299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5203 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5203    100 
 
 		 1764 bp  3497    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  80.2 
 
 		 1779 bp  325  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4351  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  82.71 
 
 		 1788 bp  276  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5874  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  84.32 
 
 		 1794 bp  137  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2284  normal  0.116793 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4188  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  83.25 
 
 		 1788 bp  133  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3935  amino acid ABC transporter permease  83.78 
 
 		 1794 bp  129  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140716  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4431  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  83.78 
 
 		 1794 bp  129  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.813853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  82.03 
 
 		 1785 bp  121  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0377  ABC transporter-like  86.61 
 
 		 735 bp  117  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250088 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3863  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  82.23 
 
 		 1785 bp  113  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.132833  normal  0.716613 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1830  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  87.74 
 
 		 765 bp  107  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0522  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  85.6 
 
 		 921 bp  105  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6912  ABC transporter related  91.25 
 
 		 777 bp  103  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1531  amino acid ABC transporter inner membrane protein  81.28 
 
 		 1860 bp  101  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.158795 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30090  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  90.36 
 
 		 759 bp  101  7e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1604  ABC transporter related  87.25 
 
 		 744 bp  99.6  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0693  ABC transporter-related protein  85.25 
 
 		 750 bp  99.6  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.413615  normal  0.685528 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52750  arginine/ornithine transport protein AotP  85.96 
 
 		 765 bp  99.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1448  ABC transporter related  89.41 
 
 		 756 bp  97.6  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3010  amino acid ABC transporter, permease protein  84.8 
 
 		 975 bp  97.6  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.234602  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2503  ABC transporter ATP-binding protein  87.5 
 
 		 1797 bp  95.6  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5022  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  84.38 
 
 		 735 bp  95.6  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.670825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1893  amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  86.11 
 
 		 1911 bp  95.6  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1688  amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  86.11 
 
 		 1911 bp  95.6  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.295284  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0737  amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  86.11 
 
 		 1911 bp  95.6  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0565  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease/periplasmic amino acid-binding protein  86.11 
 
 		 1911 bp  95.6  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2265  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  86.11 
 
 		 1911 bp  95.6  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1685  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease/periplasmic amino acid-binding protein  86.11 
 
 		 1911 bp  95.6  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2402  amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  86.11 
 
 		 1911 bp  95.6  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0471039  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1300  general amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  85.98 
 
 		 765 bp  93.7  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4483  basic amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  85.85 
 
 		 765 bp  91.7  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.777233 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0403  ABC transporter related  85.85 
 
 		 738 bp  91.7  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  84.75 
 
 		 723 bp  91.7  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4634  ABC transporter related  90.54 
 
 		 792 bp  91.7  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3562  ABC transporter related  88.24 
 
 		 774 bp  89.7  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1700  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  81.66 
 
 		 1746 bp  89.7  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2796  ABC transporter related  84.96 
 
 		 801 bp  89.7  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3286  ABC transporter related protein  88.24 
 
 		 843 bp  89.7  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00174942  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3009  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  83.33 
 
 		 786 bp  87.7  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0789225  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0312  ABC transporter-like  85.58 
 
 		 774 bp  87.7  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0907  ABC transporter related  87.5 
 
 		 765 bp  87.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  90.28 
 
 		 759 bp  87.7  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2389  ABC transporter related  83.33 
 
 		 801 bp  87.7  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  87.95 
 
 		 762 bp  85.7  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3012  phosphate ABC transporter ATPase  87.95 
 
 		 810 bp  85.7  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0453567  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4425  ABC transporter related  85.05 
 
 		 765 bp  85.7  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.329357 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2909  ABC transporter related  87.95 
 
 		 741 bp  85.7  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.530548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2552  ABC transporter related  87.95 
 
 		 738 bp  85.7  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221216  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0791  ABC transporter related protein  87.95 
 
 		 756 bp  85.7  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.142657  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1791  ABC transporter related protein  86.32 
 
 		 771 bp  85.7  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22740  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  87.95 
 
 		 795 bp  85.7  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.547683  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1556  ABC transporter related  87.8 
 
 		 792 bp  83.8  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4896  ABC transporter related  83.61 
 
 		 735 bp  83.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0657003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2088  ABC transporter related  96 
 
 		 1149 bp  83.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.619396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4622  arginine/ornithine transport protein AotP  85.29 
 
 		 765 bp  83.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0242  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  83.9 
 
 		 750 bp  83.8  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0762427  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0405  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  81.48 
 
 		 936 bp  83.8  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2411  ABC transporter related  83.9 
 
 		 780 bp  83.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00777429 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2925  ABC lysine/arginine/ornithine transporter, ATPase subunit  83.9 
 
 		 828 bp  83.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.628075  normal  0.276271 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3393  ABC basic amino acid transporter, ATPase subunit  83.9 
 
 		 780 bp  83.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0299  ABC transporter-related protein  83.61 
 
 		 759 bp  83.8  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1795  ABC transporter related  83.9 
 
 		 780 bp  83.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  87.21 
 
 		 777 bp  83.8  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3772  ABC transporter related  87.8 
 
 		 765 bp  83.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.446959  hitchhiker  0.00629002 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  83.61 
 
 		 759 bp  83.8  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2407  ABC transporter related  83.9 
 
 		 780 bp  83.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0859619  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3799  ABC transporter related  85.57 
 
 		 771 bp  81.8  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1216  ABC transporter related  83.2 
 
 		 738 bp  81.8  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2558  ABC transporter related  87.06 
 
 		 783 bp  81.8  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411241  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0356  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  87.06 
 
 		 744 bp  81.8  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  87.06 
 
 		 804 bp  81.8  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3567  ABC transporter  87.06 
 
 		 765 bp  81.8  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.95717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0020  amino acid ABC transporter ATPase  83.2 
 
 		 771 bp  81.8  0.0000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.732673  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0227  ABC transporter related  89.04 
 
 		 747 bp  81.8  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1387  ATPase  84.07 
 
 		 732 bp  81.8  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  88.31 
 
 		 729 bp  81.8  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0015  ABC transporter related  89.04 
 
 		 738 bp  81.8  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3987  ABC transporter related  87.65 
 
 		 768 bp  81.8  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0621823 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5466  ABC transporter related  86.52 
 
 		 768 bp  81.8  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.501476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46950  putative ATP-binding component of ABC transporter  83.2 
 
 		 735 bp  81.8  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.832772  hitchhiker  0.00625095 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1748  ABC transporter related  85.57 
 
 		 816 bp  81.8  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.259218  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3908  ABC transporter related  85.57 
 
 		 825 bp  81.8  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.735904  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3988  ABC transporter related  90.77 
 
 		 765 bp  81.8  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.929091 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2913  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  95.83 
 
 		 738 bp  79.8  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478942  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5182  cystine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  83.62 
 
 		 744 bp  79.8  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2221  putative amino acid ABC transporter  87.5 
 
 		 780 bp  79.8  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1551  ABC transporter related protein  87.5 
 
 		 795 bp  79.8  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.019793 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1488  ABC transporter related  87.5 
 
 		 798 bp  79.8  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.32333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0894  ABC transporter related  97.73 
 
 		 675 bp  79.8  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.552759  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  83.62 
 
 		 750 bp  79.8  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1231  ABC transporter related  85.87 
 
 		 759 bp  79.8  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.903047  normal  0.0835348 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4046  ABC transporter ATP-binding protein  84.62 
 
 		 735 bp  79.8  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6377  ABC transporter related  91.67 
 
 		 738 bp  79.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6610  ABC transporter related  91.67 
 
 		 738 bp  79.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0715405 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2098  ABC transporter ATP-binding protein  81.94 
 
 		 765 bp  79.8  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0685  ABC transporter related  83.19 
 
 		 768 bp  77.8  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5462  ABC transporter-like  88 
 
 		 738 bp  77.8  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0934  polar amino acid ABC transporter ATPase  84.11 
 
 		 831 bp  77.8  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  85.26 
 
 		 744 bp  77.8  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  85.26 
 
 		 777 bp  77.8  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>