42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_33290 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_33290  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00174462  normal  0.221973 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2833  hypothetical protein  83.53 
 
 		 170 aa  290  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.977223  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1040  hypothetical protein  36.05 
 
 		 170 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49500  hypothetical protein  36.26 
 
 		 184 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000177569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3820  hypothetical protein  33.93 
 
 		 181 aa  94  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391965 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3726  hypothetical protein  36.81 
 
 		 191 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1652  hypothetical protein  36.81 
 
 		 191 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215639  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3096  hypothetical protein  32.6 
 
 		 214 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.880364  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4296  BRO-like  35.66 
 
 		 176 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.836622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1322  prophage antirepressor  30.77 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000035001  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3791  prophage antirepressor  27 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3740  prophage antirepressor  27 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2462  BRO-like protein  24.75 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000468179  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3521  BRO, N-terminal  32.58 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000239324  decreased coverage  0.000343043 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1877  prophage LambdaSa2, antirepressor protein, putative  28.89 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0256664  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2380  BRO domain-containing protein  33.65 
 
 		 335 aa  57  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.016925  normal  0.26363 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2642  hypothetical protein  32.08 
 
 		 252 aa  57  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.226633  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1235  prophage antirepressor  25.71 
 
 		 263 aa  55.1  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298657  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2135  phage-encoded protein  23.27 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000332219  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3254  prophage antirepressor  26.92 
 
 		 270 aa  53.5  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000711854  decreased coverage  0.00000000000000707487 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4230  hypothetical protein  41.07 
 
 		 64 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1161  hypothetical protein  31.11 
 
 		 193 aa  52.8  0.000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00000000330342  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0803  prophage antirepressor  24.18 
 
 		 257 aa  52  0.000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000145423  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1874  prophage antirepressor  27.35 
 
 		 299 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000268327  normal  0.0527213 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5813  prophage antirepressor  25.84 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1000  BRO family protein  31.46 
 
 		 211 aa  50.4  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.173667  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1644  BRO domain-containing protein  31.25 
 
 		 239 aa  49.7  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0834656  n/a   
 
 
-
 
NC_013208  Aaci_3150  prophage antirepressor  27.27 
 
 		 206 aa  49.7  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1367  prophage antirepressor  25.27 
 
 		 264 aa  49.7  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000214644  unclonable  1.53039e-25 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0575  prophage antirepressor  31.07 
 
 		 295 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2133  phage antirepressor protein  22.12 
 
 		 244 aa  46.2  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.335904 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4227  hypothetical protein  33.64 
 
 		 122 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3400  prophage antirepressor  26.6 
 
 		 284 aa  45.4  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000183753  unclonable  1.97476e-16 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4013  BRO domain-containing protein  24.49 
 
 		 284 aa  45.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1205  prophage antirepressor  25.69 
 
 		 535 aa  44.7  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.312147  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1825  prophage antirepressor  25.69 
 
 		 535 aa  44.7  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1142  phage antirepressor protein  24 
 
 		 267 aa  44.7  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000418777  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3698  prophage antirepressor  28.24 
 
 		 120 aa  43.9  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.206352 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1177  hypothetical protein  24.11 
 
 		 420 aa  43.9  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.163274  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1714  BRO family protein, truncation  22.78 
 
 		 101 aa  43.9  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.109606  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3227  prophage antirepressor  30.68 
 
 		 252 aa  42.7  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.323772  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0797  BRO, N-terminal  25.93 
 
 		 111 aa  42  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.651064  hitchhiker  0.00000114436 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>