88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1804 on replicon NC_013164
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013164  Apre_1804  prophage antirepressor  100 
 
 
244 aa  494  1e-139  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2475  prophage antirepressor  45.28 
 
 
261 aa  180  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000554878  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1235  prophage antirepressor  37.13 
 
 
263 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298657  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1649  BRO-like protein  34.78 
 
 
265 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000543299  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0803  prophage antirepressor  36.07 
 
 
257 aa  112  4.0000000000000004e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000145423  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2462  BRO-like protein  33.33 
 
 
248 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000468179  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0524  prophage antirepressor  32.82 
 
 
259 aa  111  9e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.844398  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1142  phage antirepressor protein  35.96 
 
 
267 aa  108  5e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000418777  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0554  prophage antirepressor  33.8 
 
 
269 aa  108  1e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.239939  hitchhiker  0.000124341 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1644  BRO domain-containing protein  35.33 
 
 
239 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0834656  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2513  BRO, N-terminal  44.68 
 
 
172 aa  103  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0512852  normal  0.446294 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5813  prophage antirepressor  29.8 
 
 
256 aa  102  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0898  prophage antirepressor  43.75 
 
 
217 aa  100  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.798648  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2135  phage-encoded protein  33.33 
 
 
260 aa  100  3e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000332219  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0789  BRO, N-terminal  48.62 
 
 
172 aa  98.6  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000825833 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1874  prophage antirepressor  33.06 
 
 
299 aa  98.6  9e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000268327  normal  0.0527213 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1161  hypothetical protein  34.27 
 
 
193 aa  96.3  4e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00000000330342  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1367  prophage antirepressor  35.32 
 
 
264 aa  96.3  4e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000214644  unclonable  1.53039e-25 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1740  BRO-like protein  34.69 
 
 
254 aa  95.9  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000880579  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1877  prophage LambdaSa2, antirepressor protein, putative  54.35 
 
 
236 aa  95.5  7e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0256664  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1060  prophage antirepressor  44.44 
 
 
262 aa  94.7  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000214143  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3254  prophage antirepressor  46.79 
 
 
270 aa  91.3  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000711854  decreased coverage  0.00000000000000707487 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3521  BRO, N-terminal  39.01 
 
 
199 aa  89.4  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000239324  decreased coverage  0.000343043 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1177  hypothetical protein  47.06 
 
 
420 aa  88.2  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.163274  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1555  antirepressor protein  42.15 
 
 
292 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0345805  hitchhiker  0.000277946 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2642  hypothetical protein  43.86 
 
 
252 aa  86.3  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.226633  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3073  prophage antirepressor  31.72 
 
 
270 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.229766  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3227  prophage antirepressor  48.39 
 
 
252 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.323772  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1205  prophage antirepressor  41.28 
 
 
535 aa  84  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.312147  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1118  BRO domain-containing protein  36.08 
 
 
247 aa  84.3  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.296909  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1825  prophage antirepressor  41.28 
 
 
535 aa  84  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2795  prophage antirepressor-like  35.67 
 
 
197 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3440  prophage antirepressor  47.66 
 
 
285 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000105678  unclonable  9.66468e-17 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2402  prophage antirepressor  31.9 
 
 
230 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0575  prophage antirepressor  39.13 
 
 
295 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1322  prophage antirepressor  41.23 
 
 
236 aa  80.5  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000035001  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1741  prophage antirepressor-like  33.99 
 
 
184 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.729676  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1181  prophage antirepressor  40.31 
 
 
188 aa  79.7  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000354678  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2133  phage antirepressor protein  41.18 
 
 
244 aa  79.3  0.00000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.335904 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1000  BRO family protein  40.43 
 
 
211 aa  77  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.173667  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1864  prophage antirepressor  32.88 
 
 
293 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.886046 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1714  BRO family protein, truncation  45.57 
 
 
101 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.109606  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3740  prophage antirepressor  39.09 
 
 
283 aa  70.1  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3791  prophage antirepressor  39.09 
 
 
283 aa  70.1  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1073  BRO family protein  36.44 
 
 
313 aa  69.7  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00174599  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2185  putative antirepressor protein encoded by prophage CP-933N  40.4 
 
 
192 aa  69.3  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0690247  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3917  prophage antirepressor  39.81 
 
 
245 aa  69.3  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0381452  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1315  prophage antirepressor  36.59 
 
 
256 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.930298  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3400  prophage antirepressor  35.4 
 
 
284 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000183753  unclonable  1.97476e-16 
 
 
-
 
NC_013208  Aaci_3150  prophage antirepressor  31.25 
 
 
206 aa  67.4  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4013  BRO domain-containing protein  30.58 
 
 
284 aa  67  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1083  BRO family protein  35.34 
 
 
134 aa  65.9  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100944  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0797  BRO, N-terminal  40 
 
 
111 aa  65.5  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.651064  hitchhiker  0.00000114436 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a013  putative antirepressor, BRO family  33.93 
 
 
183 aa  65.5  0.0000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1867  prophage antirepressor  38.64 
 
 
272 aa  63.9  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000186522  normal  0.142835 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1165  prophage antirepressor  36.67 
 
 
149 aa  63.9  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0258  BRO family protein  32 
 
 
140 aa  63.9  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0278  BRO family protein  32 
 
 
140 aa  63.9  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000343854  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2504  BRO family protein  50 
 
 
58 aa  60.1  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.880081 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0225  prophage antirepressor  37.23 
 
 
180 aa  60.1  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.285205  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2342  Prophage antirepressor protein  31.2 
 
 
263 aa  58.2  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1398  prophage antirepressor  34.86 
 
 
204 aa  57  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.178309  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1616  hypothetical protein  36.19 
 
 
151 aa  56.2  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0345712  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3546  BRO-like  26.74 
 
 
191 aa  56.2  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.301745  normal  0.324893 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3552  BRO-like  26.74 
 
 
191 aa  56.2  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.815124  normal  0.1258 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3107  prophage antirepressor  33.67 
 
 
153 aa  55.8  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0568  prophage antirepressor  33.67 
 
 
153 aa  55.8  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.762577  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2380  BRO domain-containing protein  27.37 
 
 
335 aa  55.8  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.016925  normal  0.26363 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3698  prophage antirepressor  38.89 
 
 
120 aa  55.5  0.0000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.206352 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2805  prophage antirepressor-like  36.36 
 
 
105 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0292574  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0139  BRO domain-containing protein  32.46 
 
 
191 aa  54.3  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.598761  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1080  prophage antirepressor-like protein  33.63 
 
 
206 aa  53.9  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174443  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1196  prophage antirepressor  29.95 
 
 
228 aa  53.9  0.000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1645  prophage antirepressor  36.36 
 
 
294 aa  52.4  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0902  prophage antirepressor  27.37 
 
 
226 aa  50.1  0.00003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3087  prophage antirepressor  29.29 
 
 
317 aa  48.1  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0855  prophage antirepressor  26.38 
 
 
255 aa  48.1  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0871  BRO domain-containing protein  26.38 
 
 
255 aa  48.1  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1061  prophage antirepressor-like protein  28.83 
 
 
210 aa  46.6  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000179859  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0930  BRO domain-containing protein  29.03 
 
 
243 aa  47  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0480253  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1040  hypothetical protein  23.86 
 
 
170 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2408  phage-encoded protein-like  28.83 
 
 
254 aa  45.4  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.665477  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2852  AntA/AntB antirepressor domain protein  25.62 
 
 
250 aa  44.3  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000203262  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0382  phage antirepressor protein, putative  25.62 
 
 
250 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000707014  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2622  BRO domain-containing protein  30.19 
 
 
205 aa  43.5  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000919421  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1415  prophage antirepressor  28.32 
 
 
221 aa  42.7  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000182946  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3359  phage-encoded protein-like  27.55 
 
 
259 aa  42.7  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4934  hypothetical protein  31.58 
 
 
422 aa  42.7  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>