52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3917 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_3917  prophage antirepressor  100 
 
 		 245 aa  504  9.999999999999999e-143  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0381452  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1322  prophage antirepressor  34.3 
 
 		 236 aa  141  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000035001  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1649  BRO-like protein  50.44 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000543299  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1740  BRO-like protein  46.02 
 
 		 254 aa  93.2  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000880579  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1060  prophage antirepressor  45.26 
 
 		 262 aa  90.1  3e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000214143  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1825  prophage antirepressor  41.24 
 
 		 535 aa  83.2  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1205  prophage antirepressor  41.24 
 
 		 535 aa  83.2  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.312147  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3440  prophage antirepressor  41.67 
 
 		 285 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000105678  unclonable  9.66468e-17 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1118  BRO domain-containing protein  41.24 
 
 		 247 aa  72.8  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.296909  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1804  prophage antirepressor  39.81 
 
 		 244 aa  69.3  0.00000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3227  prophage antirepressor  30.69 
 
 		 252 aa  64.7  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.323772  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1177  hypothetical protein  33.33 
 
 		 420 aa  63.5  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.163274  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1161  hypothetical protein  37.5 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00000000330342  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0803  prophage antirepressor  37.5 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000145423  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1877  prophage LambdaSa2, antirepressor protein, putative  28.69 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0256664  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1181  prophage antirepressor  33.33 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000354678  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1315  prophage antirepressor  28.46 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.930298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1398  prophage antirepressor  35.16 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.178309  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1073  BRO family protein  24.86 
 
 		 313 aa  55.5  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00174599  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5813  prophage antirepressor  30.77 
 
 		 256 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0524  prophage antirepressor  26.47 
 
 		 259 aa  53.9  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.844398  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2475  prophage antirepressor  30.95 
 
 		 261 aa  52.8  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000554878  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1741  prophage antirepressor-like  31.43 
 
 		 184 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.729676  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1083  BRO family protein  27.96 
 
 		 134 aa  50.4  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100944  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1874  prophage antirepressor  34.02 
 
 		 299 aa  50.4  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000268327  normal  0.0527213 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1142  phage antirepressor protein  32.58 
 
 		 267 aa  49.7  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000418777  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2795  prophage antirepressor-like  32.08 
 
 		 197 aa  49.7  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1867  prophage antirepressor  30.77 
 
 		 272 aa  49.7  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000186522  normal  0.142835 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2642  hypothetical protein  32.38 
 
 		 252 aa  48.9  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.226633  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0898  prophage antirepressor  29.9 
 
 		 217 aa  48.9  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.798648  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1644  BRO domain-containing protein  29.67 
 
 		 239 aa  48.5  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0834656  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3791  prophage antirepressor  28.57 
 
 		 283 aa  47.8  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0225  prophage antirepressor  28.7 
 
 		 180 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.285205  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4013  BRO domain-containing protein  29.52 
 
 		 284 aa  48.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3740  prophage antirepressor  28.57 
 
 		 283 aa  47.8  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2462  BRO-like protein  31 
 
 		 248 aa  47.4  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000468179  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3254  prophage antirepressor  27.78 
 
 		 270 aa  47.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000711854  decreased coverage  0.00000000000000707487 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0554  prophage antirepressor  25.69 
 
 		 269 aa  47  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.239939  hitchhiker  0.000124341 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2513  BRO, N-terminal  27.05 
 
 		 172 aa  46.6  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0512852  normal  0.446294 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0575  prophage antirepressor  27.78 
 
 		 295 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2135  phage-encoded protein  27.36 
 
 		 260 aa  45.8  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000332219  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0789  BRO, N-terminal  27.05 
 
 		 172 aa  45.4  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000825833 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1367  prophage antirepressor  27.78 
 
 		 264 aa  45.8  0.0007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000214644  unclonable  1.53039e-25 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2133  phage antirepressor protein  39.22 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.335904 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1555  antirepressor protein  24.18 
 
 		 292 aa  44.3  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0345805  hitchhiker  0.000277946 
 
 
-
 
NC_013208  Aaci_3150  prophage antirepressor  22.78 
 
 		 206 aa  44.3  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0930  BRO domain-containing protein  27.46 
 
 		 243 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0480253  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0324  hypothetical protein  25.2 
 
 		 197 aa  44.3  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.292014  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2185  putative antirepressor protein encoded by prophage CP-933N  34 
 
 		 192 aa  43.5  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0690247  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2402  prophage antirepressor  38 
 
 		 230 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1165  prophage antirepressor  26.96 
 
 		 149 aa  42.4  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a013  putative antirepressor, BRO family  25.21 
 
 		 183 aa  42  0.008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>