59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3698 on replicon NC_010580
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010580  Bind_3698  prophage antirepressor  100 
 
 		 120 aa  249  1e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.206352 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1714  BRO family protein, truncation  44.74 
 
 		 101 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.109606  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2185  putative antirepressor protein encoded by prophage CP-933N  45.21 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0690247  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0575  prophage antirepressor  40.26 
 
 		 295 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2513  BRO, N-terminal  49.3 
 
 		 172 aa  65.1  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0512852  normal  0.446294 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1555  antirepressor protein  42.67 
 
 		 292 aa  64.7  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0345805  hitchhiker  0.000277946 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1235  prophage antirepressor  34.94 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298657  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1644  BRO domain-containing protein  40.96 
 
 		 239 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0834656  n/a   
 
 
-
 
NC_013208  Aaci_3150  prophage antirepressor  35.05 
 
 		 206 aa  61.2  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2462  BRO-like protein  36.05 
 
 		 248 aa  60.8  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000468179  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0789  BRO, N-terminal  40.85 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000825833 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3521  BRO, N-terminal  38.16 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000239324  decreased coverage  0.000343043 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2135  phage-encoded protein  33.67 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000332219  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1367  prophage antirepressor  38.27 
 
 		 264 aa  58.2  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000214644  unclonable  1.53039e-25 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3073  prophage antirepressor  37.63 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.229766  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3254  prophage antirepressor  36.9 
 
 		 270 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000711854  decreased coverage  0.00000000000000707487 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3740  prophage antirepressor  38.89 
 
 		 283 aa  57.4  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3791  prophage antirepressor  38.89 
 
 		 283 aa  57.4  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2642  hypothetical protein  36.9 
 
 		 252 aa  57  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.226633  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4013  BRO domain-containing protein  36.36 
 
 		 284 aa  57  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1000  BRO family protein  37.35 
 
 		 211 aa  57  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.173667  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0898  prophage antirepressor  40 
 
 		 217 aa  57  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.798648  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1804  prophage antirepressor  38.89 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2133  phage antirepressor protein  37.65 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.335904 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0524  prophage antirepressor  35.23 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.844398  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1165  prophage antirepressor  31.03 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1181  prophage antirepressor  29.27 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000354678  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2380  BRO domain-containing protein  29.47 
 
 		 335 aa  54.3  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.016925  normal  0.26363 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1161  hypothetical protein  32.53 
 
 		 193 aa  54.3  0.0000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00000000330342  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5813  prophage antirepressor  36.36 
 
 		 256 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1118  BRO domain-containing protein  33.72 
 
 		 247 aa  53.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.296909  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3400  prophage antirepressor  34.67 
 
 		 284 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000183753  unclonable  1.97476e-16 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1867  prophage antirepressor  39.73 
 
 		 272 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000186522  normal  0.142835 
 
 
-
 
NC_004310  BR1083  BRO family protein  32.61 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100944  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1177  hypothetical protein  38.37 
 
 		 420 aa  52  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.163274  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0803  prophage antirepressor  32.95 
 
 		 257 aa  51.6  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000145423  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1874  prophage antirepressor  32.61 
 
 		 299 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000268327  normal  0.0527213 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1073  BRO family protein  37.04 
 
 		 313 aa  50.4  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00174599  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0554  prophage antirepressor  36.99 
 
 		 269 aa  49.7  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.239939  hitchhiker  0.000124341 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1877  prophage LambdaSa2, antirepressor protein, putative  30.21 
 
 		 236 aa  48.5  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0256664  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1645  prophage antirepressor  31.87 
 
 		 294 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3087  prophage antirepressor  34.78 
 
 		 317 aa  47.8  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3227  prophage antirepressor  33.72 
 
 		 252 aa  47.4  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.323772  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2402  prophage antirepressor  31.33 
 
 		 230 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0797  BRO, N-terminal  35.9 
 
 		 111 aa  46.2  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.651064  hitchhiker  0.00000114436 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4120  prophage antirepressor  42.25 
 
 		 192 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0152271  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0278  BRO family protein  34.69 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000343854  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0258  BRO family protein  34.69 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33290  hypothetical protein  28.24 
 
 		 251 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00174462  normal  0.221973 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2622  BRO domain-containing protein  35.38 
 
 		 205 aa  43.9  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000919421  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1398  prophage antirepressor  33.33 
 
 		 204 aa  43.1  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.178309  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1142  phage antirepressor protein  30.68 
 
 		 267 aa  43.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000418777  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1825  prophage antirepressor  33.72 
 
 		 535 aa  42.7  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1205  prophage antirepressor  33.72 
 
 		 535 aa  42.7  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.312147  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1322  prophage antirepressor  35.82 
 
 		 236 aa  42.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000035001  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2342  Prophage antirepressor protein  26.88 
 
 		 263 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1060  prophage antirepressor  27.71 
 
 		 262 aa  42  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000214143  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3402  prophage antirepressor  32.63 
 
 		 273 aa  40.8  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000265248  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3440  prophage antirepressor  27.27 
 
 		 285 aa  40  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000105678  unclonable  9.66468e-17 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>