229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05796 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05796  allophanate hydrolase, subunit 1  100 
 
 
230 aa  473  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000163  allophanate hydrolase subunit 1  67.84 
 
 
227 aa  324  7e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.245335  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0717  hypothetical protein  46.46 
 
 
236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0448352  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3548  allophanate hydrolase subunit 1  43.36 
 
 
234 aa  182  5.0000000000000004e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1737  allophanate hydrolase subunit 1  41.45 
 
 
226 aa  172  5e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.215551 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1437  putative allophanate hydrolase subunit 1  39.21 
 
 
239 aa  166  2.9999999999999998e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1984  hypothetical protein  41.94 
 
 
249 aa  160  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1828  Allophanate hydrolase subunit 1  39.64 
 
 
227 aa  157  1e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.700808  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58530  hypothetical protein  36.32 
 
 
225 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1498  allophanate hydrolase subunit 1  40.27 
 
 
227 aa  153  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.403347  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0988  allophanate hydrolase subunit 1  33.33 
 
 
238 aa  145  7.0000000000000006e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0659374  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5124  hypothetical protein  37.06 
 
 
225 aa  141  6e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0360  allophanate hydrolase subunit 1  36.91 
 
 
234 aa  140  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.120122  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1700  hypothetical protein  34.09 
 
 
244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1666  hypothetical protein  34.09 
 
 
244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.947071  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1030  allophanate hydrolase subunit 1  34.67 
 
 
243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2336  Allophanate hydrolase subunit 1  33.63 
 
 
230 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2224  allophanate hydrolase subunit 1  37.68 
 
 
231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1950  Allophanate hydrolase subunit 1  35.24 
 
 
233 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000391255  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1172  hypothetical protein  36.53 
 
 
243 aa  129  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12460  allophanate hydrolase subunit 1  39.5 
 
 
224 aa  128  6e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.460318  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3876  allophanate hydrolase subunit 1  34.36 
 
 
231 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.348545  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4097  allophanate hydrolase subunit 1  38.92 
 
 
228 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0199778  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2825  allophanate hydrolase subunit 1  33.62 
 
 
240 aa  127  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.140549  normal  0.0247911 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1313  allophanate hydrolase subunit 1  38.92 
 
 
228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.837273  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1595  allophanate hydrolase subunit 1  32.89 
 
 
243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1145  Allophanate hydrolase subunit 1  31.84 
 
 
229 aa  125  6e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.110827  normal  0.406689 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3395  allophanate hydrolase subunit 1  32.19 
 
 
240 aa  125  6e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0629739 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3379  allophanate hydrolase subunit 1  39.46 
 
 
234 aa  124  9e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.332563  normal  0.85037 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4576  allophanate hydrolase subunit 1  35.02 
 
 
229 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.179191  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1406  allophanate hydrolase subunit 1  34.25 
 
 
234 aa  123  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1270  Allophanate hydrolase subunit 1  33.94 
 
 
221 aa  122  3e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01081  Allophanate hydrolase, subunit 1  37.84 
 
 
244 aa  123  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.805249  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2874  allophanate hydrolase subunit 1  30.38 
 
 
237 aa  122  6e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.480079  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0521  Allophanate hydrolase subunit 1  35.75 
 
 
253 aa  121  8e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3120  conserved hypothetical protein TIGR00370  30.21 
 
 
237 aa  121  8e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000284554  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0869  hypothetical protein  35.71 
 
 
549 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1713  hypothetical protein  32.89 
 
 
246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.115565  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1527  hypothetical protein  32.89 
 
 
246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3121  hypothetical protein  30.64 
 
 
237 aa  119  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785464  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1900  hypothetical protein  36.46 
 
 
246 aa  119  4.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1957  Allophanate hydrolase subunit 1  33.8 
 
 
218 aa  119  6e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.360214  hitchhiker  0.00204684 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2810  hypothetical protein  29.66 
 
 
237 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1100  allophanate hydrolase subunit 1  34.76 
 
 
217 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.724491  normal  0.149569 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2882  hypothetical protein  30 
 
 
237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0696288  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3102  conserved hypothetical protein TIGR00370  32.82 
 
 
237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3088  conserved hypothetical protein TIGR00370  30.26 
 
 
237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3097  hypothetical protein  30 
 
 
237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.12026  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3511  allophanate hydrolase subunit 2  36.57 
 
 
539 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.80956  normal  0.701023 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5727  allophanate hydrolase subunit 2  34.76 
 
 
531 aa  116  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506367  normal  0.818149 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0025  allophanate hydrolase, subunit 1  37.19 
 
 
215 aa  116  3e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2148  hypothetical protein TIGR00370  29.54 
 
 
237 aa  116  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08926  hypothetical protein  31.65 
 
 
243 aa  116  3e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2849  hypothetical protein  29.58 
 
 
237 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3200  hypothetical protein  44.85 
 
 
237 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0710  Allophanate hydrolase subunit 1  32.59 
 
 
246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00179377  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0478  allophanate hydrolase, subunit 1  31.11 
 
 
229 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2450  allophanate hydrolase subunit 2  37.97 
 
 
553 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.76901  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37290  hypothetical protein  44.12 
 
 
237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000183786  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5847  hypothetical protein  37.93 
 
 
541 aa  112  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0879773  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1226  Allophanate hydrolase subunit 1  45.24 
 
 
218 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6350  Allophanate hydrolase subunit 1  34.29 
 
 
204 aa  112  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0869  hypothetical protein  31.73 
 
 
218 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0736  allophanate hydrolase, subunit 1  33.49 
 
 
218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00671  predicted enzyme subunit  33.49 
 
 
218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2925  Allophanate hydrolase subunit 1  33.49 
 
 
218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.401511  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0772  hypothetical protein  31.25 
 
 
218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.984819 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0628  allophanate hydrolase, subunit 1  33.49 
 
 
218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1506  hypothetical protein  31.94 
 
 
243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.227592  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00660  hypothetical protein  33.49 
 
 
218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0726  allophanate hydrolase, subunit 1  33.49 
 
 
218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.385331  normal  0.445001 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0835  hypothetical protein  31.25 
 
 
218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.473252  hitchhiker  0.00249119 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0801  allophanate hydrolase, subunit 1  33.49 
 
 
218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0935394  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02000  conserved hypothetical protein TIGR00370  30.87 
 
 
242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.620258 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0759  hypothetical protein  31.25 
 
 
218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0759  allophanate hydrolase, subunit 1  33.49 
 
 
218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0820  hypothetical protein  31.25 
 
 
218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3110  Allophanate hydrolase subunit 1  44.44 
 
 
218 aa  109  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3032  allophanate hydrolase subunit 1  39.43 
 
 
218 aa  109  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1969  hypothetical protein  33.82 
 
 
201 aa  108  6e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.129668  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3741  Allophanate hydrolase subunit 1  35.47 
 
 
217 aa  108  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3056  allophanate hydrolase subunit 1  35.63 
 
 
218 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0256997 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2944  allophanate hydrolase subunit 1  33.01 
 
 
218 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2790  Allophanate hydrolase subunit 1  41.3 
 
 
239 aa  108  9.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5380  allophanate hydrolase, putative  38.82 
 
 
539 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0499  Urea amidolyase-related protein  40.13 
 
 
534 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06200  conserved hypothetical protein TIGR00370  32.84 
 
 
203 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.288812  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2958  Allophanate hydrolase subunit 1  30.94 
 
 
242 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0195  hypothetical protein  35.47 
 
 
217 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0178  Allophanate hydrolase subunit 1  28.82 
 
 
242 aa  107  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1829  Allophanate hydrolase subunit 2  34.43 
 
 
506 aa  107  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.359832  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3311  hypothetical protein  34.3 
 
 
218 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2922  Allophanate hydrolase subunit 1  40.44 
 
 
219 aa  106  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.820056  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0230  hypothetical protein  34.3 
 
 
259 aa  106  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0593  allophanate hydrolase subunit 1  32 
 
 
234 aa  106  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0362915  normal  0.623241 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2981  hypothetical protein  34.3 
 
 
218 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78206  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2111  hypothetical protein  34.3 
 
 
218 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0254  putative allophanate hydrolase, subunit 1  34.3 
 
 
256 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3367  putative allophanate hydrolase, subunit 1  34.3 
 
 
218 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7093  allophanate hydrolase subunit 2  32.7 
 
 
209 aa  106  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.166941  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>