234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3379 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3379  allophanate hydrolase subunit 1  100 
 
 		 234 aa  467  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.332563  normal  0.85037 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1406  allophanate hydrolase subunit 1  68.4 
 
 		 234 aa  332  3e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3876  allophanate hydrolase subunit 1  67.53 
 
 		 231 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.348545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1313  allophanate hydrolase subunit 1  67.26 
 
 		 228 aa  302  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.837273  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4576  allophanate hydrolase subunit 1  67.26 
 
 		 229 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.179191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4097  allophanate hydrolase subunit 1  66.81 
 
 		 228 aa  299  3e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0199778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37290  hypothetical protein  66.52 
 
 		 237 aa  289  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000183786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3200  hypothetical protein  66.52 
 
 		 237 aa  288  4e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1030  allophanate hydrolase subunit 1  58.33 
 
 		 243 aa  281  8.000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1498  allophanate hydrolase subunit 1  45.78 
 
 		 227 aa  188  5e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.403347  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1828  Allophanate hydrolase subunit 1  39.11 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.700808  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0360  allophanate hydrolase subunit 1  40 
 
 		 234 aa  170  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.120122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5124  hypothetical protein  45.41 
 
 		 225 aa  169  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58530  hypothetical protein  46.05 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1984  hypothetical protein  35.81 
 
 		 249 aa  167  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1737  allophanate hydrolase subunit 1  37.78 
 
 		 226 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.215551 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1437  putative allophanate hydrolase subunit 1  41.62 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0710  Allophanate hydrolase subunit 1  38.74 
 
 		 246 aa  159  4e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00179377  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0478  allophanate hydrolase, subunit 1  41.41 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3548  allophanate hydrolase subunit 1  34.06 
 
 		 234 aa  153  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12460  allophanate hydrolase subunit 1  44.89 
 
 		 224 aa  148  6e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.460318  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0230  hypothetical protein  41.01 
 
 		 259 aa  148  7e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3311  hypothetical protein  40.09 
 
 		 218 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0449  hypothetical protein  41.28 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2981  hypothetical protein  40.09 
 
 		 218 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78206  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2111  hypothetical protein  40.09 
 
 		 218 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0266  putative allophanate hydrolase, subunit 1  41.28 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251765  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3367  putative allophanate hydrolase, subunit 1  40.09 
 
 		 218 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1145  Allophanate hydrolase subunit 1  34.27 
 
 		 229 aa  145  5e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.110827  normal  0.406689 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1270  Allophanate hydrolase subunit 1  36.28 
 
 		 221 aa  145  6e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2336  Allophanate hydrolase subunit 1  36.97 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0254  putative allophanate hydrolase, subunit 1  40.83 
 
 		 256 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2874  allophanate hydrolase subunit 1  36.98 
 
 		 237 aa  143  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.480079  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3120  conserved hypothetical protein TIGR00370  36.46 
 
 		 237 aa  142  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000284554  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3032  allophanate hydrolase subunit 1  39.44 
 
 		 218 aa  142  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0717  hypothetical protein  43.39 
 
 		 236 aa  142  5e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0448352  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3102  conserved hypothetical protein TIGR00370  35.94 
 
 		 237 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2882  hypothetical protein  35.94 
 
 		 237 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0696288  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2810  hypothetical protein  32.47 
 
 		 237 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3097  hypothetical protein  35.94 
 
 		 237 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.12026  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2849  hypothetical protein  35.94 
 
 		 237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4367  Allophanate hydrolase subunit 1  40.38 
 
 		 215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3088  conserved hypothetical protein TIGR00370  31.6 
 
 		 237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2148  hypothetical protein TIGR00370  34.9 
 
 		 237 aa  139  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3121  hypothetical protein  36.46 
 
 		 237 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785464  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3056  allophanate hydrolase subunit 1  38.21 
 
 		 218 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0256997 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1595  allophanate hydrolase subunit 1  30.63 
 
 		 243 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1255  allophanate hydrolase subunit 1  38.79 
 
 		 218 aa  139  4.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0342486  normal  0.816656 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0372  allophanate hydrolase subunit 1  38.65 
 
 		 249 aa  138  6e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.701967  normal  0.529517 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3741  Allophanate hydrolase subunit 1  40.28 
 
 		 217 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000163  allophanate hydrolase subunit 1  35.87 
 
 		 227 aa  137  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.245335  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1172  hypothetical protein  29.91 
 
 		 243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01081  Allophanate hydrolase, subunit 1  35.19 
 
 		 244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.805249  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6384  hypothetical protein  37.09 
 
 		 218 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2423  hypothetical protein  37.74 
 
 		 218 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3037  hypothetical protein  37.74 
 
 		 218 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.998817  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1957  Allophanate hydrolase subunit 1  38.43 
 
 		 218 aa  135  5e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.360214  hitchhiker  0.00204684 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0195  hypothetical protein  44.77 
 
 		 217 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1829  Allophanate hydrolase subunit 2  42.86 
 
 		 506 aa  135  6.0000000000000005e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.359832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2903  allophanate hydrolase subunit 1  45.35 
 
 		 217 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.282421 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1900  hypothetical protein  29.91 
 
 		 246 aa  135  6.0000000000000005e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1506  hypothetical protein  44.26 
 
 		 243 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.227592  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0178  Allophanate hydrolase subunit 1  34.25 
 
 		 242 aa  135  7.000000000000001e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3082  hypothetical protein  37.62 
 
 		 218 aa  135  8e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02000  conserved hypothetical protein TIGR00370  34.55 
 
 		 242 aa  135  8e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.620258 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1666  hypothetical protein  33.51 
 
 		 244 aa  134  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.947071  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1700  hypothetical protein  33.51 
 
 		 244 aa  134  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1713  hypothetical protein  30.32 
 
 		 246 aa  133  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.115565  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2948  allophanate hydrolase subunit 1  37.14 
 
 		 218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0988  allophanate hydrolase subunit 1  33.64 
 
 		 238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0659374  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1527  hypothetical protein  30.32 
 
 		 246 aa  133  3e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0008  allophanate hydrolase subunit 1  40 
 
 		 228 aa  133  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137026 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2073  Allophanate hydrolase subunit 2  41.71 
 
 		 499 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.721268 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0521  Allophanate hydrolase subunit 1  39.89 
 
 		 253 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3395  allophanate hydrolase subunit 1  36.87 
 
 		 240 aa  128  6e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0629739 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1214  allophanate hydrolase subunit 1  37.38 
 
 		 218 aa  128  7.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.491442  normal  0.0321852 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2171  hypothetical protein  42.94 
 
 		 215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.452484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0023  hypothetical protein  37.44 
 
 		 220 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309648 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1226  Allophanate hydrolase subunit 1  49.61 
 
 		 218 aa  125  5e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2825  allophanate hydrolase subunit 1  32.76 
 
 		 240 aa  125  5e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.140549  normal  0.0247911 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1950  Allophanate hydrolase subunit 1  32.38 
 
 		 233 aa  125  7e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000391255  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0087  hypothetical protein  41.24 
 
 		 216 aa  125  7e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595386  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2374  Allophanate hydrolase subunit 1  41.38 
 
 		 215 aa  125  7e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.635342 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1974  Allophanate hydrolase subunit 1  41.38 
 
 		 215 aa  125  7e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05796  allophanate hydrolase, subunit 1  39.46 
 
 		 230 aa  124  9e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3110  Allophanate hydrolase subunit 1  48.46 
 
 		 218 aa  123  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2062  allophanate hydrolase subunit 1  35.23 
 
 		 233 aa  124  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.206067  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2944  allophanate hydrolase subunit 1  36.99 
 
 		 218 aa  124  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0869  hypothetical protein  39 
 
 		 218 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0820  hypothetical protein  39 
 
 		 218 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0835  hypothetical protein  39 
 
 		 218 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.473252  hitchhiker  0.00249119 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0759  hypothetical protein  39 
 
 		 218 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0772  hypothetical protein  39 
 
 		 218 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.984819 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0736  allophanate hydrolase, subunit 1  36.2 
 
 		 218 aa  122  5e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0628  allophanate hydrolase, subunit 1  35.51 
 
 		 218 aa  121  8e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2922  Allophanate hydrolase subunit 1  48.03 
 
 		 219 aa  121  8e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.820056  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2925  Allophanate hydrolase subunit 1  36.53 
 
 		 218 aa  121  9e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.401511  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00660  hypothetical protein  36.53 
 
 		 218 aa  121  9e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0801  allophanate hydrolase, subunit 1  36.53 
 
 		 218 aa  121  9e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0935394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0759  allophanate hydrolase, subunit 1  36.53 
 
 		 218 aa  121  9e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>