224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01081 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01081  Allophanate hydrolase, subunit 1  100 
 
 		 244 aa  507  1e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.805249  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1984  hypothetical protein  36.75 
 
 		 249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1828  Allophanate hydrolase subunit 1  43.55 
 
 		 227 aa  152  4e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.700808  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1498  allophanate hydrolase subunit 1  39.7 
 
 		 227 aa  146  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.403347  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0710  Allophanate hydrolase subunit 1  36.64 
 
 		 246 aa  144  2e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00179377  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3876  allophanate hydrolase subunit 1  39.51 
 
 		 231 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.348545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1737  allophanate hydrolase subunit 1  35.84 
 
 		 226 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.215551 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4097  allophanate hydrolase subunit 1  39.17 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0199778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1270  Allophanate hydrolase subunit 1  35.84 
 
 		 221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1406  allophanate hydrolase subunit 1  38.24 
 
 		 234 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1437  putative allophanate hydrolase subunit 1  34.98 
 
 		 239 aa  139  3.9999999999999997e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1030  allophanate hydrolase subunit 1  38.56 
 
 		 243 aa  139  6e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1145  Allophanate hydrolase subunit 1  33.62 
 
 		 229 aa  136  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.110827  normal  0.406689 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0360  allophanate hydrolase subunit 1  35.85 
 
 		 234 aa  137  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.120122  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4576  allophanate hydrolase subunit 1  38.56 
 
 		 229 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.179191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1700  hypothetical protein  32.43 
 
 		 244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3379  allophanate hydrolase subunit 1  35.19 
 
 		 234 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.332563  normal  0.85037 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1666  hypothetical protein  32.43 
 
 		 244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.947071  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1313  allophanate hydrolase subunit 1  38.56 
 
 		 228 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.837273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0521  Allophanate hydrolase subunit 1  36.6 
 
 		 253 aa  135  8e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1950  Allophanate hydrolase subunit 1  34.98 
 
 		 233 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000391255  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2336  Allophanate hydrolase subunit 1  35.14 
 
 		 230 aa  133  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1595  allophanate hydrolase subunit 1  33.48 
 
 		 243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3548  allophanate hydrolase subunit 1  35.48 
 
 		 234 aa  129  4.0000000000000003e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2810  hypothetical protein  30.7 
 
 		 237 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3088  conserved hypothetical protein TIGR00370  31.54 
 
 		 237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2148  hypothetical protein TIGR00370  30.58 
 
 		 237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3121  hypothetical protein  30.7 
 
 		 237 aa  126  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785464  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3102  conserved hypothetical protein TIGR00370  30.21 
 
 		 237 aa  126  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0988  allophanate hydrolase subunit 1  31.2 
 
 		 238 aa  126  3e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0659374  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2874  allophanate hydrolase subunit 1  30.7 
 
 		 237 aa  126  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.480079  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2062  allophanate hydrolase subunit 1  29.78 
 
 		 233 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.206067  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2825  allophanate hydrolase subunit 1  35.02 
 
 		 240 aa  125  5e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.140549  normal  0.0247911 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3200  hypothetical protein  45.11 
 
 		 237 aa  125  6e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37290  hypothetical protein  45.11 
 
 		 237 aa  125  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000183786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3120  conserved hypothetical protein TIGR00370  30.26 
 
 		 237 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000284554  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4367  Allophanate hydrolase subunit 1  35.64 
 
 		 215 aa  125  9e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2882  hypothetical protein  30.43 
 
 		 237 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0696288  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2849  hypothetical protein  30.43 
 
 		 237 aa  124  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3097  hypothetical protein  30.43 
 
 		 237 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.12026  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3741  Allophanate hydrolase subunit 1  36.98 
 
 		 217 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3032  allophanate hydrolase subunit 1  34.34 
 
 		 218 aa  124  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000163  allophanate hydrolase subunit 1  37.31 
 
 		 227 aa  124  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.245335  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05796  allophanate hydrolase, subunit 1  37.84 
 
 		 230 aa  123  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1527  hypothetical protein  32.98 
 
 		 246 aa  122  5e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5124  hypothetical protein  35.64 
 
 		 225 aa  122  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1900  hypothetical protein  34.41 
 
 		 246 aa  121  9e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1713  hypothetical protein  34.04 
 
 		 246 aa  121  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.115565  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2903  allophanate hydrolase subunit 1  36.14 
 
 		 217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.282421 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6384  hypothetical protein  34.01 
 
 		 218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2423  hypothetical protein  34.01 
 
 		 218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3037  hypothetical protein  34.01 
 
 		 218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.998817  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0195  hypothetical protein  36.52 
 
 		 217 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3311  hypothetical protein  32.32 
 
 		 218 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0449  hypothetical protein  32.32 
 
 		 256 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2224  allophanate hydrolase subunit 1  32.55 
 
 		 231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0230  hypothetical protein  32.99 
 
 		 259 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6350  Allophanate hydrolase subunit 1  35.68 
 
 		 204 aa  119  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2981  hypothetical protein  32.32 
 
 		 218 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78206  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2111  hypothetical protein  32.32 
 
 		 218 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0266  putative allophanate hydrolase, subunit 1  32.32 
 
 		 256 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251765  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3367  putative allophanate hydrolase, subunit 1  32.32 
 
 		 218 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0478  allophanate hydrolase, subunit 1  30.8 
 
 		 229 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3056  allophanate hydrolase subunit 1  33.5 
 
 		 218 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0256997 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1506  hypothetical protein  34.91 
 
 		 243 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.227592  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0869  hypothetical protein  41.3 
 
 		 218 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0254  putative allophanate hydrolase, subunit 1  32.32 
 
 		 256 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2948  allophanate hydrolase subunit 1  34.33 
 
 		 218 aa  119  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3082  hypothetical protein  34.33 
 
 		 218 aa  118  7e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0759  hypothetical protein  40.58 
 
 		 218 aa  118  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0820  hypothetical protein  40.58 
 
 		 218 aa  118  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0835  hypothetical protein  40.58 
 
 		 218 aa  118  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.473252  hitchhiker  0.00249119 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0736  allophanate hydrolase, subunit 1  35.56 
 
 		 218 aa  118  7.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0772  hypothetical protein  40.58 
 
 		 218 aa  118  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.984819 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2073  Allophanate hydrolase subunit 2  34.8 
 
 		 499 aa  118  7.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.721268 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1100  allophanate hydrolase subunit 1  43.31 
 
 		 217 aa  118  9e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.724491  normal  0.149569 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1172  hypothetical protein  28.89 
 
 		 243 aa  117  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2374  Allophanate hydrolase subunit 1  32.66 
 
 		 215 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.635342 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1974  Allophanate hydrolase subunit 1  32.66 
 
 		 215 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3395  allophanate hydrolase subunit 1  30.58 
 
 		 240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0629739 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00671  predicted enzyme subunit  35.56 
 
 		 218 aa  116  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2925  Allophanate hydrolase subunit 1  35.56 
 
 		 218 aa  116  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.401511  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0726  allophanate hydrolase, subunit 1  35.56 
 
 		 218 aa  116  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.385331  normal  0.445001 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0801  allophanate hydrolase, subunit 1  35.56 
 
 		 218 aa  116  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0935394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0628  allophanate hydrolase, subunit 1  43.48 
 
 		 218 aa  116  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2790  Allophanate hydrolase subunit 1  41.3 
 
 		 239 aa  116  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00660  hypothetical protein  35.56 
 
 		 218 aa  116  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2944  allophanate hydrolase subunit 1  43.48 
 
 		 218 aa  116  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0759  allophanate hydrolase, subunit 1  35.56 
 
 		 218 aa  116  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12460  allophanate hydrolase subunit 1  34.89 
 
 		 224 aa  116  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.460318  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0087  hypothetical protein  33.68 
 
 		 216 aa  115  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595386  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58530  hypothetical protein  35.11 
 
 		 225 aa  115  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2922  Allophanate hydrolase subunit 1  36.22 
 
 		 219 aa  115  6e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.820056  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2171  hypothetical protein  34.98 
 
 		 215 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.452484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1214  allophanate hydrolase subunit 1  42.03 
 
 		 218 aa  114  8.999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.491442  normal  0.0321852 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0008  allophanate hydrolase subunit 1  33.33 
 
 		 228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137026 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0178  Allophanate hydrolase subunit 1  32.7 
 
 		 242 aa  113  3e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4346  allophanate hydrolase subunit 1  35.36 
 
 		 201 aa  113  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1957  Allophanate hydrolase subunit 1  33.04 
 
 		 218 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.360214  hitchhiker  0.00204684 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1255  allophanate hydrolase subunit 1  31.63 
 
 		 218 aa  112  7.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0342486  normal  0.816656 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>