More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_27860 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_27860  Metal-dependent phosphohydrolase, HD domain protein  100 
 
 
563 aa  1115    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2541  metal dependent phosphohydrolase  40.33 
 
 
588 aa  369  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3528  putative metal dependent phosphohydrolase  30.56 
 
 
574 aa  203  6e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.445418  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1988  hypothetical protein  31.9 
 
 
576 aa  203  8e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3366  putative metal dependent phosphohydrolase  29.22 
 
 
574 aa  188  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3529  metal dependent phosphohydrolase  38.17 
 
 
372 aa  112  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1152  HDIG domain protein  30.48 
 
 
395 aa  105  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03089  metal-dependent phosphohydrolase domain  28.63 
 
 
395 aa  105  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2944  metal dependent phosphohydrolase  31.03 
 
 
349 aa  104  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1799  metal dependent phosphohydrolase domain-containing protein  30.54 
 
 
410 aa  99.8  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04078  metal dependent phosphohydrolase  28.32 
 
 
398 aa  98.2  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0994  metal-dependent phosphohydrolase  29.05 
 
 
393 aa  97.1  9e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  27.39 
 
 
436 aa  92.8  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4083  metal dependent phosphohydrolase  29.03 
 
 
394 aa  91.3  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1865  metal dependent phosphohydrolase  30.6 
 
 
377 aa  89.7  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  32.8 
 
 
404 aa  89.4  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4285  metal dependent phosphohydrolase  26.6 
 
 
388 aa  88.6  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00317648  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10820  HDIG domain-containing protein  28.89 
 
 
414 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768614  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  28.89 
 
 
427 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4619  HD domain-containing protein  27.73 
 
 
389 aa  87.8  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0350  metal-dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 
406 aa  87.4  6e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  29.57 
 
 
399 aa  87.4  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3662  metal dependent phosphohydrolase  29.81 
 
 
402 aa  85.5  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2918  metal dependent phosphohydrolase  26.8 
 
 
390 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271043  normal  0.722363 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03945  putative signal protein with HD-GYP domain  31.47 
 
 
419 aa  85.1  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2259  metal dependent phosphohydrolase  27.92 
 
 
400 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12698  normal  0.0858358 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  28.65 
 
 
401 aa  84.7  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  29.79 
 
 
412 aa  84.7  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2515  hypothetical protein  26.32 
 
 
402 aa  84.3  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0603316  decreased coverage  0.00307837 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3124  metal dependent phosphohydrolase  33.15 
 
 
341 aa  84  0.000000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.759811 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  33.88 
 
 
409 aa  83.2  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5388  metal dependent phosphohydrolase  31.28 
 
 
446 aa  83.2  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2399  metal-dependent phosphohydrolase  25.7 
 
 
417 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3912  metal dependent phosphohydrolase  29.02 
 
 
397 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3572  metal dependent phosphohydrolase  25.34 
 
 
516 aa  82.8  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1823  metal dependent phosphohydrolase  25.23 
 
 
405 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2124  metal dependent phosphohydrolase  26.05 
 
 
346 aa  82.8  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2378  metal dependent phosphohydrolase  25.81 
 
 
402 aa  82.4  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22020  metal dependent phosphohydrolase  25.22 
 
 
362 aa  81.6  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  30.65 
 
 
411 aa  81.6  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0100  metal dependent phosphohydrolase  23.55 
 
 
392 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  30.11 
 
 
431 aa  82  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1680  metal dependent phosphohydrolase  25.7 
 
 
401 aa  82  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4069  metal dependent phosphohydrolase  26.29 
 
 
396 aa  82  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  28.51 
 
 
419 aa  81.3  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1979  metal dependent phosphohydrolase  26.8 
 
 
431 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.334785  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2783  metal dependent phosphohydrolase  27.27 
 
 
403 aa  80.9  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3670  metal dependent phosphohydrolase  26.56 
 
 
401 aa  81.3  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02542  hypothetical protein  27.11 
 
 
403 aa  80.9  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1218  metal dependent phosphohydrolase  29.19 
 
 
448 aa  80.5  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0146  metal dependent phosphohydrolase  26.34 
 
 
391 aa  80.5  0.00000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  30.69 
 
 
413 aa  80.5  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0137  HD domain-containing protein  26.88 
 
 
392 aa  80.5  0.00000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0279  metal dependent phosphohydrolase  30.16 
 
 
424 aa  79.7  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000015793  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 
401 aa  79  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0063  metal-dependent phosphohydrolase  30.05 
 
 
404 aa  79.3  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174704  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  27.41 
 
 
410 aa  79.3  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  31.25 
 
 
419 aa  79  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1822  metal dependent phosphohydrolase  26.64 
 
 
395 aa  79  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.248214  normal  0.0148052 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0592  hypothetical protein  26.79 
 
 
403 aa  78.6  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4711  HD domain-containing protein  25.88 
 
 
394 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4444  metal dependent phosphohydrolase  25.81 
 
 
396 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0670  metal dependent phosphohydrolase  29.63 
 
 
386 aa  77.8  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.150341  hitchhiker  0.000000203392 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2351  metal dependent phosphohydrolase  29.47 
 
 
421 aa  77.4  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0796971  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1533  metal dependent phosphohydrolase  31.41 
 
 
454 aa  77  0.0000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35985  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0215  metal-dependent phosphohydrolase  27.22 
 
 
400 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1140  metal dependent phosphohydrolase  26.09 
 
 
395 aa  76.3  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0505  metal dependent phosphohydrolase  27.91 
 
 
404 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311766  normal  0.892483 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3871  metal dependent phosphohydrolase  25.26 
 
 
396 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0518  metal dependent phosphohydrolase  27.91 
 
 
406 aa  75.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.454264 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003582  HD-domain protein  26.88 
 
 
405 aa  75.5  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0582  metal dependent phosphohydrolase  26.1 
 
 
400 aa  75.5  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4304  metal dependent phosphohydrolase  25.27 
 
 
396 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0096  metal dependent phosphohydrolase  25.27 
 
 
396 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1175  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
389 aa  74.7  0.000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1519  putative metal dependent phosphohydrolase  27.32 
 
 
404 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000671855  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1802  metal-dependent phosphohydrolase  27.09 
 
 
413 aa  74.7  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  28.21 
 
 
402 aa  74.7  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0136  putative metal dependent phosphohydrolase  25.81 
 
 
398 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3861  metal dependent phosphohydrolase  24.12 
 
 
411 aa  73.9  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3954  metal dependent phosphohydrolase  24.55 
 
 
411 aa  74.3  0.000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1788  metal dependent phosphohydrolase  27.75 
 
 
421 aa  73.9  0.000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2258  metal dependent phosphohydrolase  26.6 
 
 
420 aa  73.9  0.000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2078  hypothetical protein  27.87 
 
 
417 aa  73.2  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000117952  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2262  metal dependent phosphohydrolase  28.27 
 
 
275 aa  72.8  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0114746  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4249  metal dependent phosphohydrolase  24.73 
 
 
396 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0373  putative metal dependent phosphohydrolase  34.5 
 
 
410 aa  72.8  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3098  metal dependent phosphohydrolase  26.37 
 
 
304 aa  72  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.867396  normal  0.800633 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1421  putative PAS/PAC sensor protein  33.82 
 
 
687 aa  71.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.377844  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1919  hypothetical protein  34 
 
 
384 aa  72  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.731705  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0898  metal dependent phosphohydrolase  27.4 
 
 
345 aa  72  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2876  metal dependent phosphohydrolase  31.14 
 
 
354 aa  72  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.327621 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2680  HD-GYP domain-containing protein  26.92 
 
 
488 aa  71.6  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.467072 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0570  metal dependent phosphohydrolase  28.96 
 
 
417 aa  71.2  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000128734 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0253  putative PAS/PAC sensor protein  38.66 
 
 
453 aa  71.2  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  27.89 
 
 
448 aa  70.9  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1408  metal dependent phosphohydrolase  31.33 
 
 
654 aa  70.9  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0845  metal dependent phosphohydrolase  30.05 
 
 
429 aa  70.5  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242914  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1577  metal dependent phosphohydrolase  24.87 
 
 
420 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2138  metal dependent phosphohydrolase  26.03 
 
 
369 aa  70.5  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>