74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3335 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3335  protein of unknown function YGGT  100 
 
 		 95 aa  184  5e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.982716 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0018  protein of unknown function YGGT  77.89 
 
 		 95 aa  144  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.292831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1360  hypothetical protein  75.79 
 
 		 101 aa  143  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0028  protein of unknown function YGGT  75.79 
 
 		 96 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.242413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0341  protein of unknown function YGGT  73.4 
 
 		 124 aa  132  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2660  hypothetical protein  69.23 
 
 		 109 aa  91.7  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3096  protein of unknown function YGGT  46.67 
 
 		 102 aa  78.6  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.669144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2973  protein of unknown function YGGT  39.13 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0057  protein of unknown function YGGT  36.36 
 
 		 96 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0607  protein of unknown function YGGT  42.47 
 
 		 96 aa  66.2  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0989  protein of unknown function YGGT  39.29 
 
 		 114 aa  65.5  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0478  hypothetical protein  41.1 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0508  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.842199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0271  hypothetical protein  34.04 
 
 		 96 aa  63.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2870  protein of unknown function YGGT  41.33 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388606 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0327  yggt family protein  36.47 
 
 		 97 aa  62.8  0.000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0053  protein of unknown function YGGT  36.76 
 
 		 99 aa  61.6  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.941254 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2879  protein of unknown function YGGT  39.74 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.147865 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4761  protein of unknown function YGGT  35.8 
 
 		 106 aa  60.1  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.211635 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1918  YGGT family protein  39.73 
 
 		 194 aa  57.4  0.00000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3527  hypothetical protein  33.33 
 
 		 99 aa  57.4  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12787  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4076  protein of unknown function YGGT  34.25 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1992  YGGT family protein  39.73 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3782  protein of unknown function YGGT  34.25 
 
 		 103 aa  57  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.402098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3706  protein of unknown function YGGT  33.68 
 
 		 103 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.535312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4038  protein of unknown function YGGT  32.88 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.5468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3938  protein of unknown function YGGT  34.67 
 
 		 95 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4464  protein of unknown function YGGT  37.14 
 
 		 100 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.338351 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1166  protein of unknown function YGGT  40.7 
 
 		 105 aa  54.3  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866748  hitchhiker  0.00575832 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4027  protein of unknown function YGGT  36.78 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4152  hypothetical protein  36.96 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0419  protein of unknown function YGGT  36.76 
 
 		 96 aa  52  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03060  hypothetical protein  35.16 
 
 		 197 aa  52  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479202  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0110  hypothetical protein  36.76 
 
 		 119 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0365579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1165  protein of unknown function YGGT  40 
 
 		 105 aa  51.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000835508  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0339  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 		 192 aa  51.2  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3568  protein of unknown function YGGT  35.59 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05130  hypothetical protein  35.16 
 
 		 197 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.409368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0692  protein of unknown function YGGT  35.29 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3299  protein of unknown function YGGT  32.31 
 
 		 99 aa  50.4  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0492  hypothetical protein  34.07 
 
 		 197 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0866  YGGT family protein  35.96 
 
 		 104 aa  49.7  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1917  protein of unknown function YGGT  36.14 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.951257  normal  0.340645 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1838  hypothetical protein  28.26 
 
 		 189 aa  48.1  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000231673  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1370  protein of unknown function YGGT  38.46 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0121  YGGT family protein  28.57 
 
 		 92 aa  47.8  0.00005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1838  protein of unknown function YGGT  35.23 
 
 		 183 aa  47  0.00009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2655  protein of unknown function YGGT  35.62 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0666885  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0947  protein of unknown function YGGT  51.28 
 
 		 192 aa  46.2  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.618723  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3372  protein of unknown function YGGT  35.29 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5048  YGGT family protein  30.77 
 
 		 196 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710638  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0475  hypothetical protein  30.77 
 
 		 196 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2921  protein of unknown function YGGT  35.62 
 
 		 184 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.317852  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5321  hypothetical protein  34.07 
 
 		 196 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3629  protein of unknown function YGGT  36 
 
 		 95 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5096  hypothetical protein  28.72 
 
 		 196 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109817  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2724  protein of unknown function YGGT  35.06 
 
 		 109 aa  43.5  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1492  protein of unknown function YGGT  35.06 
 
 		 109 aa  43.5  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290091  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5146  protein of unknown function YGGT  27.66 
 
 		 196 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.605809  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0149  protein of unknown function YGGT  32.97 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.041214 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4969  protein of unknown function YGGT  27.66 
 
 		 196 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1433  hypothetical protein  25.81 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.116879 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4152  protein of unknown function YGGT  29.67 
 
 		 197 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.762639 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0758  protein of unknown function YGGT  35.29 
 
 		 184 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3609  protein of unknown function YGGT  31.71 
 
 		 189 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3056  protein of unknown function YGGT  35.9 
 
 		 196 aa  42  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.502077  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0534  protein of unknown function YGGT  32.18 
 
 		 194 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3665  YGGT family protein  33.78 
 
 		 181 aa  41.6  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.688821  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0415  protein of unknown function YGGT  40.91 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000337721  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1696  protein of unknown function YGGT  34.09 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.471282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0369  protein of unknown function YGGT  26.6 
 
 		 196 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758714  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0773  protein of unknown function YGGT  36.51 
 
 		 184 aa  41.2  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.148544  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0439  yggt family protein  61.29 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000131375  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0405  protein of unknown function YGGT  28.72 
 
 		 97 aa  40  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>