24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1645 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1645  prophage antirepressor  100 
 
 
294 aa  601  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1415  prophage antirepressor  51.35 
 
 
221 aa  126  3e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000182946  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1058  BRO domain-containing protein  48.7 
 
 
225 aa  125  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2178  hypothetical protein  46.3 
 
 
187 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0897707 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1080  prophage antirepressor-like protein  51.92 
 
 
206 aa  103  4e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174443  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1061  prophage antirepressor-like protein  49.09 
 
 
210 aa  103  4e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000179859  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0652  gp30  30 
 
 
212 aa  96.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0371314  hitchhiker  0.0000154147 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4931  prophage antirepressor-like protein  43.52 
 
 
353 aa  95.5  8e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0323  hypothetical protein  30.89 
 
 
208 aa  92  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.161575  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2212  hypothetical protein  38.32 
 
 
216 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.803951  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1118  BRO domain-containing protein  35.79 
 
 
247 aa  57.4  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.296909  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1060  prophage antirepressor  35.24 
 
 
262 aa  53.9  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000214143  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1804  prophage antirepressor  36.36 
 
 
244 aa  52.4  0.000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3698  prophage antirepressor  31.87 
 
 
120 aa  48.9  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.206352 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1877  prophage LambdaSa2, antirepressor protein, putative  31.63 
 
 
236 aa  48.1  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0256664  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1161  hypothetical protein  31.68 
 
 
193 aa  46.2  0.0006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00000000330342  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4209  prophage antirepressor  25 
 
 
246 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000536971  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0803  prophage antirepressor  28.26 
 
 
257 aa  45.4  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000145423  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1000  BRO family protein  33.33 
 
 
211 aa  44.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.173667  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1165  prophage antirepressor  32.58 
 
 
149 aa  44.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1644  BRO domain-containing protein  28 
 
 
239 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0834656  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1825  prophage antirepressor  31.43 
 
 
535 aa  44.3  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1205  prophage antirepressor  31.43 
 
 
535 aa  44.3  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.312147  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3254  prophage antirepressor  28.87 
 
 
270 aa  43.1  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000711854  decreased coverage  0.00000000000000707487 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>