260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2132 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_2132  allophanate hydrolase subunit 1  100 
 
 
240 aa  471  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.317589 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1104  Allophanate hydrolase subunit 1  83.61 
 
 
244 aa  389  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0177742  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3353  allophanate hydrolase subunit 1  69.17 
 
 
244 aa  306  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1496  allophanate hydrolase subunit 1  62.61 
 
 
252 aa  281  8.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0288059  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3141  allophanate hydrolase subunit 1  51.91 
 
 
239 aa  211  5.999999999999999e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5815  allophanate hydrolase subunit 1  49.38 
 
 
244 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100836  normal  0.0693408 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1385  Allophanate hydrolase subunit 1  51.1 
 
 
242 aa  189  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.949213 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2636  hypothetical protein  44.02 
 
 
242 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.24477  decreased coverage  0.0000373796 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2624  hypothetical protein  44.68 
 
 
249 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2832  hypothetical protein  42.92 
 
 
242 aa  184  9e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.180643  normal  0.812146 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2336  Allophanate hydrolase subunit 1  44.13 
 
 
230 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0521  Allophanate hydrolase subunit 1  42.98 
 
 
253 aa  169  4e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2958  Allophanate hydrolase subunit 1  40.26 
 
 
242 aa  168  7e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3430  allophanate hydrolase subunit 1  42.21 
 
 
257 aa  163  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.381456  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0710  Allophanate hydrolase subunit 1  37.45 
 
 
246 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00179377  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2040  hypothetical protein  40.77 
 
 
243 aa  161  9e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.733064  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1709  Allophanate hydrolase subunit 1  48.28 
 
 
241 aa  161  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896853  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1814  Allophanate hydrolase subunit 1  46.3 
 
 
241 aa  160  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.21016  normal  0.134293 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1534  allophanate hydrolase subunit 1  45.83 
 
 
241 aa  159  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.107979 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1978  Allophanate hydrolase subunit 1  40.81 
 
 
235 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.438933  normal  0.04719 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1501  hypothetical protein  40.69 
 
 
244 aa  158  6e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0895527 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4132  putative carboxylase  42.08 
 
 
243 aa  157  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0478  allophanate hydrolase, subunit 1  44.16 
 
 
229 aa  157  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3450  hypothetical protein  39.83 
 
 
245 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02000  conserved hypothetical protein TIGR00370  38.79 
 
 
242 aa  154  2e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.620258 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2803  allophanate hydrolase subunit 1  38.94 
 
 
221 aa  153  2.9999999999999998e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.733507 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3095  allophanate hydrolase subunit 1  40.68 
 
 
244 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.686624  normal  0.352303 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1506  hypothetical protein  44.75 
 
 
243 aa  149  3e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.227592  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2047  allophanate hydrolase subunit 1  39.5 
 
 
244 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.684193  normal  0.286348 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1595  allophanate hydrolase subunit 1  31.58 
 
 
243 aa  145  5e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1270  Allophanate hydrolase subunit 1  34.7 
 
 
221 aa  144  1e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0178  Allophanate hydrolase subunit 1  36.09 
 
 
242 aa  142  5e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1145  Allophanate hydrolase subunit 1  32.46 
 
 
229 aa  141  7e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.110827  normal  0.406689 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0988  allophanate hydrolase subunit 1  33.03 
 
 
238 aa  137  1e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0659374  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2148  hypothetical protein TIGR00370  33.19 
 
 
237 aa  137  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2874  allophanate hydrolase subunit 1  33.62 
 
 
237 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.480079  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1950  Allophanate hydrolase subunit 1  35.85 
 
 
233 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000391255  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3395  allophanate hydrolase subunit 1  38.36 
 
 
240 aa  136  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0629739 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3088  conserved hypothetical protein TIGR00370  33.19 
 
 
237 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1957  Allophanate hydrolase subunit 1  38.79 
 
 
218 aa  135  8e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.360214  hitchhiker  0.00204684 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3121  hypothetical protein  33.62 
 
 
237 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785464  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58530  hypothetical protein  38.67 
 
 
225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2062  allophanate hydrolase subunit 1  32.74 
 
 
233 aa  132  6e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.206067  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1828  Allophanate hydrolase subunit 1  35.19 
 
 
227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.700808  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5124  hypothetical protein  37.78 
 
 
225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2849  hypothetical protein  32.62 
 
 
237 aa  129  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2810  hypothetical protein  33.05 
 
 
237 aa  129  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2882  hypothetical protein  32.62 
 
 
237 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0696288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3097  hypothetical protein  32.62 
 
 
237 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.12026  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3102  conserved hypothetical protein TIGR00370  32.62 
 
 
237 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6350  Allophanate hydrolase subunit 1  39.71 
 
 
204 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2825  allophanate hydrolase subunit 1  37.71 
 
 
240 aa  127  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.140549  normal  0.0247911 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3120  conserved hypothetical protein TIGR00370  32.62 
 
 
237 aa  125  6e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000284554  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3056  allophanate hydrolase subunit 1  38.6 
 
 
218 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0256997 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3548  allophanate hydrolase subunit 1  31.7 
 
 
234 aa  124  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2423  hypothetical protein  38.16 
 
 
218 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3037  hypothetical protein  38.16 
 
 
218 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.998817  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4367  Allophanate hydrolase subunit 1  38.97 
 
 
215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5727  allophanate hydrolase subunit 2  37.67 
 
 
531 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506367  normal  0.818149 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12460  allophanate hydrolase subunit 1  38.53 
 
 
224 aa  120  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.460318  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0899  Allophanate hydrolase subunit 1  41.28 
 
 
221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.605422  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2073  Allophanate hydrolase subunit 2  38.92 
 
 
499 aa  119  3.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.721268 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6384  hypothetical protein  38.16 
 
 
218 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1713  hypothetical protein  29.79 
 
 
246 aa  117  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.115565  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1737  allophanate hydrolase subunit 1  29.17 
 
 
226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.215551 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2948  allophanate hydrolase subunit 1  37.44 
 
 
218 aa  115  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1437  putative allophanate hydrolase subunit 1  31.58 
 
 
239 aa  115  6e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3082  hypothetical protein  37.44 
 
 
218 aa  115  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1406  allophanate hydrolase subunit 1  35.81 
 
 
234 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1900  hypothetical protein  28.94 
 
 
246 aa  114  8.999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1030  allophanate hydrolase subunit 1  33.48 
 
 
243 aa  115  8.999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1527  hypothetical protein  29.36 
 
 
246 aa  115  8.999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5847  hypothetical protein  39.18 
 
 
541 aa  114  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0879773  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1498  allophanate hydrolase subunit 1  32.41 
 
 
227 aa  113  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.403347  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0372  allophanate hydrolase subunit 1  34.04 
 
 
249 aa  112  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.701967  normal  0.529517 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3032  allophanate hydrolase subunit 1  36.4 
 
 
218 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0230  hypothetical protein  37.09 
 
 
259 aa  109  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3741  Allophanate hydrolase subunit 1  37.5 
 
 
217 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0499  Urea amidolyase-related protein  34.76 
 
 
534 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0087  hypothetical protein  38.42 
 
 
216 aa  108  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595386  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2450  allophanate hydrolase subunit 2  38.35 
 
 
553 aa  108  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.76901  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2224  allophanate hydrolase subunit 1  34.62 
 
 
231 aa  108  8.000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1984  hypothetical protein  30.09 
 
 
249 aa  108  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0869  hypothetical protein  36.22 
 
 
549 aa  108  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3311  hypothetical protein  36.62 
 
 
218 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0449  hypothetical protein  36.62 
 
 
256 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3367  putative allophanate hydrolase, subunit 1  36.62 
 
 
218 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2981  hypothetical protein  36.62 
 
 
218 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78206  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2111  hypothetical protein  36.62 
 
 
218 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0266  putative allophanate hydrolase, subunit 1  36.62 
 
 
256 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251765  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0062  hypothetical protein  38.42 
 
 
216 aa  106  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1700  hypothetical protein  27.06 
 
 
244 aa  105  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1666  hypothetical protein  27.06 
 
 
244 aa  105  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.947071  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3293  urea amidolyase related protein  35.55 
 
 
536 aa  105  7e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5380  allophanate hydrolase, putative  36.17 
 
 
539 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06200  conserved hypothetical protein TIGR00370  35.68 
 
 
203 aa  104  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.288812  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2903  allophanate hydrolase subunit 1  36.62 
 
 
217 aa  104  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.282421 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0593  allophanate hydrolase subunit 1  39.89 
 
 
234 aa  104  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0362915  normal  0.623241 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0254  putative allophanate hydrolase, subunit 1  36.15 
 
 
256 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3511  allophanate hydrolase subunit 2  35.78 
 
 
539 aa  103  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.80956  normal  0.701023 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>