88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0018 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0018  protein of unknown function YGGT  100 
 
 		 95 aa  184  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.292831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1360  hypothetical protein  97.89 
 
 		 101 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0028  protein of unknown function YGGT  97.89 
 
 		 96 aa  181  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.242413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3335  protein of unknown function YGGT  77.89 
 
 		 95 aa  144  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.982716 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0341  protein of unknown function YGGT  69.15 
 
 		 124 aa  135  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2660  hypothetical protein  61.54 
 
 		 109 aa  83.2  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3096  protein of unknown function YGGT  46.91 
 
 		 102 aa  75.5  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.669144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2973  protein of unknown function YGGT  41.3 
 
 		 107 aa  74.7  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3527  hypothetical protein  36.78 
 
 		 99 aa  64.7  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12787  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0478  hypothetical protein  39.73 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0057  protein of unknown function YGGT  38.1 
 
 		 96 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0989  protein of unknown function YGGT  39.51 
 
 		 114 aa  64.3  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0607  protein of unknown function YGGT  38.36 
 
 		 96 aa  62  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3938  protein of unknown function YGGT  37.33 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0271  hypothetical protein  34.04 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2870  protein of unknown function YGGT  40.26 
 
 		 101 aa  60.8  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388606 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0327  yggt family protein  35.29 
 
 		 97 aa  60.5  0.000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2879  protein of unknown function YGGT  43.33 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.147865 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0508  protein of unknown function YGGT  31.03 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.842199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0053  protein of unknown function YGGT  35.14 
 
 		 99 aa  60.1  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.941254 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4076  protein of unknown function YGGT  34.25 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3782  protein of unknown function YGGT  34.25 
 
 		 103 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.402098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0692  protein of unknown function YGGT  39.71 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1918  YGGT family protein  38.36 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1992  YGGT family protein  38.36 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4038  protein of unknown function YGGT  32.88 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.5468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1166  protein of unknown function YGGT  42.86 
 
 		 105 aa  57  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866748  hitchhiker  0.00575832 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4761  protein of unknown function YGGT  35.8 
 
 		 106 aa  57  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.211635 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4464  protein of unknown function YGGT  40.74 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.338351 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4027  protein of unknown function YGGT  36.99 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483363  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0866  YGGT family protein  40.48 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0419  protein of unknown function YGGT  38.24 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1165  protein of unknown function YGGT  41.18 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000835508  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3299  protein of unknown function YGGT  35.38 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1917  protein of unknown function YGGT  36.84 
 
 		 102 aa  53.9  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.951257  normal  0.340645 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3568  protein of unknown function YGGT  35 
 
 		 96 aa  53.5  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3706  protein of unknown function YGGT  33.68 
 
 		 103 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.535312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0110  hypothetical protein  38.24 
 
 		 119 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0365579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4152  hypothetical protein  34.78 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1370  protein of unknown function YGGT  33.78 
 
 		 100 aa  52  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1838  protein of unknown function YGGT  39.08 
 
 		 183 aa  51.6  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2655  protein of unknown function YGGT  34.48 
 
 		 101 aa  51.2  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0666885  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1492  protein of unknown function YGGT  35.71 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290091  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2724  protein of unknown function YGGT  35.71 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0020  protein of unknown function YGGT  38.96 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.310945  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0339  protein of unknown function YGGT  34.41 
 
 		 192 aa  49.7  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0415  protein of unknown function YGGT  32.14 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000337721  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03060  hypothetical protein  32.97 
 
 		 197 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479202  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0178  protein of unknown function YGGT  33.73 
 
 		 189 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00798567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0166  hypothetical protein  32.53 
 
 		 189 aa  47.4  0.00007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000107926  hitchhiker  0.0000185577 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1433  hypothetical protein  26.6 
 
 		 98 aa  47  0.00009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.116879 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1838  hypothetical protein  32.22 
 
 		 189 aa  47  0.00009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000231673  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3629  protein of unknown function YGGT  36 
 
 		 95 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0121  YGGT family protein  29.73 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3001  hypothetical protein  33.33 
 
 		 187 aa  45.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3372  protein of unknown function YGGT  35.29 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15401  hypothetical protein  29.03 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.393994 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1018  protein of unknown function YGGT  34.57 
 
 		 85 aa  44.7  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3842  protein of unknown function YGGT  36.05 
 
 		 84 aa  43.9  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0891  YGGT family protein  33.75 
 
 		 94 aa  43.9  0.0008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0499141  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5321  hypothetical protein  34.07 
 
 		 196 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0211  protein of unknown function YGGT  35 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0956  protein of unknown function YGGT  35.48 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00321355  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05130  hypothetical protein  30.77 
 
 		 197 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.409368  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1412  protein of unknown function YGGT  31.46 
 
 		 186 aa  42.7  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0475  hypothetical protein  30.77 
 
 		 196 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3056  protein of unknown function YGGT  35.9 
 
 		 196 aa  42.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.502077  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0758  protein of unknown function YGGT  51.35 
 
 		 184 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5048  YGGT family protein  30.77 
 
 		 196 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710638  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0493  protein of unknown function YGGT  30.12 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.197871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0492  hypothetical protein  29.67 
 
 		 197 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3609  protein of unknown function YGGT  35.71 
 
 		 189 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2547  protein of unknown function YGGT  27.5 
 
 		 87 aa  42  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167983  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1237  protein of unknown function YGGT  37.97 
 
 		 89 aa  42  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.371486  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3655  protein of unknown function YGGT  32.14 
 
 		 199 aa  41.2  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08930  YGGT family protein  28.21 
 
 		 84 aa  41.2  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.384516  hitchhiker  0.0000000251444 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3665  YGGT family protein  32.14 
 
 		 181 aa  41.2  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.688821  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1212  protein of unknown function YGGT  32.89 
 
 		 182 aa  41.2  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0177861 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0773  protein of unknown function YGGT  60 
 
 		 184 aa  40.8  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.148544  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3042  hypothetical protein  36.96 
 
 		 180 aa  40.8  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.390306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0534  protein of unknown function YGGT  40.48 
 
 		 194 aa  40.8  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0439  yggt family protein  56.25 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000131375  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0547  protein of unknown function YGGT  32.5 
 
 		 180 aa  40.4  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3725  protein of unknown function YGGT  26.25 
 
 		 87 aa  40.8  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00556578  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0295  protein of unknown function YGGT  38.3 
 
 		 78 aa  40.4  0.009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315255  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2426  protein of unknown function YGGT  30.43 
 
 		 187 aa  40.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0149  protein of unknown function YGGT  32.97 
 
 		 100 aa  40  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.041214 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2862  protein of unknown function YGGT  48.48 
 
 		 182 aa  40  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0177844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>