226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000163 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000163  allophanate hydrolase subunit 1  100 
 
 
227 aa  465  9.999999999999999e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.245335  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05796  allophanate hydrolase, subunit 1  67.84 
 
 
230 aa  324  7e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0717  hypothetical protein  45.81 
 
 
236 aa  188  5e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0448352  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3548  allophanate hydrolase subunit 1  43.05 
 
 
234 aa  170  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1984  hypothetical protein  42.78 
 
 
249 aa  169  4e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1437  putative allophanate hydrolase subunit 1  38.33 
 
 
239 aa  167  9e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58530  hypothetical protein  41.21 
 
 
225 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1828  Allophanate hydrolase subunit 1  38.01 
 
 
227 aa  159  3e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.700808  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1498  allophanate hydrolase subunit 1  39.11 
 
 
227 aa  159  5e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.403347  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5124  hypothetical protein  40.4 
 
 
225 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1737  allophanate hydrolase subunit 1  37.72 
 
 
226 aa  155  7e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.215551 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0988  allophanate hydrolase subunit 1  36.82 
 
 
238 aa  151  8.999999999999999e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0659374  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0360  allophanate hydrolase subunit 1  36.8 
 
 
234 aa  149  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.120122  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1700  hypothetical protein  38.12 
 
 
244 aa  148  7e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1666  hypothetical protein  38.12 
 
 
244 aa  148  7e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.947071  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1030  allophanate hydrolase subunit 1  39.8 
 
 
243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1172  hypothetical protein  37.96 
 
 
243 aa  136  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3379  allophanate hydrolase subunit 1  35.87 
 
 
234 aa  137  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.332563  normal  0.85037 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1313  allophanate hydrolase subunit 1  36.12 
 
 
228 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.837273  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4576  allophanate hydrolase subunit 1  36.4 
 
 
229 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.179191  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3876  allophanate hydrolase subunit 1  35.4 
 
 
231 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.348545  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1406  allophanate hydrolase subunit 1  36.61 
 
 
234 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4097  allophanate hydrolase subunit 1  33.62 
 
 
228 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0199778  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02000  conserved hypothetical protein TIGR00370  35.27 
 
 
242 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.620258 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2224  allophanate hydrolase subunit 1  37.96 
 
 
231 aa  132  5e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1595  allophanate hydrolase subunit 1  33.92 
 
 
243 aa  131  9e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08926  hypothetical protein  33.78 
 
 
243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3200  hypothetical protein  35.65 
 
 
237 aa  129  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0178  Allophanate hydrolase subunit 1  34.55 
 
 
242 aa  128  6e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12460  allophanate hydrolase subunit 1  39.9 
 
 
224 aa  128  8.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.460318  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37290  hypothetical protein  34.78 
 
 
237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000183786  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1950  Allophanate hydrolase subunit 1  34.63 
 
 
233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000391255  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2336  Allophanate hydrolase subunit 1  33.18 
 
 
230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1270  Allophanate hydrolase subunit 1  38.57 
 
 
221 aa  126  2.0000000000000002e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0478  allophanate hydrolase, subunit 1  33.78 
 
 
229 aa  126  3e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0521  Allophanate hydrolase subunit 1  37.63 
 
 
253 aa  126  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01081  Allophanate hydrolase, subunit 1  37.31 
 
 
244 aa  124  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.805249  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1506  hypothetical protein  35.59 
 
 
243 aa  124  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.227592  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3395  allophanate hydrolase subunit 1  33.33 
 
 
240 aa  122  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0629739 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3121  hypothetical protein  31.6 
 
 
237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785464  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2825  allophanate hydrolase subunit 1  33.91 
 
 
240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.140549  normal  0.0247911 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2148  hypothetical protein TIGR00370  31.17 
 
 
237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1713  hypothetical protein  34.35 
 
 
246 aa  119  3e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.115565  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3088  conserved hypothetical protein TIGR00370  30.74 
 
 
237 aa  119  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3120  conserved hypothetical protein TIGR00370  32.03 
 
 
237 aa  119  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000284554  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3741  Allophanate hydrolase subunit 1  36.51 
 
 
217 aa  119  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1527  hypothetical protein  33.77 
 
 
246 aa  119  3e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1900  hypothetical protein  34.35 
 
 
246 aa  119  4.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2874  allophanate hydrolase subunit 1  30.04 
 
 
237 aa  118  7e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.480079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2882  hypothetical protein  31.6 
 
 
237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0696288  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3102  conserved hypothetical protein TIGR00370  31.6 
 
 
237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3097  hypothetical protein  31.6 
 
 
237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.12026  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0869  hypothetical protein  37.11 
 
 
549 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1957  Allophanate hydrolase subunit 1  35.75 
 
 
218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.360214  hitchhiker  0.00204684 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2810  hypothetical protein  31.17 
 
 
237 aa  116  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2849  hypothetical protein  31.17 
 
 
237 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3082  hypothetical protein  35.6 
 
 
218 aa  115  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1100  allophanate hydrolase subunit 1  36.93 
 
 
217 aa  115  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.724491  normal  0.149569 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2948  allophanate hydrolase subunit 1  35.6 
 
 
218 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1226  Allophanate hydrolase subunit 1  44.37 
 
 
218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6384  hypothetical protein  34.76 
 
 
218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0195  hypothetical protein  36.42 
 
 
217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0710  Allophanate hydrolase subunit 1  33.48 
 
 
246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00179377  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3056  allophanate hydrolase subunit 1  34.76 
 
 
218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0256997 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5727  allophanate hydrolase subunit 2  38.95 
 
 
531 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506367  normal  0.818149 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0593  allophanate hydrolase subunit 1  35.86 
 
 
234 aa  112  5e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0362915  normal  0.623241 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3511  allophanate hydrolase subunit 2  38.8 
 
 
539 aa  112  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.80956  normal  0.701023 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2423  hypothetical protein  34.29 
 
 
218 aa  111  9e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3037  hypothetical protein  34.29 
 
 
218 aa  111  9e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.998817  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1145  Allophanate hydrolase subunit 1  33.69 
 
 
229 aa  111  9e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.110827  normal  0.406689 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7093  allophanate hydrolase subunit 2  36.36 
 
 
209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.166941  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0544  putative allophanate hydrolase  35.35 
 
 
549 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00179093  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2624  hypothetical protein  31.48 
 
 
249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2958  Allophanate hydrolase subunit 1  30.09 
 
 
242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3110  Allophanate hydrolase subunit 1  42.96 
 
 
218 aa  109  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0230  hypothetical protein  36.42 
 
 
259 aa  109  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2922  Allophanate hydrolase subunit 1  39.6 
 
 
219 aa  109  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.820056  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3032  allophanate hydrolase subunit 1  34.78 
 
 
218 aa  109  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0023  hypothetical protein  35 
 
 
220 aa  109  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00309648 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3311  hypothetical protein  36.63 
 
 
218 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2981  hypothetical protein  36.63 
 
 
218 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78206  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2111  hypothetical protein  36.63 
 
 
218 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3367  putative allophanate hydrolase, subunit 1  36.63 
 
 
218 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0010  allophanate hydrolase subunit 1  31.65 
 
 
226 aa  108  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000602904 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0449  hypothetical protein  36.63 
 
 
256 aa  108  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0266  putative allophanate hydrolase, subunit 1  36.63 
 
 
256 aa  108  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251765  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0254  putative allophanate hydrolase, subunit 1  36.63 
 
 
256 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4346  allophanate hydrolase subunit 1  39.33 
 
 
201 aa  108  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2040  hypothetical protein  30.88 
 
 
243 aa  107  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.733064  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3450  hypothetical protein  33.52 
 
 
245 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5815  allophanate hydrolase subunit 1  35.87 
 
 
244 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100836  normal  0.0693408 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5847  hypothetical protein  37.29 
 
 
541 aa  106  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0879773  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0012  hypothetical protein  40 
 
 
228 aa  105  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000230689 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2047  allophanate hydrolase subunit 1  34.27 
 
 
244 aa  105  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.684193  normal  0.286348 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2450  allophanate hydrolase subunit 2  38.82 
 
 
553 aa  105  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.76901  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6832  Allophanate hydrolase subunit 1  34.29 
 
 
200 aa  105  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0466  Allophanate hydrolase subunit 1  29.35 
 
 
243 aa  105  6e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0869  hypothetical protein  30.88 
 
 
218 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0759  hypothetical protein  30.41 
 
 
218 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0772  hypothetical protein  30.41 
 
 
218 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.984819 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>