239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1828 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1828  Allophanate hydrolase subunit 1  100 
 
 
227 aa  456  1e-127  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.700808  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1737  allophanate hydrolase subunit 1  43.24 
 
 
226 aa  193  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.215551 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1984  hypothetical protein  47.25 
 
 
249 aa  187  9e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1498  allophanate hydrolase subunit 1  42.34 
 
 
227 aa  185  5e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.403347  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0360  allophanate hydrolase subunit 1  41.92 
 
 
234 aa  185  6e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.120122  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1437  putative allophanate hydrolase subunit 1  37.1 
 
 
239 aa  178  4.999999999999999e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3548  allophanate hydrolase subunit 1  40.89 
 
 
234 aa  177  9e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1030  allophanate hydrolase subunit 1  42.15 
 
 
243 aa  177  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2336  Allophanate hydrolase subunit 1  42.72 
 
 
230 aa  176  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3379  allophanate hydrolase subunit 1  39.11 
 
 
234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.332563  normal  0.85037 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1950  Allophanate hydrolase subunit 1  42.59 
 
 
233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000391255  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1406  allophanate hydrolase subunit 1  40.89 
 
 
234 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3876  allophanate hydrolase subunit 1  43.11 
 
 
231 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.348545  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1900  hypothetical protein  40.36 
 
 
246 aa  172  5e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1270  Allophanate hydrolase subunit 1  41.51 
 
 
221 aa  170  1e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1713  hypothetical protein  40.36 
 
 
246 aa  170  2e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.115565  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4097  allophanate hydrolase subunit 1  41.78 
 
 
228 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0199778  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1527  hypothetical protein  40.36 
 
 
246 aa  169  3e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1313  allophanate hydrolase subunit 1  42.22 
 
 
228 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.837273  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4576  allophanate hydrolase subunit 1  42.22 
 
 
229 aa  168  8e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.179191  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3395  allophanate hydrolase subunit 1  39.27 
 
 
240 aa  167  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0629739 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0988  allophanate hydrolase subunit 1  38.18 
 
 
238 aa  166  2.9999999999999998e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0659374  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02000  conserved hypothetical protein TIGR00370  40.55 
 
 
242 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.620258 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1145  Allophanate hydrolase subunit 1  37.38 
 
 
229 aa  164  9e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.110827  normal  0.406689 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0710  Allophanate hydrolase subunit 1  39.37 
 
 
246 aa  162  3e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00179377  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0478  allophanate hydrolase, subunit 1  43.13 
 
 
229 aa  160  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000163  allophanate hydrolase subunit 1  38.01 
 
 
227 aa  159  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.245335  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37290  hypothetical protein  41.07 
 
 
237 aa  158  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000183786  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3200  hypothetical protein  41.07 
 
 
237 aa  158  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05796  allophanate hydrolase, subunit 1  39.64 
 
 
230 aa  157  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0178  Allophanate hydrolase subunit 1  40.09 
 
 
242 aa  157  2e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1595  allophanate hydrolase subunit 1  36.32 
 
 
243 aa  155  7e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3120  conserved hypothetical protein TIGR00370  37.78 
 
 
237 aa  154  8e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000284554  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2148  hypothetical protein TIGR00370  37.44 
 
 
237 aa  154  8e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01081  Allophanate hydrolase, subunit 1  43.55 
 
 
244 aa  152  2.9999999999999998e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.805249  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2874  allophanate hydrolase subunit 1  38.05 
 
 
237 aa  151  7e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.480079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2882  hypothetical protein  37.61 
 
 
237 aa  150  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0696288  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2810  hypothetical protein  37.61 
 
 
237 aa  150  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3097  hypothetical protein  37.61 
 
 
237 aa  150  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.12026  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3102  conserved hypothetical protein TIGR00370  37.61 
 
 
237 aa  150  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3088  conserved hypothetical protein TIGR00370  36.89 
 
 
237 aa  151  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2849  hypothetical protein  37.61 
 
 
237 aa  149  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5124  hypothetical protein  45.83 
 
 
225 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58530  hypothetical protein  42.27 
 
 
225 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3121  hypothetical protein  36.56 
 
 
237 aa  149  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785464  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1957  Allophanate hydrolase subunit 1  37.32 
 
 
218 aa  148  6e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.360214  hitchhiker  0.00204684 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0521  Allophanate hydrolase subunit 1  38.89 
 
 
253 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0717  hypothetical protein  36.82 
 
 
236 aa  146  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0448352  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1978  Allophanate hydrolase subunit 1  38.36 
 
 
235 aa  146  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.438933  normal  0.04719 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1172  hypothetical protein  33.64 
 
 
243 aa  144  9e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5815  allophanate hydrolase subunit 1  39.57 
 
 
244 aa  144  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100836  normal  0.0693408 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12460  allophanate hydrolase subunit 1  47.57 
 
 
224 aa  142  6e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.460318  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0372  allophanate hydrolase subunit 1  37.21 
 
 
249 aa  139  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.701967  normal  0.529517 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1700  hypothetical protein  32.27 
 
 
244 aa  139  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1666  hypothetical protein  32.27 
 
 
244 aa  139  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.947071  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1506  hypothetical protein  38.79 
 
 
243 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.227592  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2825  allophanate hydrolase subunit 1  34.47 
 
 
240 aa  138  8.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.140549  normal  0.0247911 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3450  hypothetical protein  37.67 
 
 
245 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1534  allophanate hydrolase subunit 1  40.28 
 
 
241 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.107979 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3741  Allophanate hydrolase subunit 1  41.32 
 
 
217 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1814  Allophanate hydrolase subunit 1  39.81 
 
 
241 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.21016  normal  0.134293 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3430  allophanate hydrolase subunit 1  39.3 
 
 
257 aa  133  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.381456  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2224  allophanate hydrolase subunit 1  36.92 
 
 
231 aa  133  3e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3311  hypothetical protein  38.82 
 
 
218 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2981  hypothetical protein  38.82 
 
 
218 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78206  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2111  hypothetical protein  38.82 
 
 
218 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3095  allophanate hydrolase subunit 1  36.32 
 
 
244 aa  132  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.686624  normal  0.352303 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3367  putative allophanate hydrolase, subunit 1  38.82 
 
 
218 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0449  hypothetical protein  38.82 
 
 
256 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0230  hypothetical protein  38.82 
 
 
259 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0195  hypothetical protein  41.32 
 
 
217 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0254  putative allophanate hydrolase, subunit 1  38.82 
 
 
256 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0266  putative allophanate hydrolase, subunit 1  38.82 
 
 
256 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251765  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3353  allophanate hydrolase subunit 1  37.09 
 
 
244 aa  132  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2062  allophanate hydrolase subunit 1  33.48 
 
 
233 aa  132  6e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.206067  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3056  allophanate hydrolase subunit 1  36.11 
 
 
218 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0256997 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08926  hypothetical protein  34.72 
 
 
243 aa  130  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2132  allophanate hydrolase subunit 1  35.19 
 
 
240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.317589 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0008  allophanate hydrolase subunit 1  50 
 
 
228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00137026 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6384  hypothetical protein  36.11 
 
 
218 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2040  hypothetical protein  36.28 
 
 
243 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.733064  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2047  allophanate hydrolase subunit 1  36 
 
 
244 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.684193  normal  0.286348 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2423  hypothetical protein  35.65 
 
 
218 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3037  hypothetical protein  35.65 
 
 
218 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.998817  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2948  allophanate hydrolase subunit 1  40 
 
 
218 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1136  Allophanate hydrolase subunit 1  37.76 
 
 
218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3082  hypothetical protein  40 
 
 
218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2790  Allophanate hydrolase subunit 1  40.32 
 
 
239 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1167  allophanate hydrolase subunit 1  37.44 
 
 
218 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000046539  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1115  hypothetical protein  37.44 
 
 
218 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000190238  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2903  allophanate hydrolase subunit 1  40.12 
 
 
217 aa  126  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.282421 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1385  Allophanate hydrolase subunit 1  38.01 
 
 
242 aa  126  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.949213 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1100  allophanate hydrolase subunit 1  45 
 
 
217 aa  125  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.724491  normal  0.149569 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3032  allophanate hydrolase subunit 1  40 
 
 
218 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1709  Allophanate hydrolase subunit 1  37.85 
 
 
241 aa  125  5e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896853  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1104  Allophanate hydrolase subunit 1  35.71 
 
 
244 aa  125  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0177742  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2624  hypothetical protein  34.74 
 
 
249 aa  125  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4367  Allophanate hydrolase subunit 1  34.6 
 
 
215 aa  124  8.000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0025  allophanate hydrolase, subunit 1  35.24 
 
 
215 aa  124  1e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2922  Allophanate hydrolase subunit 1  39.06 
 
 
219 aa  124  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.820056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>