99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2135 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_2135  phage-encoded protein  100 
 
 		 260 aa  532  1e-150  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000332219  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1142  phage antirepressor protein  50.58 
 
 		 267 aa  250  2e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000418777  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0803  prophage antirepressor  52.14 
 
 		 257 aa  245  6e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000145423  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2133  phage antirepressor protein  42.02 
 
 		 244 aa  200  1.9999999999999998e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.335904 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1680  phage-encoded protein  63.89 
 
 		 239 aa  156  4e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1367  prophage antirepressor  36.25 
 
 		 264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000214644  unclonable  1.53039e-25 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2050  phage antirepressor protein  55.46 
 
 		 249 aa  143  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.016924  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2087  phage antirepressor protein  55.46 
 
 		 249 aa  143  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000258428  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0321  phage antirepressor protein  55.46 
 
 		 250 aa  143  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0409481  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0312  phage antirepressor protein  55.46 
 
 		 250 aa  143  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000635944  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3740  prophage antirepressor  34.39 
 
 		 283 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3791  prophage antirepressor  34.39 
 
 		 283 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5813  prophage antirepressor  33.33 
 
 		 256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2462  BRO-like protein  34.65 
 
 		 248 aa  132  5e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000468179  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4013  BRO domain-containing protein  31.54 
 
 		 284 aa  123  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1874  prophage antirepressor  35.37 
 
 		 299 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000268327  normal  0.0527213 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0524  prophage antirepressor  33.73 
 
 		 259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.844398  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1235  prophage antirepressor  34.87 
 
 		 263 aa  113  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298657  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1877  prophage LambdaSa2, antirepressor protein, putative  49.58 
 
 		 236 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0256664  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0879  phage antirepressor protein  50.94 
 
 		 257 aa  112  5e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00137369  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3073  prophage antirepressor  29.67 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.229766  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1644  BRO domain-containing protein  33.94 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0834656  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1804  prophage antirepressor  33.33 
 
 		 244 aa  100  3e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2642  hypothetical protein  47.11 
 
 		 252 aa  97.8  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.226633  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0554  prophage antirepressor  30.77 
 
 		 269 aa  97.1  2e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.239939  hitchhiker  0.000124341 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1161  hypothetical protein  41.28 
 
 		 193 aa  95.5  8e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00000000330342  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1864  prophage antirepressor  31.8 
 
 		 293 aa  95.1  9e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.886046 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3254  prophage antirepressor  37.9 
 
 		 270 aa  91.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000711854  decreased coverage  0.00000000000000707487 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0575  prophage antirepressor  38.66 
 
 		 295 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1177  hypothetical protein  40.68 
 
 		 420 aa  91.7  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.163274  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0898  prophage antirepressor  42.06 
 
 		 217 aa  90.5  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.798648  n/a   
 
 
-
 
NC_013208  Aaci_3150  prophage antirepressor  32.34 
 
 		 206 aa  89.7  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3400  prophage antirepressor  41.53 
 
 		 284 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000183753  unclonable  1.97476e-16 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3227  prophage antirepressor  42.74 
 
 		 252 aa  87  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.323772  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1867  prophage antirepressor  39.5 
 
 		 272 aa  84  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000186522  normal  0.142835 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1118  BRO domain-containing protein  38.6 
 
 		 247 aa  84  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.296909  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1825  prophage antirepressor  38.98 
 
 		 535 aa  84  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1205  prophage antirepressor  38.98 
 
 		 535 aa  84  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.312147  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3521  BRO, N-terminal  38.05 
 
 		 199 aa  84  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000239324  decreased coverage  0.000343043 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1555  antirepressor protein  36.97 
 
 		 292 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0345805  hitchhiker  0.000277946 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0797  BRO, N-terminal  40.91 
 
 		 111 aa  82.4  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.651064  hitchhiker  0.00000114436 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2380  BRO domain-containing protein  32.24 
 
 		 335 aa  82  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.016925  normal  0.26363 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3440  prophage antirepressor  35.29 
 
 		 285 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000105678  unclonable  9.66468e-17 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1060  prophage antirepressor  38.66 
 
 		 262 aa  77.8  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000214143  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1112  DNA-binding protein Roi  42.48 
 
 		 247 aa  77.8  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000052914  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0306  DNA-binding protein Roi  42.48 
 
 		 247 aa  77.8  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000394975  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1740  BRO-like protein  34.29 
 
 		 254 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000880579  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1181  prophage antirepressor  37.61 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000354678  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1000  BRO family protein  44.04 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.173667  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1322  prophage antirepressor  37.07 
 
 		 236 aa  74.7  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000035001  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1315  prophage antirepressor  30.27 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.930298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2185  putative antirepressor protein encoded by prophage CP-933N  34.78 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0690247  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0789  BRO, N-terminal  33.04 
 
 		 172 aa  73.2  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000825833 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1649  BRO-like protein  29.35 
 
 		 265 aa  72.8  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000543299  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1083  BRO family protein  36.36 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100944  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1741  prophage antirepressor-like  36.13 
 
 		 184 aa  72  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.729676  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2795  prophage antirepressor-like  37.82 
 
 		 197 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1435  DNA-binding protein Roi  40.65 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2513  BRO, N-terminal  38.83 
 
 		 172 aa  70.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0512852  normal  0.446294 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1073  BRO family protein  35.16 
 
 		 313 aa  70.5  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00174599  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2402  prophage antirepressor  36.52 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2342  Prophage antirepressor protein  30.37 
 
 		 263 aa  67  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1714  BRO family protein, truncation  40.23 
 
 		 101 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.109606  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2475  prophage antirepressor  29.56 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000554878  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0258  BRO family protein  33.88 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0278  BRO family protein  33.88 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000343854  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1616  hypothetical protein  29.03 
 
 		 151 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0345712  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3542  DNA-binding protein Roi  34.75 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.206304  hitchhiker  0.00000000735314 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1165  prophage antirepressor  32.65 
 
 		 149 aa  60.5  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0647  phage-encoded protein  30.56 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000047659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0585  hypothetical protein  30.56 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000374128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3726  hypothetical protein  26.92 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1398  prophage antirepressor  29.66 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.178309  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3698  prophage antirepressor  33.67 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.206352 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2913  Roi protein  33.33 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00203388  hitchhiker  0.00000000000553867 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0225  prophage antirepressor  31.43 
 
 		 180 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.285205  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3107  prophage antirepressor  37.38 
 
 		 153 aa  55.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0568  prophage antirepressor  37.38 
 
 		 153 aa  55.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.762577  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33290  hypothetical protein  23.27 
 
 		 251 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00174462  normal  0.221973 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3087  prophage antirepressor  30.33 
 
 		 317 aa  53.5  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4120  prophage antirepressor  30.84 
 
 		 192 aa  53.9  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0152271  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01961  hypothetical protein  30 
 
 		 222 aa  51.6  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a013  putative antirepressor, BRO family  29.25 
 
 		 183 aa  51.2  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1652  hypothetical protein  24.04 
 
 		 191 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215639  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2805  prophage antirepressor-like  35.44 
 
 		 105 aa  49.3  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0292574  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0139  BRO domain-containing protein  27.94 
 
 		 191 aa  48.5  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.598761  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2833  hypothetical protein  27.84 
 
 		 170 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.977223  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49500  hypothetical protein  27.07 
 
 		 184 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000177569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1040  hypothetical protein  23.81 
 
 		 170 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0871  BRO domain-containing protein  32.94 
 
 		 255 aa  47  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0855  prophage antirepressor  32.94 
 
 		 255 aa  47  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3820  hypothetical protein  26.04 
 
 		 181 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391965 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1080  prophage antirepressor-like protein  26.67 
 
 		 206 aa  46.2  0.0006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174443  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3917  prophage antirepressor  27.36 
 
 		 245 aa  45.8  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0381452  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2504  BRO family protein  35.29 
 
 		 58 aa  45.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.880081 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3096  hypothetical protein  26.88 
 
 		 214 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.880364  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0817  phage regulatory protein, Rha family  33.33 
 
 		 241 aa  43.5  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.426302  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2275  phage antirepressor protein  48.08 
 
 		 256 aa  43.9  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.22995 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1070  AntA/AntB family antirepressor  26.59 
 
 		 247 aa  42  0.01  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>