289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_B0220 on replicon NC_007410
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007410  Ava_B0220  zinc ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 125 aa  235  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1913  ABC-3 protein  79.84 
 
 		 280 aa  189  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11121  hypothetical protein  55.26 
 
 		 284 aa  108  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.314432 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4436  hypothetical protein  53.7 
 
 		 294 aa  107  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.44647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4953  hypothetical protein  47.71 
 
 		 272 aa  100  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4571  ABC-3 protein  49 
 
 		 289 aa  94  5e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5265  zinc ABC transporter, permease protein  35.09 
 
 		 262 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3180  ABC-3 protein  40 
 
 		 272 aa  73.2  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.114587 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0062  hypothetical protein  36.84 
 
 		 262 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1197  ABC-3 protein  38.6 
 
 		 273 aa  72.4  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.620873  normal  0.0904555 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72590  permease of ABC zinc transporter ZnuB  35.96 
 
 		 262 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5111  ABC-3 protein  35.09 
 
 		 260 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.156764 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6302  permease of ABC zinc transporter ZnuB  35.09 
 
 		 262 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0134  ABC-3 protein  34.21 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00860  zinc ABC transporter, permease protein  35.09 
 
 		 262 aa  69.3  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.952452  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0132  ABC-3 protein  34.21 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493035  normal  0.654734 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3777  ABC-3 protein  36.11 
 
 		 270 aa  68.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0117  hypothetical protein  38.53 
 
 		 260 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.772352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3229  ABC-3 protein  41.67 
 
 		 289 aa  68.2  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3593  ABC-3 protein  38.39 
 
 		 295 aa  67.8  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.234025 
 
 
-
 
NC_002978  WD0362  cation ABC transporter, permease protein, putative  30.3 
 
 		 266 aa  67.4  0.00000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0278  hypothetical protein  33.33 
 
 		 262 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2716  ABC-3 protein  37.61 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.585165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0493  hypothetical protein  35.14 
 
 		 272 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1710  ABC-3 protein  35 
 
 		 273 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.793327  normal  0.78687 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0315  hypothetical protein  38 
 
 		 265 aa  65.5  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0850  high-affinity zinc uptake system membrane protein ZnuB  33.01 
 
 		 261 aa  64.7  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.714968  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0517  putative cation ABC transporter, permease protein  30.43 
 
 		 267 aa  64.7  0.0000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.879269  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2382  ABC-3 protein  37.07 
 
 		 271 aa  64.3  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.502952  normal  0.42152 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4137  ABC-3 protein  35.83 
 
 		 260 aa  63.9  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.198915 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0987  ABC-3 protein  31.48 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4498  ABC-3 protein  36.36 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0454  ABC-3 protein  29.13 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2253  high-affinity zinc transporter membrane component  30.91 
 
 		 261 aa  62  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.246644  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  32.43 
 
 		 272 aa  62.4  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2144  high-affinity zinc transporter membrane component  30.91 
 
 		 261 aa  61.2  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0252479  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  31.82 
 
 		 274 aa  61.2  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2844  ABC-3 protein  31.67 
 
 		 281 aa  61.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  31.67 
 
 		 279 aa  61.6  0.000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2137  ABC-3 protein  36.94 
 
 		 277 aa  61.2  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00135344  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4182  ABC-3 protein  34.23 
 
 		 285 aa  60.5  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000173146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  36.73 
 
 		 285 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1701  putative high-affinity zinc uptake system membrane protein  42 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000503505  normal  0.0364016 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3567  ABC zinc tranporter, inner membrane subunit ZnuB  37.63 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3154  hypothetical protein  37.14 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.87263 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3250  ABC-3 protein  37.63 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.161789 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000834  putative permease of ABC transporter  35.14 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.121337  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1949  hypothetical protein  38.78 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.386969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  33.93 
 
 		 281 aa  58.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1590  ABC-3 protein  53.23 
 
 		 268 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2052  high-affinity zinc transporter membrane component  29.09 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00746645  normal  0.157438 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2775  high-affinity zinc transporter membrane component  32.46 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000664264  hitchhiker  0.0068137 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0294  ABC-3 protein  35.71 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1355  high-affinity zinc transporter membrane component  29.09 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  hitchhiker  0.00410518 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2107  high-affinity zinc transporter membrane component  29.09 
 
 		 261 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0995017  normal  0.378427 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1231  high-affinity zinc transporter membrane component  29.09 
 
 		 261 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0480731  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2047  high-affinity zinc transporter membrane component  29.09 
 
 		 261 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.397318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2428  high-affinity zinc transporter membrane component  29.09 
 
 		 261 aa  58.2  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000440867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1835  ABC-3 protein  35.65 
 
 		 277 aa  58.2  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.906803  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  33.98 
 
 		 288 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  33.98 
 
 		 288 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  33.98 
 
 		 288 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  33.98 
 
 		 288 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06743  hypothetical protein  35.14 
 
 		 291 aa  57.8  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2139  cation ABC transporter, permease protein  38.78 
 
 		 299 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4178  ABC-3 protein  37.72 
 
 		 273 aa  57.4  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.162455  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3598  ABC-3 protein  29.09 
 
 		 274 aa  57.4  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1669  zinc ABC transporter, permease protein  33 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2109  high-affinity zinc transporter membrane component  29.82 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.14561  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1029  zinc ABC transporter, permease protein  36.54 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1727  ABC-3 protein  39.62 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  30 
 
 		 277 aa  55.8  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1124  zinc ABC transporter, permease protein  36.54 
 
 		 286 aa  55.8  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.750494  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2035  ABC zinc transporter, inner membrane subunit ZnuB  30.97 
 
 		 277 aa  55.5  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.061679 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0125  ABC-3 transporter protein, membrane component  33.05 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.291057  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18330  ABC-3 protein  33.05 
 
 		 277 aa  55.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2187  ABC transporter membrane spanning protein (zinc)  36.28 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.381514  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0514  ABC transporter  28.07 
 
 		 267 aa  55.1  0.0000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0274636  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3929  hypothetical protein  38.78 
 
 		 299 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.632836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2595  high-affinity zinc transporter membrane component  28.18 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3613  hypothetical protein  39.29 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00635836 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0858  ABC-3 protein  33.65 
 
 		 267 aa  55.1  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0139094  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2850  ABC transporter permease  38.78 
 
 		 301 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.878186  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33540  putative permease of ABC transporter  38.78 
 
 		 301 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00783017  normal  0.0257803 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1825  high-affinity zinc transporter membrane component  30 
 
 		 261 aa  55.1  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.206601  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  34.65 
 
 		 280 aa  54.7  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0575  hypothetical protein  37.5 
 
 		 268 aa  54.7  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0853  ABC-3 protein  36.28 
 
 		 352 aa  54.7  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0955  high-affinity zinc transporter membrane component  28.18 
 
 		 261 aa  54.3  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0177046  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1327  high-affinity zinc transporter membrane component  28.18 
 
 		 261 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0274583  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01830  high-affinity zinc transporter membrane component  28.18 
 
 		 261 aa  53.9  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0395688  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2089  high-affinity zinc transporter membrane component  28.18 
 
 		 261 aa  53.9  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000234028  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01818  hypothetical protein  28.18 
 
 		 261 aa  53.9  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0233663  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1773  high-affinity zinc transporter membrane component  28.18 
 
 		 261 aa  53.9  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000387167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2338  hypothetical protein  30.97 
 
 		 277 aa  54.3  0.0000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1781  ABC-3 protein  28.18 
 
 		 261 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000666084  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1952  high-affinity zinc transporter membrane component  28.18 
 
 		 261 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0398109  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1695  ABC-3 protein  35.96 
 
 		 275 aa  53.9  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004108  zinc ABC transporter permease protein ZnuB  26.21 
 
 		 261 aa  53.9  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  36.78 
 
 		 300 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>