240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_12460 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_12460  allophanate hydrolase subunit 1  100 
 
 
224 aa  438  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.460318  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5124  hypothetical protein  67.12 
 
 
225 aa  278  6e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58530  hypothetical protein  64.41 
 
 
225 aa  264  8.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1984  hypothetical protein  41.99 
 
 
249 aa  190  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1498  allophanate hydrolase subunit 1  46.43 
 
 
227 aa  191  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.403347  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0478  allophanate hydrolase, subunit 1  51.1 
 
 
229 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1437  putative allophanate hydrolase subunit 1  40 
 
 
239 aa  171  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1737  allophanate hydrolase subunit 1  40.17 
 
 
226 aa  170  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.215551 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3548  allophanate hydrolase subunit 1  39.7 
 
 
234 aa  166  2.9999999999999998e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3379  allophanate hydrolase subunit 1  44.89 
 
 
234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.332563  normal  0.85037 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3876  allophanate hydrolase subunit 1  45.58 
 
 
231 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.348545  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1506  hypothetical protein  46.4 
 
 
243 aa  162  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.227592  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4346  allophanate hydrolase subunit 1  44.13 
 
 
201 aa  163  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1957  Allophanate hydrolase subunit 1  47.03 
 
 
218 aa  157  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.360214  hitchhiker  0.00204684 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1030  allophanate hydrolase subunit 1  41.41 
 
 
243 aa  157  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4097  allophanate hydrolase subunit 1  43.56 
 
 
228 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0199778  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1270  Allophanate hydrolase subunit 1  40.09 
 
 
221 aa  155  4e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0521  Allophanate hydrolase subunit 1  44.69 
 
 
253 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1313  allophanate hydrolase subunit 1  43.11 
 
 
228 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.837273  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4576  allophanate hydrolase subunit 1  42.67 
 
 
229 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.179191  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1406  allophanate hydrolase subunit 1  41.78 
 
 
234 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37290  hypothetical protein  46.67 
 
 
237 aa  150  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000183786  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3200  hypothetical protein  46.67 
 
 
237 aa  150  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1828  Allophanate hydrolase subunit 1  47.57 
 
 
227 aa  150  2e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.700808  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0710  Allophanate hydrolase subunit 1  39.09 
 
 
246 aa  149  4e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00179377  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0360  allophanate hydrolase subunit 1  42.86 
 
 
234 aa  149  5e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.120122  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000163  allophanate hydrolase subunit 1  39.7 
 
 
227 aa  146  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.245335  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0372  allophanate hydrolase subunit 1  43.81 
 
 
249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.701967  normal  0.529517 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05796  allophanate hydrolase, subunit 1  39.5 
 
 
230 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2336  Allophanate hydrolase subunit 1  40.76 
 
 
230 aa  146  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0988  allophanate hydrolase subunit 1  36.2 
 
 
238 aa  146  3e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0659374  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6350  Allophanate hydrolase subunit 1  46.82 
 
 
204 aa  145  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5727  allophanate hydrolase subunit 2  43.6 
 
 
531 aa  141  9e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506367  normal  0.818149 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3032  allophanate hydrolase subunit 1  49.14 
 
 
218 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1595  allophanate hydrolase subunit 1  32.71 
 
 
243 aa  139  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2825  allophanate hydrolase subunit 1  36.44 
 
 
240 aa  139  3.9999999999999997e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.140549  normal  0.0247911 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1950  Allophanate hydrolase subunit 1  39.37 
 
 
233 aa  138  6e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000391255  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3056  allophanate hydrolase subunit 1  48.28 
 
 
218 aa  135  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0256997 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0178  Allophanate hydrolase subunit 1  39.63 
 
 
242 aa  135  4e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2974  allophanate hydrolase subunit 1  39.59 
 
 
248 aa  135  4e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0811525  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2224  allophanate hydrolase subunit 1  43.39 
 
 
231 aa  134  8e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0899  Allophanate hydrolase subunit 1  42.47 
 
 
221 aa  134  9e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.605422  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2073  Allophanate hydrolase subunit 2  41.79 
 
 
499 aa  134  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.721268 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2450  allophanate hydrolase subunit 2  40.27 
 
 
553 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.76901  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4367  Allophanate hydrolase subunit 1  42.92 
 
 
215 aa  134  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2132  allophanate hydrolase subunit 1  38.53 
 
 
240 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.317589 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2948  allophanate hydrolase subunit 1  47.7 
 
 
218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0322  allophanate hydrolase subunit 2  42.18 
 
 
522 aa  133  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.751903  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0717  hypothetical protein  39.57 
 
 
236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0448352  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1172  hypothetical protein  30.18 
 
 
243 aa  132  3e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0087  hypothetical protein  46.82 
 
 
216 aa  133  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595386  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0195  hypothetical protein  46.24 
 
 
217 aa  133  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2423  hypothetical protein  47.7 
 
 
218 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3082  hypothetical protein  47.7 
 
 
218 aa  132  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3037  hypothetical protein  47.7 
 
 
218 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.998817  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3311  hypothetical protein  45.14 
 
 
218 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2981  hypothetical protein  45.14 
 
 
218 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78206  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2111  hypothetical protein  45.14 
 
 
218 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3367  putative allophanate hydrolase, subunit 1  45.14 
 
 
218 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3741  Allophanate hydrolase subunit 1  46.24 
 
 
217 aa  132  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0449  hypothetical protein  45.14 
 
 
256 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2374  Allophanate hydrolase subunit 1  46.24 
 
 
215 aa  131  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.635342 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0266  putative allophanate hydrolase, subunit 1  45.14 
 
 
256 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251765  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0869  hypothetical protein  38.6 
 
 
549 aa  131  9e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1974  Allophanate hydrolase subunit 1  45.66 
 
 
215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0230  hypothetical protein  45.4 
 
 
259 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06200  conserved hypothetical protein TIGR00370  41.2 
 
 
203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.288812  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3511  allophanate hydrolase subunit 2  39.72 
 
 
539 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.80956  normal  0.701023 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1829  Allophanate hydrolase subunit 2  44.38 
 
 
506 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.359832  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01081  Allophanate hydrolase, subunit 1  34.75 
 
 
244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.805249  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6384  hypothetical protein  47.13 
 
 
218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0869  hypothetical protein  44.69 
 
 
218 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1145  Allophanate hydrolase subunit 1  32 
 
 
229 aa  129  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.110827  normal  0.406689 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0820  hypothetical protein  44.69 
 
 
218 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0759  hypothetical protein  44.69 
 
 
218 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0772  hypothetical protein  44.69 
 
 
218 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.984819 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0835  hypothetical protein  44.69 
 
 
218 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.473252  hitchhiker  0.00249119 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0062  hypothetical protein  44.51 
 
 
216 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0254  putative allophanate hydrolase, subunit 1  44.57 
 
 
256 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1666  hypothetical protein  30.77 
 
 
244 aa  128  6e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.947071  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1700  hypothetical protein  30.77 
 
 
244 aa  128  6e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0025  allophanate hydrolase, subunit 1  43.93 
 
 
215 aa  128  7.000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1226  Allophanate hydrolase subunit 1  51.56 
 
 
218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0499  Urea amidolyase-related protein  39.71 
 
 
534 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3088  conserved hypothetical protein TIGR00370  32.05 
 
 
237 aa  125  7e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5815  allophanate hydrolase subunit 1  39.56 
 
 
244 aa  124  9e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100836  normal  0.0693408 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3395  allophanate hydrolase subunit 1  40.98 
 
 
240 aa  124  9e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0629739 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4801  Allophanate hydrolase subunit 1  39.9 
 
 
212 aa  124  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.440705 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0593  allophanate hydrolase subunit 1  43.65 
 
 
234 aa  124  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0362915  normal  0.623241 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08926  hypothetical protein  33.65 
 
 
243 aa  123  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2197  Allophanate hydrolase subunit 1  41.12 
 
 
203 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2903  allophanate hydrolase subunit 1  43.93 
 
 
217 aa  123  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.282421 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02000  conserved hypothetical protein TIGR00370  36.77 
 
 
242 aa  123  2e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.620258 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3430  allophanate hydrolase subunit 1  39.63 
 
 
257 aa  122  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.381456  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0008  allophanate hydrolase subunit 1  39.55 
 
 
228 aa  123  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00137026 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3121  hypothetical protein  32.22 
 
 
237 aa  122  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785464  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5847  hypothetical protein  36.74 
 
 
541 aa  122  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0879773  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1100  allophanate hydrolase subunit 1  41.27 
 
 
217 aa  122  5e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.724491  normal  0.149569 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3110  Allophanate hydrolase subunit 1  48.84 
 
 
218 aa  122  5e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2171  hypothetical protein  43.93 
 
 
215 aa  122  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.452484  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>