168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0718 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0718  conserved hypothetical integral membrane protein, YGGT family  100 
 
 		 95 aa  180  6e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.338437  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0679  protein of unknown function YGGT  54.84 
 
 		 98 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345775  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1547  riboflavin synthase alpha subunit  52.87 
 
 		 97 aa  100  6e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.836777  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1060  hypothetical protein  59.46 
 
 		 94 aa  99.8  1e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.040258  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0106  yggt family protein  51.61 
 
 		 99 aa  97.8  5e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0860  YGGT family protein  65.52 
 
 		 93 aa  95.5  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.151332  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0439  yggt family protein  54.08 
 
 		 103 aa  94.4  5e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000131375  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0931  YGGT family protein  65.12 
 
 		 93 aa  94  7e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0993  YGGT family protein  69.62 
 
 		 93 aa  92  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0346912  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0615  hypothetical protein  42.39 
 
 		 93 aa  87.4  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.8017800000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1379  yggt family protein  46.59 
 
 		 97 aa  86.7  9e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3054  protein of unknown function YGGT  40.45 
 
 		 99 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.649035  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0149  protein of unknown function YGGT  44.71 
 
 		 100 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.041214 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0405  protein of unknown function YGGT  40.22 
 
 		 97 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1665  protein of unknown function YGGT  42.05 
 
 		 99 aa  82  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.905288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1166  protein of unknown function YGGT  44.83 
 
 		 105 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866748  hitchhiker  0.00575832 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1696  protein of unknown function YGGT  41.18 
 
 		 100 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.471282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1165  protein of unknown function YGGT  44.94 
 
 		 105 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000835508  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0866  YGGT family protein  42.53 
 
 		 104 aa  77  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0261  protein of unknown function YGGT  44.83 
 
 		 99 aa  75.9  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3637  protein of unknown function YGGT  39.29 
 
 		 94 aa  73.6  0.0000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.160206  normal  0.479955 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2172  hypothetical protein  38.82 
 
 		 100 aa  71.6  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0505653  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3655  protein of unknown function YGGT  45.33 
 
 		 199 aa  72  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2724  protein of unknown function YGGT  42.11 
 
 		 109 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1492  protein of unknown function YGGT  42.11 
 
 		 109 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290091  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0415  protein of unknown function YGGT  41.46 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000337721  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1901  protein of unknown function YGGT  39.76 
 
 		 100 aa  68.2  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0339  protein of unknown function YGGT  36.47 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1018  protein of unknown function YGGT  39.76 
 
 		 85 aa  63.9  0.0000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0261  YGGT family protein  39.77 
 
 		 92 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.634053  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0438  protein of unknown function YGGT  39.77 
 
 		 92 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112129 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0020  protein of unknown function YGGT  38.16 
 
 		 94 aa  60.8  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.310945  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0956  protein of unknown function YGGT  37.66 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00321355  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0861  hypothetical protein  36.14 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00343102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5321  hypothetical protein  36.14 
 
 		 196 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3042  hypothetical protein  35.29 
 
 		 180 aa  57.4  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.390306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2426  protein of unknown function YGGT  37.97 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0714  protein of unknown function YGGT  37.8 
 
 		 84 aa  56.2  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.674624  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0327  yggt family protein  35.96 
 
 		 97 aa  56.2  0.0000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2689  protein of unknown function YGGT  40 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.885228  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2684  protein of unknown function YGGT  37.93 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000426882  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1355  protein of unknown function YGGT  37.93 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0534  protein of unknown function YGGT  30.23 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3027  protein of unknown function YGGT  35.29 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000050243  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3355  hypothetical protein  45.45 
 
 		 182 aa  54.3  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1411  protein of unknown function YGGT  38.67 
 
 		 84 aa  54.7  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000759704  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1191  protein of unknown function YGGT  44.12 
 
 		 182 aa  53.9  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0253033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1192  protein of unknown function YGGT  44.12 
 
 		 182 aa  53.9  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0499744  normal  0.653735 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3527  hypothetical protein  38.46 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12787  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1838  protein of unknown function YGGT  35.71 
 
 		 183 aa  53.5  0.0000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1262  protein of unknown function YGGT  42.65 
 
 		 182 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0091593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05130  hypothetical protein  32.53 
 
 		 197 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.409368  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5096  hypothetical protein  30 
 
 		 196 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1085  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 		 87 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000150484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1336  protein of unknown function YGGT  39.71 
 
 		 182 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000680586  hitchhiker  0.0000219253 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5146  protein of unknown function YGGT  31.25 
 
 		 196 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.605809  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2479  protein of unknown function YGGT  35.63 
 
 		 182 aa  52.4  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.619107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3185  protein of unknown function YGGT  39.71 
 
 		 182 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000491839  normal  0.0847291 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4969  protein of unknown function YGGT  31.25 
 
 		 196 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0492  hypothetical protein  31.33 
 
 		 197 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3042  protein of unknown function YGGT  39.71 
 
 		 182 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000245532  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1534  YGGT family protein  36.99 
 
 		 192 aa  51.6  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.460678  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1838  hypothetical protein  34.52 
 
 		 189 aa  52  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000231673  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03060  hypothetical protein  27.71 
 
 		 197 aa  51.6  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479202  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0475  hypothetical protein  28.75 
 
 		 196 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5048  YGGT family protein  28.75 
 
 		 196 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710638  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3001  hypothetical protein  34.67 
 
 		 187 aa  50.8  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2158  hypothetical protein  37.5 
 
 		 187 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.101701  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3111  hypothetical protein  37.5 
 
 		 213 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03300  hypothetical protein  31.71 
 
 		 178 aa  49.7  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0751  YGGT family membrane protein  37.5 
 
 		 187 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2585  hypothetical protein  37.5 
 
 		 213 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3028  YGGT family membrane protein  37.5 
 
 		 213 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.952589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3083  YGGT family membrane protein  37.5 
 
 		 213 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2028  YGGT family membrane protein  37.5 
 
 		 187 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.835593  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0369  protein of unknown function YGGT  28.75 
 
 		 196 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0547  protein of unknown function YGGT  32.39 
 
 		 180 aa  50.1  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0508  protein of unknown function YGGT  34.94 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.842199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1522  hypothetical protein  37.5 
 
 		 187 aa  48.9  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153866  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0341  protein of unknown function YGGT  40.43 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3056  protein of unknown function YGGT  35.56 
 
 		 196 aa  48.9  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.502077  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1135  protein of unknown function YGGT  36.14 
 
 		 182 aa  49.3  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000824226  normal  0.525534 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1125  protein of unknown function YGGT  35.56 
 
 		 182 aa  49.3  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000165213  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2973  protein of unknown function YGGT  33.02 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1230  protein of unknown function YGGT  34.12 
 
 		 182 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000825612  normal  0.409234 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3720  protein of unknown function YGGT  36.62 
 
 		 180 aa  48.5  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2862  protein of unknown function YGGT  36.76 
 
 		 182 aa  48.5  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0177844  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2921  protein of unknown function YGGT  35.44 
 
 		 184 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.317852  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2655  protein of unknown function YGGT  41.98 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0666885  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002454  membrane protein  36.76 
 
 		 185 aa  48.9  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4152  protein of unknown function YGGT  29.21 
 
 		 197 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.762639 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03580  hypothetical protein  35.29 
 
 		 182 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1242  ylmG protein  35.06 
 
 		 87 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000199997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0057  protein of unknown function YGGT  31.33 
 
 		 96 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4087  protein of unknown function YGGT  31.82 
 
 		 186 aa  47  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300525  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4199  protein of unknown function YGGT  31.82 
 
 		 186 aa  47  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0818  protein of unknown function YGGT  36.11 
 
 		 187 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0807  protein of unknown function YGGT  36.11 
 
 		 187 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.968375  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0018  protein of unknown function YGGT  35.56 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.292831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3113  protein of unknown function YGGT  36.11 
 
 		 187 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.143528  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>