989 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3109  hypothetical protein  36.46 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1166  protein of unknown function YGGT  32.22 
 
 		 105 aa  52  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866748  hitchhiker  0.00575832 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0534  protein of unknown function YGGT  35.63 
 
 		 194 aa  52.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0615  hypothetical protein  31.03 
 
 		 93 aa  51.2  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.8017800000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3609  protein of unknown function YGGT  39.19 
 
 		 189 aa  50.4  0.000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3665  YGGT family protein  43.66 
 
 		 181 aa  49.7  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.688821  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1433  hypothetical protein  33.7 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.116879 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2921  protein of unknown function YGGT  38.36 
 
 		 184 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.317852  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03060  hypothetical protein  35.37 
 
 		 197 aa  49.7  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479202  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0994  hypothetical protein  35.63 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0252519  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02782  predicted inner membrane protein  42.65 
 
 		 188 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.104199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0743  protein of unknown function YGGT  42.65 
 
 		 188 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3384  YGGT family protein  42.65 
 
 		 188 aa  49.3  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3094  YGGT family protein  42.65 
 
 		 188 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000274597 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3112  YGGT family protein  42.65 
 
 		 188 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3296  YGGT family protein  42.65 
 
 		 188 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4255  YGGT family protein  42.65 
 
 		 188 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.809329  normal  0.660406 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3054  protein of unknown function YGGT  42.86 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.649035  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0762  protein of unknown function YGGT  42.65 
 
 		 188 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000437553 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02745  hypothetical protein  42.65 
 
 		 188 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.090594  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0947  protein of unknown function YGGT  40.51 
 
 		 192 aa  48.9  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.618723  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1665  protein of unknown function YGGT  37.23 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.905288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4152  protein of unknown function YGGT  34.83 
 
 		 197 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.762639 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4969  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 		 196 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0891  YGGT family protein  33.7 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0499141  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3720  protein of unknown function YGGT  38.96 
 
 		 180 aa  48.5  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5146  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 		 196 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.605809  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0492  hypothetical protein  36.59 
 
 		 197 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0211  protein of unknown function YGGT  33.7 
 
 		 94 aa  48.1  0.00004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09491  hypothetical protein  33.72 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.291422  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5096  hypothetical protein  32.26 
 
 		 196 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1906  protein of unknown function YGGT  35 
 
 		 90 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5573  hypothetical protein  35.96 
 
 		 187 aa  47.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364539  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5321  hypothetical protein  37.8 
 
 		 196 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5048  YGGT family protein  36.59 
 
 		 196 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710638  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0475  hypothetical protein  36.59 
 
 		 196 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2724  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 		 109 aa  47.4  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2110  protein of unknown function YGGT  34.25 
 
 		 191 aa  47.8  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0369  protein of unknown function YGGT  32.26 
 
 		 196 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05130  hypothetical protein  35.37 
 
 		 197 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.409368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1492  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 		 109 aa  47.4  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290091  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3642  hypothetical protein  35.06 
 
 		 202 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0493  protein of unknown function YGGT  32.5 
 
 		 92 aa  47.4  0.00007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.197871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0890  hypothetical protein  30.43 
 
 		 92 aa  47  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3637  protein of unknown function YGGT  36.67 
 
 		 94 aa  47  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.160206  normal  0.479955 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09511  hypothetical protein  30.43 
 
 		 92 aa  47  0.00008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.545335  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0828  YggT family membrane protein  36.9 
 
 		 184 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.52765  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0829  protein of unknown function YGGT  36.9 
 
 		 184 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09931  hypothetical protein  29.35 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1036  protein of unknown function YGGT  35 
 
 		 89 aa  45.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000119033  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1230  protein of unknown function YGGT  37.97 
 
 		 182 aa  45.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000825612  normal  0.409234 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3001  hypothetical protein  31.76 
 
 		 187 aa  45.4  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0149  protein of unknown function YGGT  35.56 
 
 		 100 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.041214 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4032  protein of unknown function YGGT  37.5 
 
 		 184 aa  46.2  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886825 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1658  integral membrane protein  37.97 
 
 		 185 aa  45.4  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000025742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>