55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1061 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1061  prophage antirepressor-like protein  100 
 
 		 210 aa  439  9.999999999999999e-123  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000179859  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1080  prophage antirepressor-like protein  86.67 
 
 		 206 aa  380  1e-105  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174443  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1161  hypothetical protein  45.5 
 
 		 193 aa  151  7e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00000000330342  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2178  hypothetical protein  47.66 
 
 		 187 aa  113  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0897707 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1058  BRO domain-containing protein  48.15 
 
 		 225 aa  105  6e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1645  prophage antirepressor  49.09 
 
 		 294 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4931  prophage antirepressor-like protein  42.99 
 
 		 353 aa  99.8  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0323  hypothetical protein  37.84 
 
 		 208 aa  99  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.161575  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0652  gp30  44.55 
 
 		 212 aa  98.2  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0371314  hitchhiker  0.0000154147 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2212  hypothetical protein  38.24 
 
 		 216 aa  93.6  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.803951  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1415  prophage antirepressor  41.51 
 
 		 221 aa  92.8  3e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000182946  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1182  hypothetical protein  69.57 
 
 		 128 aa  71.2  0.000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00000000219154  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1184  hypothetical protein  69.57 
 
 		 128 aa  70.1  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000553912  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1185  hypothetical protein  79.49 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00257658  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1183  hypothetical protein  79.49 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00000193226  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1181  prophage antirepressor  30.77 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000354678  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1000  BRO family protein  26.92 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.173667  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0803  prophage antirepressor  31.06 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000145423  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0554  prophage antirepressor  35.77 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.239939  hitchhiker  0.000124341 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4209  prophage antirepressor  27.7 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000536971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3440  prophage antirepressor  30.7 
 
 		 285 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000105678  unclonable  9.66468e-17 
 
 
-
 
NC_013208  Aaci_3150  prophage antirepressor  33.05 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1073  BRO family protein  28.81 
 
 		 313 aa  52.4  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00174599  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1864  prophage antirepressor  30.4 
 
 		 293 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.886046 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0898  prophage antirepressor  29.2 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.798648  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1118  BRO domain-containing protein  28.95 
 
 		 247 aa  51.2  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.296909  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1235  prophage antirepressor  29.6 
 
 		 263 aa  50.1  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298657  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1867  prophage antirepressor  30.89 
 
 		 272 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000186522  normal  0.142835 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3254  prophage antirepressor  27.97 
 
 		 270 aa  49.3  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000711854  decreased coverage  0.00000000000000707487 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1740  BRO-like protein  34.75 
 
 		 254 aa  49.3  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000880579  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2513  BRO, N-terminal  33.33 
 
 		 172 aa  48.9  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0512852  normal  0.446294 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2642  hypothetical protein  29.41 
 
 		 252 aa  48.5  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.226633  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1874  prophage antirepressor  25.4 
 
 		 299 aa  48.5  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000268327  normal  0.0527213 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1142  phage antirepressor protein  25 
 
 		 267 aa  48.1  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000418777  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1644  BRO domain-containing protein  30.97 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0834656  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3521  BRO, N-terminal  32.5 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000239324  decreased coverage  0.000343043 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1804  prophage antirepressor  28.83 
 
 		 244 aa  46.6  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2795  prophage antirepressor-like  31.13 
 
 		 197 aa  45.8  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a013  putative antirepressor, BRO family  26.77 
 
 		 183 aa  45.4  0.0005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0524  prophage antirepressor  34.19 
 
 		 259 aa  45.4  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.844398  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1060  prophage antirepressor  30.36 
 
 		 262 aa  45.4  0.0006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000214143  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3400  prophage antirepressor  30.23 
 
 		 284 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000183753  unclonable  1.97476e-16 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1741  prophage antirepressor-like  30.19 
 
 		 184 aa  45.4  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.729676  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0575  prophage antirepressor  30.51 
 
 		 295 aa  44.3  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4120  prophage antirepressor  27.94 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0152271  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2380  BRO domain-containing protein  29.06 
 
 		 335 aa  44.3  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.016925  normal  0.26363 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0789  BRO, N-terminal  29.63 
 
 		 172 aa  44.3  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000825833 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1555  antirepressor protein  27.35 
 
 		 292 aa  43.5  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0345805  hitchhiker  0.000277946 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2475  prophage antirepressor  29.82 
 
 		 261 aa  43.5  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000554878  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1649  BRO-like protein  30.58 
 
 		 265 aa  43.5  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000543299  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3227  prophage antirepressor  30 
 
 		 252 aa  43.1  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.323772  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2462  BRO-like protein  25.41 
 
 		 248 aa  42.7  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000468179  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1367  prophage antirepressor  31.15 
 
 		 264 aa  42.7  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000214644  unclonable  1.53039e-25 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0930  BRO domain-containing protein  27.73 
 
 		 243 aa  42  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0480253  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1877  prophage LambdaSa2, antirepressor protein, putative  24.56 
 
 		 236 aa  41.6  0.008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0256664  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>