261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1506 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1506  hypothetical protein  100 
 
 		 243 aa  482  1e-135  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.227592  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0521  Allophanate hydrolase subunit 1  49.39 
 
 		 253 aa  224  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0478  allophanate hydrolase, subunit 1  47.71 
 
 		 229 aa  188  7e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1270  Allophanate hydrolase subunit 1  40.45 
 
 		 221 aa  164  8e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3056  allophanate hydrolase subunit 1  51.61 
 
 		 218 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0256997 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3395  allophanate hydrolase subunit 1  42.6 
 
 		 240 aa  162  5.0000000000000005e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0629739 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2948  allophanate hydrolase subunit 1  51.08 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3082  hypothetical protein  51.08 
 
 		 218 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3741  Allophanate hydrolase subunit 1  50.57 
 
 		 217 aa  161  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6384  hypothetical protein  51.61 
 
 		 218 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1950  Allophanate hydrolase subunit 1  40.36 
 
 		 233 aa  159  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000391255  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3311  hypothetical protein  48.59 
 
 		 218 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0449  hypothetical protein  48.59 
 
 		 256 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02000  conserved hypothetical protein TIGR00370  39.91 
 
 		 242 aa  159  3e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.620258 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2423  hypothetical protein  51.08 
 
 		 218 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3037  hypothetical protein  51.08 
 
 		 218 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.998817  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2981  hypothetical protein  48.59 
 
 		 218 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78206  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2111  hypothetical protein  48.59 
 
 		 218 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0266  putative allophanate hydrolase, subunit 1  48.59 
 
 		 256 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251765  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3367  putative allophanate hydrolase, subunit 1  48.59 
 
 		 218 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2336  Allophanate hydrolase subunit 1  43.67 
 
 		 230 aa  159  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0230  hypothetical protein  48.3 
 
 		 259 aa  159  5e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0710  Allophanate hydrolase subunit 1  38.74 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00179377  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3032  allophanate hydrolase subunit 1  49.46 
 
 		 218 aa  157  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5124  hypothetical protein  48.4 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2624  hypothetical protein  42.62 
 
 		 249 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0195  hypothetical protein  50.59 
 
 		 217 aa  156  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0254  putative allophanate hydrolase, subunit 1  48.02 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3548  allophanate hydrolase subunit 1  40.38 
 
 		 234 aa  155  4e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5815  allophanate hydrolase subunit 1  45 
 
 		 244 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100836  normal  0.0693408 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58530  hypothetical protein  48.11 
 
 		 225 aa  155  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2958  Allophanate hydrolase subunit 1  39.63 
 
 		 242 aa  154  8e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2832  hypothetical protein  40.85 
 
 		 242 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.180643  normal  0.812146 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1145  Allophanate hydrolase subunit 1  35.81 
 
 		 229 aa  152  5e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.110827  normal  0.406689 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1498  allophanate hydrolase subunit 1  42.03 
 
 		 227 aa  152  5e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.403347  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0087  hypothetical protein  48.13 
 
 		 216 aa  151  7e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595386  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12460  allophanate hydrolase subunit 1  46.4 
 
 		 224 aa  150  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.460318  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2374  Allophanate hydrolase subunit 1  45.56 
 
 		 215 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.635342 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2171  hypothetical protein  47.78 
 
 		 215 aa  149  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.452484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2132  allophanate hydrolase subunit 1  44.75 
 
 		 240 aa  149  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.317589 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1974  Allophanate hydrolase subunit 1  45 
 
 		 215 aa  149  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1595  allophanate hydrolase subunit 1  33.74 
 
 		 243 aa  149  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2148  hypothetical protein TIGR00370  37.12 
 
 		 237 aa  149  5e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0062  hypothetical protein  44.9 
 
 		 216 aa  148  8e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0988  allophanate hydrolase subunit 1  34.84 
 
 		 238 aa  148  8e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0659374  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2636  hypothetical protein  39.83 
 
 		 242 aa  148  9e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.24477  decreased coverage  0.0000373796 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3088  conserved hypothetical protein TIGR00370  38.12 
 
 		 237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2903  allophanate hydrolase subunit 1  51.41 
 
 		 217 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.282421 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3121  hypothetical protein  36.52 
 
 		 237 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785464  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2040  hypothetical protein  37.55 
 
 		 243 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.733064  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2874  allophanate hydrolase subunit 1  35.81 
 
 		 237 aa  145  6e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.480079  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0178  Allophanate hydrolase subunit 1  35.83 
 
 		 242 aa  145  6e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3102  conserved hypothetical protein TIGR00370  36.09 
 
 		 237 aa  144  9e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2882  hypothetical protein  36.09 
 
 		 237 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0696288  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1957  Allophanate hydrolase subunit 1  47.7 
 
 		 218 aa  144  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.360214  hitchhiker  0.00204684 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3097  hypothetical protein  36.09 
 
 		 237 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.12026  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4367  Allophanate hydrolase subunit 1  43.41 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2849  hypothetical protein  36.09 
 
 		 237 aa  143  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1214  allophanate hydrolase subunit 1  42.65 
 
 		 218 aa  144  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.491442  normal  0.0321852 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2810  hypothetical protein  35.65 
 
 		 237 aa  142  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0899  Allophanate hydrolase subunit 1  43.19 
 
 		 221 aa  141  8e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.605422  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1534  allophanate hydrolase subunit 1  42.25 
 
 		 241 aa  141  8e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.107979 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0759  hypothetical protein  41.26 
 
 		 218 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0869  hypothetical protein  41.26 
 
 		 218 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0835  hypothetical protein  41.26 
 
 		 218 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.473252  hitchhiker  0.00249119 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0820  hypothetical protein  41.26 
 
 		 218 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4132  putative carboxylase  40.79 
 
 		 243 aa  140  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1709  Allophanate hydrolase subunit 1  43.06 
 
 		 241 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0772  hypothetical protein  41.26 
 
 		 218 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.984819 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1172  hypothetical protein  32.88 
 
 		 243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1814  Allophanate hydrolase subunit 1  42.25 
 
 		 241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.21016  normal  0.134293 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1984  hypothetical protein  33.62 
 
 		 249 aa  139  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2922  Allophanate hydrolase subunit 1  43.92 
 
 		 219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.820056  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1501  hypothetical protein  37.55 
 
 		 244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0895527 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3430  allophanate hydrolase subunit 1  38.05 
 
 		 257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.381456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1030  allophanate hydrolase subunit 1  44.74 
 
 		 243 aa  139  4.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1828  Allophanate hydrolase subunit 1  38.79 
 
 		 227 aa  139  4.999999999999999e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.700808  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3120  conserved hypothetical protein TIGR00370  35.22 
 
 		 237 aa  138  7e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000284554  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1104  Allophanate hydrolase subunit 1  42.53 
 
 		 244 aa  138  7e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0177742  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1437  putative allophanate hydrolase subunit 1  36.04 
 
 		 239 aa  138  7.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08926  hypothetical protein  36.27 
 
 		 243 aa  137  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2062  allophanate hydrolase subunit 1  36.48 
 
 		 233 aa  136  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.206067  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1378  Allophanate hydrolase subunit 1  49.41 
 
 		 222 aa  137  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.239875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1737  allophanate hydrolase subunit 1  34.25 
 
 		 226 aa  137  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.215551 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1406  allophanate hydrolase subunit 1  42.99 
 
 		 234 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2224  allophanate hydrolase subunit 1  39.6 
 
 		 231 aa  136  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2825  allophanate hydrolase subunit 1  35.68 
 
 		 240 aa  135  5e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.140549  normal  0.0247911 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2944  allophanate hydrolase subunit 1  40.78 
 
 		 218 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3379  allophanate hydrolase subunit 1  44.26 
 
 		 234 aa  135  8e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.332563  normal  0.85037 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1829  Allophanate hydrolase subunit 2  42.36 
 
 		 506 aa  135  8e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.359832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3353  allophanate hydrolase subunit 1  40.17 
 
 		 244 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0360  allophanate hydrolase subunit 1  35.27 
 
 		 234 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.120122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1255  allophanate hydrolase subunit 1  40.48 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0342486  normal  0.816656 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1666  hypothetical protein  30.7 
 
 		 244 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.947071  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1100  allophanate hydrolase subunit 1  37.32 
 
 		 217 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.724491  normal  0.149569 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1700  hypothetical protein  30.7 
 
 		 244 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1136  Allophanate hydrolase subunit 1  41.97 
 
 		 218 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2925  Allophanate hydrolase subunit 1  40.29 
 
 		 218 aa  133  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.401511  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0736  allophanate hydrolase, subunit 1  39.15 
 
 		 218 aa  132  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00660  hypothetical protein  40.29 
 
 		 218 aa  133  3e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>