227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0717 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0717  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  485  1e-136  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0448352  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05796  allophanate hydrolase, subunit 1  46.46 
 
 		 230 aa  214  8e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000163  allophanate hydrolase subunit 1  45.81 
 
 		 227 aa  204  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.245335  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3548  allophanate hydrolase subunit 1  46.97 
 
 		 234 aa  192  5e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1498  allophanate hydrolase subunit 1  42.41 
 
 		 227 aa  176  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.403347  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1437  putative allophanate hydrolase subunit 1  38.67 
 
 		 239 aa  167  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1737  allophanate hydrolase subunit 1  37.61 
 
 		 226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.215551 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1984  hypothetical protein  38.38 
 
 		 249 aa  159  4e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1828  Allophanate hydrolase subunit 1  36.82 
 
 		 227 aa  156  3e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.700808  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3379  allophanate hydrolase subunit 1  43.39 
 
 		 234 aa  155  4e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.332563  normal  0.85037 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58530  hypothetical protein  39.82 
 
 		 225 aa  154  9e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08926  hypothetical protein  34.93 
 
 		 243 aa  152  2.9999999999999998e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5124  hypothetical protein  39.56 
 
 		 225 aa  150  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4576  allophanate hydrolase subunit 1  38.84 
 
 		 229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.179191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4097  allophanate hydrolase subunit 1  40.18 
 
 		 228 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0199778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1313  allophanate hydrolase subunit 1  38.84 
 
 		 228 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.837273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1406  allophanate hydrolase subunit 1  41.23 
 
 		 234 aa  145  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37290  hypothetical protein  39.57 
 
 		 237 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000183786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3200  hypothetical protein  39.57 
 
 		 237 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0360  allophanate hydrolase subunit 1  35.09 
 
 		 234 aa  142  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.120122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3876  allophanate hydrolase subunit 1  38.86 
 
 		 231 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.348545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1030  allophanate hydrolase subunit 1  36.04 
 
 		 243 aa  138  7e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2336  Allophanate hydrolase subunit 1  34.82 
 
 		 230 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12460  allophanate hydrolase subunit 1  39.74 
 
 		 224 aa  132  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.460318  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0710  Allophanate hydrolase subunit 1  33.33 
 
 		 246 aa  132  5e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00179377  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1700  hypothetical protein  31.53 
 
 		 244 aa  129  6e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1666  hypothetical protein  31.53 
 
 		 244 aa  129  6e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.947071  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1950  Allophanate hydrolase subunit 1  33.95 
 
 		 233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000391255  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0988  allophanate hydrolase subunit 1  33.49 
 
 		 238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0659374  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3120  conserved hypothetical protein TIGR00370  31.74 
 
 		 237 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000284554  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3395  allophanate hydrolase subunit 1  38.76 
 
 		 240 aa  126  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0629739 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2874  allophanate hydrolase subunit 1  32.91 
 
 		 237 aa  126  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.480079  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2148  hypothetical protein TIGR00370  31.74 
 
 		 237 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0178  Allophanate hydrolase subunit 1  33.48 
 
 		 242 aa  126  4.0000000000000003e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1957  Allophanate hydrolase subunit 1  36.41 
 
 		 218 aa  125  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.360214  hitchhiker  0.00204684 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1270  Allophanate hydrolase subunit 1  32.88 
 
 		 221 aa  125  6e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3121  hypothetical protein  31.74 
 
 		 237 aa  124  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785464  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3088  conserved hypothetical protein TIGR00370  30.84 
 
 		 237 aa  124  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2849  hypothetical protein  31.3 
 
 		 237 aa  122  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2810  hypothetical protein  31.3 
 
 		 237 aa  123  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2882  hypothetical protein  31.3 
 
 		 237 aa  122  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0696288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3097  hypothetical protein  31.3 
 
 		 237 aa  122  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.12026  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3102  conserved hypothetical protein TIGR00370  31.3 
 
 		 237 aa  122  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1172  hypothetical protein  32.13 
 
 		 243 aa  121  7e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1506  hypothetical protein  40.34 
 
 		 243 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.227592  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1595  allophanate hydrolase subunit 1  30.36 
 
 		 243 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01081  Allophanate hydrolase, subunit 1  35.71 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.805249  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1527  hypothetical protein  30.53 
 
 		 246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1900  hypothetical protein  30.09 
 
 		 246 aa  119  3.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0478  allophanate hydrolase, subunit 1  35.14 
 
 		 229 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1713  hypothetical protein  30.09 
 
 		 246 aa  119  4.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.115565  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0521  Allophanate hydrolase subunit 1  36.72 
 
 		 253 aa  119  6e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5847  hypothetical protein  35.85 
 
 		 541 aa  117  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0879773  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1974  Allophanate hydrolase subunit 1  38.82 
 
 		 215 aa  115  6e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2825  allophanate hydrolase subunit 1  30.77 
 
 		 240 aa  115  6e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.140549  normal  0.0247911 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0195  hypothetical protein  39.05 
 
 		 217 aa  115  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0230  hypothetical protein  36.65 
 
 		 259 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2374  Allophanate hydrolase subunit 1  38.82 
 
 		 215 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.635342 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3311  hypothetical protein  40.35 
 
 		 218 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2981  hypothetical protein  40.35 
 
 		 218 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78206  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2111  hypothetical protein  40.35 
 
 		 218 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3367  putative allophanate hydrolase, subunit 1  40.35 
 
 		 218 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0449  hypothetical protein  40.35 
 
 		 256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2790  Allophanate hydrolase subunit 1  46.21 
 
 		 239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0254  putative allophanate hydrolase, subunit 1  39.05 
 
 		 256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0266  putative allophanate hydrolase, subunit 1  40.35 
 
 		 256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251765  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3741  Allophanate hydrolase subunit 1  38.46 
 
 		 217 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0869  hypothetical protein  45.45 
 
 		 218 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0820  hypothetical protein  44.7 
 
 		 218 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4367  Allophanate hydrolase subunit 1  34.13 
 
 		 215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0759  hypothetical protein  44.7 
 
 		 218 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6350  Allophanate hydrolase subunit 1  37.99 
 
 		 204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0772  hypothetical protein  44.7 
 
 		 218 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.984819 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0835  hypothetical protein  44.7 
 
 		 218 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.473252  hitchhiker  0.00249119 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1145  Allophanate hydrolase subunit 1  29.15 
 
 		 229 aa  112  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.110827  normal  0.406689 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02000  conserved hypothetical protein TIGR00370  35.71 
 
 		 242 aa  112  6e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.620258 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2171  hypothetical protein  35.55 
 
 		 215 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.452484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2903  allophanate hydrolase subunit 1  47.15 
 
 		 217 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.282421 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0544  putative allophanate hydrolase  34.05 
 
 		 549 aa  110  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00179093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0466  Allophanate hydrolase subunit 1  34.04 
 
 		 243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6832  Allophanate hydrolase subunit 1  38.73 
 
 		 200 aa  111  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0869  hypothetical protein  38.15 
 
 		 549 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3032  allophanate hydrolase subunit 1  38.46 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0593  allophanate hydrolase subunit 1  34.84 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0362915  normal  0.623241 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3056  allophanate hydrolase subunit 1  37.87 
 
 		 218 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0256997 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2224  allophanate hydrolase subunit 1  39.74 
 
 		 231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0533  urea amidolyase related protein  31.6 
 
 		 518 aa  109  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.384607  normal  0.0140832 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0008  allophanate hydrolase subunit 1  43.26 
 
 		 228 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137026 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2624  hypothetical protein  29.41 
 
 		 249 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3511  allophanate hydrolase subunit 2  35.94 
 
 		 539 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.80956  normal  0.701023 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1801  hypothetical protein  32.86 
 
 		 205 aa  108  8.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.145263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2073  Allophanate hydrolase subunit 2  36.78 
 
 		 499 aa  108  9.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.721268 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0499  Urea amidolyase-related protein  36.08 
 
 		 534 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0087  hypothetical protein  43.18 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595386  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00671  predicted enzyme subunit  44.36 
 
 		 218 aa  106  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2925  Allophanate hydrolase subunit 1  44.36 
 
 		 218 aa  106  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.401511  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0759  allophanate hydrolase, subunit 1  44.36 
 
 		 218 aa  106  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0726  allophanate hydrolase, subunit 1  44.36 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.385331  normal  0.445001 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2423  hypothetical protein  37.28 
 
 		 218 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3037  hypothetical protein  37.28 
 
 		 218 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.998817  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>