92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3254 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3254  prophage antirepressor  100 
 
 		 270 aa  553  1e-156  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000711854  decreased coverage  0.00000000000000707487 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2642  hypothetical protein  41.28 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.226633  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4450  KilA-N domain family  39.89 
 
 		 265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000955205  unclonable  0.00000000145542 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2154  KilA-N domain family  37.56 
 
 		 269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000036696  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2280  KilA-N domain-containing protein  41.24 
 
 		 286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0187873  decreased coverage  1.7596300000000002e-23 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3227  prophage antirepressor  47.83 
 
 		 252 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.323772  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1000  BRO family protein  51.4 
 
 		 211 aa  115  6e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.173667  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0524  prophage antirepressor  44.55 
 
 		 259 aa  113  4.0000000000000004e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.844398  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3521  BRO, N-terminal  56.98 
 
 		 199 aa  112  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000239324  decreased coverage  0.000343043 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1825  prophage antirepressor  44.19 
 
 		 535 aa  108  7.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1205  prophage antirepressor  44.19 
 
 		 535 aa  108  7.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.312147  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1235  prophage antirepressor  48.6 
 
 		 263 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298657  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1177  hypothetical protein  43.18 
 
 		 420 aa  108  1e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.163274  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0898  prophage antirepressor  52.63 
 
 		 217 aa  107  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.798648  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1161  hypothetical protein  46.73 
 
 		 193 aa  105  8e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00000000330342  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1181  prophage antirepressor  43.93 
 
 		 188 aa  105  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000354678  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1555  antirepressor protein  41.54 
 
 		 292 aa  103  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0345805  hitchhiker  0.000277946 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1060  prophage antirepressor  37.59 
 
 		 262 aa  99.8  5e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000214143  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1073  BRO family protein  41.73 
 
 		 313 aa  99  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00174599  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2133  phage antirepressor protein  44 
 
 		 244 aa  97.8  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.335904 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1367  prophage antirepressor  44.12 
 
 		 264 aa  98.2  1e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000214644  unclonable  1.53039e-25 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1644  BRO domain-containing protein  47.71 
 
 		 239 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0834656  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2135  phage-encoded protein  28.42 
 
 		 260 aa  97.1  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000332219  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3400  prophage antirepressor  43.36 
 
 		 284 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000183753  unclonable  1.97476e-16 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0789  BRO, N-terminal  50.56 
 
 		 172 aa  94.7  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000825833 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2402  prophage antirepressor  31.25 
 
 		 230 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2513  BRO, N-terminal  51.06 
 
 		 172 aa  94.4  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0512852  normal  0.446294 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1315  prophage antirepressor  32.24 
 
 		 256 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.930298  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1877  prophage LambdaSa2, antirepressor protein, putative  45.19 
 
 		 236 aa  92.4  6e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0256664  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1804  prophage antirepressor  46.79 
 
 		 244 aa  91.3  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1874  prophage antirepressor  42.61 
 
 		 299 aa  91.7  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000268327  normal  0.0527213 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2462  BRO-like protein  38.6 
 
 		 248 aa  90.1  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000468179  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0575  prophage antirepressor  39.47 
 
 		 295 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2380  BRO domain-containing protein  33.53 
 
 		 335 aa  88.2  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.016925  normal  0.26363 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0803  prophage antirepressor  40.19 
 
 		 257 aa  87  3e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000145423  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3073  prophage antirepressor  36.84 
 
 		 270 aa  86.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.229766  n/a   
 
 
-
 
NC_013208  Aaci_3150  prophage antirepressor  35.71 
 
 		 206 aa  85.5  9e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3740  prophage antirepressor  43.22 
 
 		 283 aa  85.1  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3791  prophage antirepressor  43.22 
 
 		 283 aa  85.1  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1142  phage antirepressor protein  43.4 
 
 		 267 aa  85.1  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000418777  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5813  prophage antirepressor  51.19 
 
 		 256 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2185  putative antirepressor protein encoded by prophage CP-933N  38.98 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0690247  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1867  prophage antirepressor  32.99 
 
 		 272 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000186522  normal  0.142835 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1864  prophage antirepressor  36.44 
 
 		 293 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.886046 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0797  BRO, N-terminal  42.55 
 
 		 111 aa  81.6  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.651064  hitchhiker  0.00000114436 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1398  prophage antirepressor  40.74 
 
 		 204 aa  81.3  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.178309  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4013  BRO domain-containing protein  41.38 
 
 		 284 aa  80.5  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1616  hypothetical protein  40.78 
 
 		 151 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0345712  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0225  prophage antirepressor  37.74 
 
 		 180 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.285205  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1118  BRO domain-containing protein  39.81 
 
 		 247 aa  79  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.296909  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0554  prophage antirepressor  40.4 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.239939  hitchhiker  0.000124341 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1322  prophage antirepressor  40.38 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000035001  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3440  prophage antirepressor  37.04 
 
 		 285 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000105678  unclonable  9.66468e-17 
 
 
-
 
NC_004310  BR1083  BRO family protein  34.26 
 
 		 134 aa  74.7  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100944  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1714  BRO family protein, truncation  50.7 
 
 		 101 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.109606  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1741  prophage antirepressor-like  40.43 
 
 		 184 aa  71.2  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.729676  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2805  prophage antirepressor-like  49.3 
 
 		 105 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0292574  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2795  prophage antirepressor-like  40.43 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1165  prophage antirepressor  40.51 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3107  prophage antirepressor  37.23 
 
 		 153 aa  68.6  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0568  prophage antirepressor  37.23 
 
 		 153 aa  68.6  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.762577  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1740  BRO-like protein  30.39 
 
 		 254 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000880579  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0258  BRO family protein  37.61 
 
 		 140 aa  67.8  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0278  BRO family protein  37.61 
 
 		 140 aa  67.8  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000343854  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2622  BRO domain-containing protein  28.04 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000919421  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2342  Prophage antirepressor protein  30.4 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2478  hypothetical protein  52.17 
 
 		 76 aa  62.4  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.527088  normal  0.0162586 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4120  prophage antirepressor  35.34 
 
 		 192 aa  62  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0152271  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1652  hypothetical protein  26.53 
 
 		 191 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215639  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0902  prophage antirepressor  26.35 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3726  hypothetical protein  26.53 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2475  prophage antirepressor  30.71 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000554878  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3698  prophage antirepressor  36.9 
 
 		 120 aa  58.2  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.206352 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2504  BRO family protein  57.14 
 
 		 58 aa  57.4  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.880081 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3087  prophage antirepressor  34.31 
 
 		 317 aa  55.8  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a013  putative antirepressor, BRO family  26.32 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1196  prophage antirepressor  27.78 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33290  hypothetical protein  26.92 
 
 		 251 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00174462  normal  0.221973 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1649  BRO-like protein  35.2 
 
 		 265 aa  53.5  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000543299  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1040  hypothetical protein  25.88 
 
 		 170 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3546  BRO-like  30.47 
 
 		 191 aa  49.3  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.301745  normal  0.324893 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3552  BRO-like  30.47 
 
 		 191 aa  49.3  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.815124  normal  0.1258 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1061  prophage antirepressor-like protein  27.97 
 
 		 210 aa  48.9  0.00009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000179859  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1080  prophage antirepressor-like protein  31.58 
 
 		 206 aa  48.5  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174443  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0139  BRO domain-containing protein  27.69 
 
 		 191 aa  48.5  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.598761  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3917  prophage antirepressor  27.78 
 
 		 245 aa  47.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0381452  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4296  BRO-like  22.52 
 
 		 176 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.836622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3820  hypothetical protein  25.25 
 
 		 181 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391965 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2833  hypothetical protein  27.27 
 
 		 170 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.977223  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3096  hypothetical protein  28.57 
 
 		 214 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.880364  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1415  prophage antirepressor  29.59 
 
 		 221 aa  43.1  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000182946  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1645  prophage antirepressor  28.87 
 
 		 294 aa  42.4  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>