42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1196 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_1196  prophage antirepressor  100 
 
 		 228 aa  447  1e-125  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0902  prophage antirepressor  74.55 
 
 		 226 aa  340  1e-92  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1825  prophage antirepressor  35.63 
 
 		 535 aa  60.5  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1205  prophage antirepressor  35.63 
 
 		 535 aa  60.5  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.312147  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0524  prophage antirepressor  30.37 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.844398  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5813  prophage antirepressor  31.19 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2642  hypothetical protein  36.47 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.226633  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3227  prophage antirepressor  38.2 
 
 		 252 aa  55.1  0.0000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.323772  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1367  prophage antirepressor  38.64 
 
 		 264 aa  55.1  0.0000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000214644  unclonable  1.53039e-25 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1235  prophage antirepressor  24.34 
 
 		 263 aa  55.1  0.0000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298657  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3254  prophage antirepressor  27.78 
 
 		 270 aa  55.1  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000711854  decreased coverage  0.00000000000000707487 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1714  BRO family protein, truncation  36.25 
 
 		 101 aa  53.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.109606  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1804  prophage antirepressor  29.95 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1177  hypothetical protein  33.71 
 
 		 420 aa  54.3  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.163274  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2462  BRO-like protein  27.93 
 
 		 248 aa  53.9  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000468179  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1644  BRO domain-containing protein  23.38 
 
 		 239 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0834656  n/a   
 
 
-
 
NC_013208  Aaci_3150  prophage antirepressor  28.47 
 
 		 206 aa  51.6  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3791  prophage antirepressor  33.98 
 
 		 283 aa  50.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3740  prophage antirepressor  33.98 
 
 		 283 aa  50.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0898  prophage antirepressor  34.44 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.798648  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2475  prophage antirepressor  26.06 
 
 		 261 aa  50.4  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000554878  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0789  BRO, N-terminal  33.96 
 
 		 172 aa  49.3  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000825833 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1322  prophage antirepressor  32.79 
 
 		 236 aa  49.7  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000035001  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1867  prophage antirepressor  31.76 
 
 		 272 aa  49.3  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000186522  normal  0.142835 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1161  hypothetical protein  32.56 
 
 		 193 aa  47.4  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00000000330342  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2402  prophage antirepressor  30.77 
 
 		 230 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1000  BRO family protein  36.36 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.173667  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1874  prophage antirepressor  31.18 
 
 		 299 aa  46.6  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000268327  normal  0.0527213 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0803  prophage antirepressor  28.79 
 
 		 257 aa  47  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000145423  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3521  BRO, N-terminal  31.4 
 
 		 199 aa  46.6  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000239324  decreased coverage  0.000343043 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0554  prophage antirepressor  29.79 
 
 		 269 aa  46.2  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.239939  hitchhiker  0.000124341 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1877  prophage LambdaSa2, antirepressor protein, putative  31.63 
 
 		 236 aa  45.4  0.0007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0256664  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2622  BRO domain-containing protein  27.15 
 
 		 205 aa  45.4  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000919421  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2133  phage antirepressor protein  31.87 
 
 		 244 aa  45.1  0.0009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.335904 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1073  BRO family protein  30.69 
 
 		 313 aa  44.7  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00174599  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2513  BRO, N-terminal  41.27 
 
 		 172 aa  44.7  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0512852  normal  0.446294 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4013  BRO domain-containing protein  21.89 
 
 		 284 aa  44.7  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3400  prophage antirepressor  26.37 
 
 		 284 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000183753  unclonable  1.97476e-16 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0496  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.33 
 
 		 446 aa  43.5  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2795  prophage antirepressor-like  35.48 
 
 		 197 aa  43.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1741  prophage antirepressor-like  37.04 
 
 		 184 aa  42.4  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.729676  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1165  prophage antirepressor  24.72 
 
 		 149 aa  42  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>