42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2833 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2833  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  341  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.977223  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33290  hypothetical protein  83.53 
 
 		 251 aa  290  5e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00174462  normal  0.221973 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1040  hypothetical protein  35.37 
 
 		 170 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1652  hypothetical protein  37.5 
 
 		 191 aa  94.4  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215639  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3726  hypothetical protein  36.81 
 
 		 191 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3820  hypothetical protein  34.32 
 
 		 181 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391965 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49500  hypothetical protein  37.43 
 
 		 184 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000177569  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3096  hypothetical protein  33.76 
 
 		 214 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.880364  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4296  BRO-like  35.34 
 
 		 176 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.836622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3740  prophage antirepressor  29 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3791  prophage antirepressor  29 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1322  prophage antirepressor  27.93 
 
 		 236 aa  60.8  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000035001  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3521  BRO, N-terminal  30.09 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000239324  decreased coverage  0.000343043 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1235  prophage antirepressor  28.12 
 
 		 263 aa  57.8  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298657  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2380  BRO domain-containing protein  27.27 
 
 		 335 aa  56.6  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.016925  normal  0.26363 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2462  BRO-like protein  23.53 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000468179  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4230  hypothetical protein  41.82 
 
 		 64 aa  52  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0575  prophage antirepressor  32.67 
 
 		 295 aa  52  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1644  BRO domain-containing protein  33.33 
 
 		 239 aa  50.8  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0834656  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2133  phage antirepressor protein  26.55 
 
 		 244 aa  50.8  0.000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.335904 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1874  prophage antirepressor  24.79 
 
 		 299 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000268327  normal  0.0527213 
 
 
-
 
NC_013208  Aaci_3150  prophage antirepressor  25.81 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2642  hypothetical protein  30.19 
 
 		 252 aa  48.9  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.226633  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5813  prophage antirepressor  24.72 
 
 		 256 aa  48.9  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2135  phage-encoded protein  27.84 
 
 		 260 aa  48.5  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000332219  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1161  hypothetical protein  30.21 
 
 		 193 aa  48.5  0.00005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00000000330342  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4013  BRO domain-containing protein  26.53 
 
 		 284 aa  48.1  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1367  prophage antirepressor  25.56 
 
 		 264 aa  47.8  0.00008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000214644  unclonable  1.53039e-25 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3254  prophage antirepressor  27.27 
 
 		 270 aa  47  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000711854  decreased coverage  0.00000000000000707487 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1877  prophage LambdaSa2, antirepressor protein, putative  24.44 
 
 		 236 aa  47  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0256664  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1000  BRO family protein  31.87 
 
 		 211 aa  46.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.173667  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4227  hypothetical protein  35.51 
 
 		 122 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2342  Prophage antirepressor protein  29.09 
 
 		 263 aa  45.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0789  BRO, N-terminal  31.46 
 
 		 172 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000825833 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3400  prophage antirepressor  28.72 
 
 		 284 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000183753  unclonable  1.97476e-16 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0803  prophage antirepressor  22.22 
 
 		 257 aa  44.7  0.0007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000145423  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2513  BRO, N-terminal  31.46 
 
 		 172 aa  44.7  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0512852  normal  0.446294 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1714  BRO family protein, truncation  24.05 
 
 		 101 aa  44.3  0.0009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.109606  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0797  BRO, N-terminal  27.84 
 
 		 111 aa  43.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.651064  hitchhiker  0.00000114436 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1555  antirepressor protein  29.79 
 
 		 292 aa  42.4  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0345805  hitchhiker  0.000277946 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3073  prophage antirepressor  30.36 
 
 		 270 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.229766  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1867  prophage antirepressor  19.38 
 
 		 272 aa  41.6  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000186522  normal  0.142835 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>