213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1085 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1085  protein of unknown function YGGT  100 
 
 
87 aa  169  9e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000150484  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0714  protein of unknown function YGGT  55.7 
 
 
84 aa  101  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.674624  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1411  protein of unknown function YGGT  60 
 
 
84 aa  101  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000759704  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1018  protein of unknown function YGGT  58.97 
 
 
85 aa  95.1  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0956  protein of unknown function YGGT  46.25 
 
 
89 aa  79.3  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00321355  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0861  hypothetical protein  47.56 
 
 
88 aa  72.8  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00343102  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3329  protein of unknown function YGGT  40 
 
 
98 aa  67  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2189  protein of unknown function YGGT  43.84 
 
 
96 aa  67  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.318304  normal  0.111036 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3001  hypothetical protein  40 
 
 
187 aa  65.5  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15401  hypothetical protein  41.43 
 
 
99 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.393994 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0477  hypothetical protein  40 
 
 
99 aa  63.9  0.0000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0866  YGGT family protein  36.49 
 
 
104 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1433  hypothetical protein  42.03 
 
 
98 aa  63.2  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.116879 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1166  protein of unknown function YGGT  33.77 
 
 
105 aa  63.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866748  hitchhiker  0.00575832 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0994  hypothetical protein  40.48 
 
 
92 aa  63.2  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0252519  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4969  protein of unknown function YGGT  43.48 
 
 
196 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3655  protein of unknown function YGGT  36 
 
 
199 aa  63.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5146  protein of unknown function YGGT  43.48 
 
 
196 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.605809  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5096  hypothetical protein  42.03 
 
 
196 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109817  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0369  protein of unknown function YGGT  43.48 
 
 
196 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758714  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2724  protein of unknown function YGGT  38.57 
 
 
109 aa  62  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1492  protein of unknown function YGGT  38.57 
 
 
109 aa  62  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290091  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0615  hypothetical protein  42.86 
 
 
93 aa  60.8  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.8017800000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0438  protein of unknown function YGGT  36.47 
 
 
92 aa  60.8  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000112129 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0261  YGGT family protein  36.47 
 
 
92 aa  60.8  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.634053  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3109  hypothetical protein  41.67 
 
 
92 aa  60.5  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264306  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3999  ylmG protein  46.48 
 
 
87 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000449706  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1379  yggt family protein  40.85 
 
 
97 aa  60.5  0.000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08491  integral membrane protein  39.77 
 
 
102 aa  60.5  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.321113  hitchhiker  0.00153658 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3912  ylmG protein  42.5 
 
 
87 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000638636 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0415  protein of unknown function YGGT  38.1 
 
 
107 aa  59.7  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000337721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3749  ylmG protein  42.5 
 
 
87 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0442014  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3640  hypothetical protein  42.5 
 
 
87 aa  59.7  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138235  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3657  hypothetical protein  42.5 
 
 
87 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.516535  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4037  hypothetical protein  42.5 
 
 
87 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000926366  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0020  protein of unknown function YGGT  38.1 
 
 
94 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.310945  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03060  hypothetical protein  41.18 
 
 
197 aa  59.7  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479202  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2547  protein of unknown function YGGT  45.21 
 
 
87 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167983  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1242  ylmG protein  44.62 
 
 
87 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000199997  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3950  ylmG protein  42.5 
 
 
87 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361919  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3056  protein of unknown function YGGT  34.88 
 
 
196 aa  58.9  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.502077  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3943  ylmG protein  44.29 
 
 
87 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00794391  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0933  protein of unknown function YGGT  39.24 
 
 
85 aa  58.9  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0945487  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0492  hypothetical protein  39.71 
 
 
197 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0339  protein of unknown function YGGT  28.17 
 
 
192 aa  57.8  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3725  protein of unknown function YGGT  41.56 
 
 
87 aa  57.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00556578  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05130  hypothetical protein  38.24 
 
 
197 aa  57  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.409368  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0475  hypothetical protein  36.23 
 
 
196 aa  57  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5048  YGGT family protein  36.23 
 
 
196 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710638  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3275  YGGT family protein  36.11 
 
 
188 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0250228 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3444  YGGT family protein  36.11 
 
 
188 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.119003 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3348  YGGT family protein  36.11 
 
 
188 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.299187  normal  0.126614 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3340  YGGT family protein  36.11 
 
 
188 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.350216 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3358  protein of unknown function YGGT  37.14 
 
 
188 aa  56.6  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0016989 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4152  protein of unknown function YGGT  38.46 
 
 
197 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.762639 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1165  protein of unknown function YGGT  37.29 
 
 
105 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000835508  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3054  protein of unknown function YGGT  34.94 
 
 
99 aa  56.2  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.649035  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1906  protein of unknown function YGGT  39.71 
 
 
90 aa  55.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5321  hypothetical protein  43.33 
 
 
196 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0493  protein of unknown function YGGT  35.53 
 
 
92 aa  55.8  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.197871  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2479  protein of unknown function YGGT  47.54 
 
 
182 aa  55.5  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.619107  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1036  protein of unknown function YGGT  39.24 
 
 
89 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000119033  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36034  predicted protein  38.46 
 
 
237 aa  54.7  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.119025  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03300  hypothetical protein  39.74 
 
 
178 aa  54.7  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09491  hypothetical protein  38.36 
 
 
92 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.291422  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0890  hypothetical protein  38.36 
 
 
92 aa  54.7  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09511  hypothetical protein  38.36 
 
 
92 aa  54.7  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.545335  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09931  hypothetical protein  36.99 
 
 
92 aa  53.9  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3264  YGGT family protein  34.72 
 
 
188 aa  53.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_10630  predicted protein  40.62 
 
 
76 aa  53.5  0.0000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1838  hypothetical protein  33.33 
 
 
189 aa  52.4  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000231673  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1481  protein of unknown function YGGT  35.44 
 
 
94 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3355  hypothetical protein  42.62 
 
 
182 aa  51.6  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00691  hypothetical protein  37.88 
 
 
102 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.82447 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1262  protein of unknown function YGGT  42.62 
 
 
182 aa  51.2  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0091593  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0327  yggt family protein  38.46 
 
 
97 aa  51.6  0.000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2689  protein of unknown function YGGT  42.62 
 
 
182 aa  51.2  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.885228  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02782  predicted inner membrane protein  33.33 
 
 
188 aa  50.8  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.104199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0743  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 
188 aa  50.8  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02745  hypothetical protein  33.33 
 
 
188 aa  50.8  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.090594  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0297  hypothetical protein  31.43 
 
 
100 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.475908  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3094  YGGT family protein  33.33 
 
 
188 aa  50.8  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000274597 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1191  protein of unknown function YGGT  42.62 
 
 
182 aa  50.8  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0253033  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1192  protein of unknown function YGGT  42.62 
 
 
182 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0499744  normal  0.653735 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3112  YGGT family protein  33.33 
 
 
188 aa  50.8  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09691  hypothetical protein  31.43 
 
 
100 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0755134  normal  0.205345 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3296  YGGT family protein  33.33 
 
 
188 aa  50.8  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0762  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 
188 aa  50.8  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000437553 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4255  YGGT family protein  33.33 
 
 
188 aa  50.8  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.809329  normal  0.660406 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3042  protein of unknown function YGGT  51.06 
 
 
182 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000245532  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3185  protein of unknown function YGGT  51.06 
 
 
182 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000491839  normal  0.0847291 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1336  protein of unknown function YGGT  51.06 
 
 
182 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000680586  hitchhiker  0.0000219253 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2862  protein of unknown function YGGT  37.7 
 
 
182 aa  50.8  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0177844  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3637  protein of unknown function YGGT  30.95 
 
 
94 aa  50.8  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.160206  normal  0.479955 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3384  YGGT family protein  33.33 
 
 
188 aa  50.8  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3027  protein of unknown function YGGT  51.06 
 
 
182 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000050243  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08930  YGGT family protein  37.04 
 
 
84 aa  50.8  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.384516  hitchhiker  0.0000000251444 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3452  hypothetical protein  31.4 
 
 
184 aa  50.8  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0294828  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2684  protein of unknown function YGGT  40 
 
 
184 aa  50.4  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000426882  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1490  cell division membrane protein  37.21 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>