81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0154 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0154  protein of unknown function YGGT  100 
 
 		 98 aa  194  5.000000000000001e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00105127  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1540  protein of unknown function YGGT  48.98 
 
 		 96 aa  96.3  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.180759  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1027  protein of unknown function YGGT  42.86 
 
 		 98 aa  85.1  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1093  protein of unknown function YGGT  42.86 
 
 		 98 aa  85.1  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.869762  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1355  protein of unknown function YGGT  44.44 
 
 		 100 aa  77.4  0.00000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1165  protein of unknown function YGGT  39.39 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000835508  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1166  protein of unknown function YGGT  29.29 
 
 		 105 aa  57  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866748  hitchhiker  0.00575832 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0149  protein of unknown function YGGT  34.41 
 
 		 100 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.041214 
 
 
-
 
NC_002620  TC0014  hypothetical protein  34.78 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3054  protein of unknown function YGGT  35.64 
 
 		 99 aa  52.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.649035  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0866  YGGT family protein  27.27 
 
 		 104 aa  50.8  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1696  protein of unknown function YGGT  32 
 
 		 100 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.471282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1906  protein of unknown function YGGT  38.6 
 
 		 90 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1242  ylmG protein  43.64 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000199997  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1036  protein of unknown function YGGT  40 
 
 		 89 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000119033  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0477  hypothetical protein  36 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3943  ylmG protein  43.64 
 
 		 87 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00794391  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3912  ylmG protein  43.64 
 
 		 87 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000638636 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3950  ylmG protein  43.64 
 
 		 87 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361919  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3640  hypothetical protein  43.64 
 
 		 87 aa  47.4  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138235  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3657  hypothetical protein  43.64 
 
 		 87 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.516535  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3749  ylmG protein  43.64 
 
 		 87 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0442014  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4037  hypothetical protein  43.64 
 
 		 87 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000926366  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3725  protein of unknown function YGGT  43.64 
 
 		 87 aa  47  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00556578  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3096  protein of unknown function YGGT  32.58 
 
 		 102 aa  47  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.669144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1018  protein of unknown function YGGT  30.77 
 
 		 85 aa  46.2  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3999  ylmG protein  41.82 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000449706  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0989  protein of unknown function YGGT  36.36 
 
 		 114 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1412  protein of unknown function YGGT  35.38 
 
 		 186 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0755  ylmG protein  40.38 
 
 		 96 aa  45.4  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.298424  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3056  protein of unknown function YGGT  29.07 
 
 		 196 aa  45.4  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.502077  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3842  protein of unknown function YGGT  44.44 
 
 		 84 aa  44.7  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1199  cell division membrane protein  31.33 
 
 		 98 aa  44.7  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3720  protein of unknown function YGGT  32 
 
 		 180 aa  44.7  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4152  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 		 197 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.762639 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0679  protein of unknown function YGGT  34.38 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345775  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0947  protein of unknown function YGGT  34.55 
 
 		 192 aa  43.5  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.618723  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2479  protein of unknown function YGGT  36.51 
 
 		 182 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.619107  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5048  YGGT family protein  32.47 
 
 		 196 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710638  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0475  hypothetical protein  32.47 
 
 		 196 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3094  YGGT family protein  32.86 
 
 		 188 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000274597 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3384  YGGT family protein  32.86 
 
 		 188 aa  42  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0762  protein of unknown function YGGT  32.86 
 
 		 188 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000437553 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03300  hypothetical protein  42.37 
 
 		 178 aa  42.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4255  YGGT family protein  32.86 
 
 		 188 aa  42.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.809329  normal  0.660406 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0743  protein of unknown function YGGT  32.86 
 
 		 188 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02745  hypothetical protein  32.86 
 
 		 188 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.090594  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3296  YGGT family protein  32.86 
 
 		 188 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3112  YGGT family protein  32.86 
 
 		 188 aa  42.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02782  predicted inner membrane protein  32.86 
 
 		 188 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.104199  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2189  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.318304  normal  0.111036 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1212  protein of unknown function YGGT  31.25 
 
 		 182 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0177861 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0339  protein of unknown function YGGT  29.63 
 
 		 192 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3329  protein of unknown function YGGT  26.88 
 
 		 98 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1336  protein of unknown function YGGT  35.94 
 
 		 182 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000680586  hitchhiker  0.0000219253 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3027  protein of unknown function YGGT  35.94 
 
 		 182 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000050243  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4761  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 		 106 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.211635 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0595  protein of unknown function YGGT  31.71 
 
 		 86 aa  42  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102021  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1838  protein of unknown function YGGT  37.31 
 
 		 183 aa  42  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3042  protein of unknown function YGGT  35.94 
 
 		 182 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000245532  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0492  hypothetical protein  32.22 
 
 		 197 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3185  protein of unknown function YGGT  35.94 
 
 		 182 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000491839  normal  0.0847291 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2870  protein of unknown function YGGT  38.24 
 
 		 101 aa  41.2  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388606 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0261  YGGT family protein  32.86 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.634053  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0438  protein of unknown function YGGT  32.86 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112129 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2437  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 		 189 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2973  protein of unknown function YGGT  28.41 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3358  protein of unknown function YGGT  32.86 
 
 		 188 aa  41.2  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0016989 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1192  protein of unknown function YGGT  34.92 
 
 		 182 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0499744  normal  0.653735 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3886  hypothetical protein  38.89 
 
 		 177 aa  40.8  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0843847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05130  hypothetical protein  31.11 
 
 		 197 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.409368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1191  protein of unknown function YGGT  34.92 
 
 		 182 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0253033  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03060  hypothetical protein  30.77 
 
 		 197 aa  40.4  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479202  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1141  cell division membrane protein  37.1 
 
 		 64 aa  40.4  0.008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1838  hypothetical protein  31.43 
 
 		 189 aa  40.4  0.008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000231673  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3527  hypothetical protein  32.86 
 
 		 99 aa  40  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12787  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3001  hypothetical protein  33.78 
 
 		 187 aa  40.4  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3355  hypothetical protein  34.92 
 
 		 182 aa  40.4  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2547  protein of unknown function YGGT  37.04 
 
 		 87 aa  40  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167983  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1379  yggt family protein  36 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0439  yggt family protein  37.23 
 
 		 103 aa  40  0.01  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000131375  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>