35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3096 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3096  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  441  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.880364  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3820  hypothetical protein  84.88 
 
 		 181 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391965 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1040  hypothetical protein  48.32 
 
 		 170 aa  157  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3726  hypothetical protein  52.74 
 
 		 191 aa  153  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1652  hypothetical protein  50 
 
 		 191 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215639  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4296  BRO-like  44.64 
 
 		 176 aa  137  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.836622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2833  hypothetical protein  33.76 
 
 		 170 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.977223  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33290  hypothetical protein  32.6 
 
 		 251 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00174462  normal  0.221973 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49500  hypothetical protein  33.53 
 
 		 184 aa  81.6  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000177569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1644  BRO domain-containing protein  28.83 
 
 		 239 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0834656  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1000  BRO family protein  32.99 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.173667  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1877  prophage LambdaSa2, antirepressor protein, putative  26.17 
 
 		 236 aa  53.5  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0256664  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1235  prophage antirepressor  26.88 
 
 		 263 aa  52.4  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298657  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1161  hypothetical protein  31.52 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00000000330342  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2513  BRO, N-terminal  29.52 
 
 		 172 aa  50.1  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0512852  normal  0.446294 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2642  hypothetical protein  31.4 
 
 		 252 aa  49.7  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.226633  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4227  hypothetical protein  35 
 
 		 122 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3791  prophage antirepressor  28.89 
 
 		 283 aa  49.3  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3740  prophage antirepressor  28.89 
 
 		 283 aa  49.3  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3400  prophage antirepressor  29.13 
 
 		 284 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000183753  unclonable  1.97476e-16 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1874  prophage antirepressor  22.77 
 
 		 299 aa  46.2  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000268327  normal  0.0527213 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3521  BRO, N-terminal  30.95 
 
 		 199 aa  46.2  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000239324  decreased coverage  0.000343043 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0789  BRO, N-terminal  28.72 
 
 		 172 aa  46.2  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000825833 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1367  prophage antirepressor  27.91 
 
 		 264 aa  45.4  0.0007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000214644  unclonable  1.53039e-25 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2135  phage-encoded protein  26.88 
 
 		 260 aa  45.1  0.0008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000332219  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3254  prophage antirepressor  28.21 
 
 		 270 aa  44.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000711854  decreased coverage  0.00000000000000707487 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0554  prophage antirepressor  30.38 
 
 		 269 aa  43.9  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.239939  hitchhiker  0.000124341 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1165  prophage antirepressor  28.41 
 
 		 149 aa  43.5  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4013  BRO domain-containing protein  32.58 
 
 		 284 aa  44.3  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2462  BRO-like protein  22.58 
 
 		 248 aa  43.5  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000468179  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2133  phage antirepressor protein  27.47 
 
 		 244 aa  43.1  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.335904 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0803  prophage antirepressor  22.11 
 
 		 257 aa  43.1  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000145423  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0524  prophage antirepressor  28.12 
 
 		 259 aa  43.5  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.844398  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0797  BRO, N-terminal  22.52 
 
 		 111 aa  42.4  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.651064  hitchhiker  0.00000114436 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0575  prophage antirepressor  28.71 
 
 		 295 aa  42  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>